Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 213,874 | T→G | 11.0% | T6460T (ACT→ACG) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 213,874 | 0 | T | G | 11.0% | 276.2 / 12.3 | 89 | T6460T (ACT→ACG) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/30); new base G (6/5); total (54/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGACGCGCAAGGCGATGACGTCTA > AE015451/213639‑214107 | ccAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCCACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACt > 1:512509/1‑236 (MQ=255) aacaaAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTc < 1:900236/236‑1 (MQ=255) aGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCCGCACTTCGGTCa > 1:323629/1‑236 (MQ=255) acaGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAgg > 1:461787/1‑235 (MQ=255) cATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGa > 1:648783/1‑235 (MQ=255) tGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCTTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGc < 1:318527/236‑1 (MQ=255) agccTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCg < 2:795135/234‑1 (MQ=255) ttCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACcg < 2:391646/202‑1 (MQ=255) tCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGGTCGAGCAACTGACACTCGCCAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGAACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCg > 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gCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCa > 1:509359/1‑236 (MQ=255) gCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGCGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCa > 1:756961/1‑236 (MQ=255) gCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCaa > 2:807434/1‑214 (MQ=255) gACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAAc > 1:739505/1‑213 (MQ=255) ccGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAg > 2:526376/1‑221 (MQ=255) gTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCAcggcc < 2:1006515/234‑1 (MQ=11) gTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCAcggcc < 1:808965/234‑1 (MQ=255) ccGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCTAGTCAAGGTCACCATCAccgcc < 2:574236/222‑1 (MQ=255) cGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCAccgcc > 2:1111095/1‑221 (MQ=255) cGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCAccgcc < 1:1111096/221‑1 (MQ=255) aaCGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGc > 2:674776/1‑233 (MQ=255) aaCGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCga > 1:390105/1‑236 (MQ=255) aaCGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCAACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGc > 1:706958/1‑233 (MQ=255) cGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTc < 1:692095/235‑1 (MQ=255) 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tGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCGGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCAGAGAACGTCAAACCGACCTTCACtgtg > 1:638731/1‑236 (MQ=255) tGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAg > 2:915204/1‑140 (MQ=12) aCTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCCACGAAGGCGACCCGGTCAAGGt > 2:146091/1‑176 (MQ=255) gCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCTACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAAcc < 1:1067803/218‑1 (MQ=255) 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cGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACg < 1:330164/200‑1 (MQ=255) cTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACg > 1:617640/1‑140 (MQ=255) tACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCGACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGa < 2:100852/205‑1 (MQ=255) cGGTACCAACGGCCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCgg < 2:323000/146‑1 (MQ=255) aCCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCg > 2:776400/1‑222 (MQ=255) ccAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTg > 1:142545/1‑236 (MQ=255) cAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAg > 1:649672/1‑166 (MQ=255) cAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGGCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCcagaca > 2:284369/1‑182 (MQ=255) cAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACGGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGCCCTTCCCTGTGCACGt > 2:1128267/1‑210 (MQ=255) cAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGa > 2:408008/1‑135 (MQ=37) ggccatGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTc < 2:308041/178‑1 (MQ=255) aCCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGGAAc > 2:665347/1‑122 (MQ=255) cTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGc < 2:950410/210‑1 (MQ=255) 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cGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGcc > 1:1096840/1‑235 (MQ=255) tACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAg < 1:1040633/235‑1 (MQ=255) aaGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCGCCAt > 1:586019/1‑235 (MQ=255) aaGGAGCGGACGTTGGCAAGTTAGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTGCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCAcc > 2:213765/1‑116 (MQ=255) 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gACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCACGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGACCGTCAACCCGACCtc > 2:360198/1‑154 (MQ=255) ccGTTGGCAAGTTCGAGCAGCTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTc < 1:157100/142‑1 (MQ=255) cGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGAccc > 2:925521/1‑93 (MQ=255) cGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGAccc < 1:925522/93‑1 (MQ=255) cGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGcc > 2:842607/1‑214 (MQ=255) 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1:1126993/1‑236 (MQ=255) cGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGACGCGCAAGGCg < 1:619488/234‑1 (MQ=255) tCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACCACGCCCAGGTCAc > 2:743441/1‑181 (MQ=255) tCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGt < 2:649671/210‑1 (MQ=255) tCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCac > 1:470678/1‑218 (MQ=39) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |