Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | AE015451 | 2960678 | 2961028 | 351 | 19 [17] | [18] 19 | PP_2590 | Outer membrane ferric siderophore receptor |
CGCCAGCGCGCTTGGGAATCAGGTTGACAATACCGCCCACCGAACCGCCGGGCGGCATGCCGTTAAGCAGCGCCGACGGGCCTTTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAGTCTTTGTTGCCCAGCAGGCCCACCCGCCCGCCGGTGGCCACCTGGC > AE015451/2960471‑2960857 | cGCCAGCGCGCTTGGGAATCAGGTTGACAATACCGCCCACCGAACCGCCGGGCGGCATGCCGTTAAGCAGCGCCGACGGGCCTTTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCgg > 1:831885/1‑219 (MQ=255) cGCCCCCCGAACCGCCGGGCGGCATGCCGTTAAGCAGCGCCGACGGGCCTTTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGc < 2:267393/174‑1 (MQ=255) gAACCGCCGGGCGGCATGCCGTTAAGCAGCGCCGACGGGCCTTTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTggcggc < 1:73021/215‑1 (MQ=255) cgccgGGCGGCATGCCGTTAAGCAGCGCCGACGGGCCTTTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGcc > 1:418192/1‑236 (MQ=255) ccGACGGGCCTTGGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCgg < 2:971448/195‑1 (MQ=255) ggACGGGCCTGTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCg < 1:1089556/153‑1 (MQ=255) cTTTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGc < 1:889959/199‑1 (MQ=255) gAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTg < 2:1111909/198‑1 (MQ=255) cATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAGt < 1:483190/236‑1 (MQ=255) tGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATaa < 1:92647/123‑1 (MQ=255) tGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATaa > 2:92647/1‑123 (MQ=255) cGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTc > 1:1132240/1‑80 (MQ=255) tCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAGTCTttg < 2:831884/195‑1 (MQ=255) cGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTg < 2:170428/161‑1 (MQ=255) aGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAGTCTTTGTTGCCca < 2:418191/197‑1 (MQ=255) cGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGc < 2:81600/36‑1 (MQ=255) gCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAg > 1:664616/1‑136 (MQ=255) gCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAg < 2:664615/136‑1 (MQ=255) gCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAGTCTTTGTTGCCCAGCAGGCCCACCCGCCCGCCGGTGGCCACCTGgc < 2:1132239/182‑1 (MQ=255) | CGCCAGCGCGCTTGGGAATCAGGTTGACAATACCGCCCACCGAACCGCCGGGCGGCATGCCGTTAAGCAGCGCCGACGGGCCTTTGAGTACTTCGATGCGTTCGTACATTTCGGGTGAGGCGCGGTAGTAGGGGGCCATGCCGAACAGGCCATCGATAGTCATGTCACTGACGCTGGTCTGGAAGCCGCGGATCGAGTAGTTCTCGCTGTAGGTGCCGGTCAGGCCGTTGCTGAACACTGACGGGTCGGTGGCGGCGATAACGTCGGTGATGTCCCGGGCCTGCAGATCCTGAATGTAGGTGTCGGTGTAGCTGACGGTGCTGAACGGCGTTTCCATGAAGTCTTTGTTGCCCAGCAGGCCCACCCGCCCGCCGGTGGCCACCTGGC > AE015451/2960471‑2960857 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |