| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 940,149 | T→C | 6.6% | I1825V (ATT→GTT) | PP_0806 ← | putative Surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 940,149 | 0 | T | C | 6.6% | 206.9 / 2.9 | 60 | I1825V (ATT→GTT) | PP_0806 | putative Surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/23); new base C (2/2); total (35/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
CCGGTTCGGCGCGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTGCGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAG > AE015451/939933‑940368 | ccGGTTCGGCGCGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTc < 1:1064808/235‑1 (MQ=255) gTTCGGCGCGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGATGACGGTGAAGGTGCCACCGGCACCTACCACCACACTGCCGACCAGTGTGCCGTTGGCATCGTg < 1:862911/235‑1 (MQ=11) ggCGCGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCAc > 2:684934/1‑234 (MQ=255) ggCGCGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGACAATc > 2:521471/1‑211 (MQ=255) gcgGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTcc < 1:729893/235‑1 (MQ=255) ggcGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGcc < 2:401549/223‑1 (MQ=255) cggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGcc > 1:619396/1‑235 (MQ=255) ggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGa > 2:1022107/1‑224 (MQ=255) tcggtGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTc < 1:928241/181‑1 (MQ=255) tcggtGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGt > 2:942930/1‑234 (MQ=255) tcggtGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCt > 1:762088/1‑236 (MQ=255) gCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATg > 2:538054/1‑176 (MQ=255) gTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTc > 2:884887/1‑173 (MQ=255) gTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCt > 2:901726/1‑203 (MQ=255) gTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATAc > 1:50919/1‑230 (MQ=255) ctCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCTGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTg < 2:1043286/153‑1 (MQ=255) atCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGa < 2:582143/221‑1 (MQ=255) atCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGa > 1:582144/1‑221 (MQ=255) ggtgATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGCGCCCGCCACCACAGTGCCAAt > 2:920263/1‑132 (MQ=255) gtgATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCca < 1:194817/160‑1 (MQ=255) aTTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGgc > 1:608984/1‑234 (MQ=255) cAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTg > 2:63695/1‑124 (MQ=255) cacCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGt < 1:702255/177‑1 (MQ=255) 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gTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCg > 1:975725/1‑235 (MQ=255) gTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTg < 2:108641/94‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAACCAGCGTGCCGTTg > 1:108641/1‑94 (MQ=255) gcagTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGc < 1:411/154‑1 (MQ=255) gcagTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGc > 2:411/1‑154 (MQ=255) gcagTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCtt < 2:517748/233‑1 (MQ=255) gcagTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTgg > 1:517749/1‑235 (MQ=255) cagTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTggg < 1:870687/235‑1 (MQ=255) tCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGGCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGACCGCCGCCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAg < 2:314554/115‑1 (MQ=255) ccGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGCCGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCt < 1:839730/235‑1 (MQ=255) cGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGGTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCgg > 1:671964/1‑187 (MQ=255) cGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTg > 1:580598/1‑235 (MQ=255) cGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTg > 1:590292/1‑235 (MQ=255) gTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAg < 2:748676/208‑1 (MQ=255) gTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTg < 1:1129882/220‑1 (MQ=255) tGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTg < 1:128583/153‑1 (MQ=255) cGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGCGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGc > 2:157181/1‑132 (MQ=255) gAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAg > 2:705565/1‑183 (MQ=255) gAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGc > 1:1066745/1‑236 (MQ=255) gTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTg > 2:990122/1‑196 (MQ=255) gTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTgcgc > 1:743231/1‑236 (MQ=255) gTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCCGATGCTGCTGCCGTCTTCg > 2:157254/1‑114 (MQ=255) aaGCTACCGTC‑GGGCCCGCCACCACAGTGCCACTCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACGCGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCg < 2:185925/153‑1 (MQ=255) tCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTGCGCGGCTGGGGCGa < 1:313555/235‑1 (MQ=255) cGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCAc > 1:946384/1‑49 (MQ=255) cGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCAc < 2:946383/49‑1 (MQ=255) cGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTGCGCGGCTGGGGCGAg < 1:684935/235‑1 (MQ=255) ggggCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGgcgccggg > 2:202506/1‑132 (MQ=255) ccGCCCCCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCt < 1:297175/186‑1 (MQ=255) gCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTGCGCGGCTGGGGCGAGGTCGATc < 2:743230/234‑1 (MQ=255) ccacAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTGCGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAg > 2:485067/1‑232 (MQ=255) gTGCCAACCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGTACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCGGGGTc > 1:1091071/1‑186 (MQ=9) cAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGGGGAAGCGTTGCCGCTTGggtcggtc > 1:328429/1‑170 (MQ=255) cAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTGCGCGGCTGGGGCGAGGTCGAt > 2:944942/1‑220 (MQ=255) | CCGGTTCGGCGCGGCCGGTGACCACGCTGCCGTCGGCATTGATCACCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATATCCGGTGCGGTGATTTGGGTGGGCAGCGAGGAAACACCGCCGTCATCAATGGCCACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGTCTGGGCCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTACCGTCGGGGCCCGCCACCACAGTGCCAATCAACGTGCCATTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCAGGTGCGGTACCGCTGATGCTGCTGCCGTCTTCGGCGAATACCAGGTCGCTGGGGCTGGCAGGCGCAGTGGTGACCGGGACTTCGAATTGCAGTGCCGAGGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCCGGCTGCGCGGCTGGGGCGAGGTCGATCAG > AE015451/939933‑940368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |