| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 4792906 | 76 (1.060) | 4 (0.060) | 4/332 | NT | 5.4% | coding (934/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) |
| ? | AE015451 | = 4792930 | 69 (1.020) | coding (910/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACGCAGGTGATCGCTCGGCAATTGCAACACGGGGTGGTCGTTGCCCAGATGATCCAACCAGTACTCCAGCTGGCGCGCCTG > AE015451/4792672‑4793134 | ccccGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCCCAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTg < 1:256361/236‑1 (MQ=255) gcTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGa < 1:1187415/235‑1 (MQ=255) cTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTac < 1:538600/221‑1 (MQ=255) cTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTac > 2:538595/1‑221 (MQ=255) caccaGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGc < 2:743974/212‑1 (MQ=255) accaGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTg > 2:1253500/1‑207 (MQ=255) accaGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTg < 1:1253505/207‑1 (MQ=255) cTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAagcggccagt > 1:793024‑M2/1‑225 (MQ=255) gTCGACCGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTg < 2:503679/199‑1 (MQ=255) tgcgcctgcgccGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGcaccac < 2:560683/215‑1 (MQ=255) cgcctgcgccGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTacaac > 2:618036/1‑184 (MQ=255) tgcgccGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCt < 1:1185247/233‑1 (MQ=255) gcgccGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTc > 1:50880/1‑185 (MQ=255) gcgccGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGc > 1:1061763/1‑235 (MQ=255) acaGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGcc < 1:1181267/235‑1 (MQ=255) cTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAgg < 1:1122533/236‑1 (MQ=255) cTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAgg < 1:215770/236‑1 (MQ=255) tttGACCTGGCTCCGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAgg < 1:1179991/235‑1 (MQ=255) aCCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGgc > 1:1070371/1‑232 (MQ=255) tGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAa > 1:624702‑M2/1‑170 (MQ=255) cTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGc < 1:1004974/233‑1 (MQ=255) tCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTacaac > 1:1200432/1‑155 (MQ=255) tCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTacaac < 2:1200427/155‑1 (MQ=255) tCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGgcg > 1:1094806/1‑226 (MQ=255) tCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCt > 1:352394/1‑228 (MQ=255) tCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCaa > 1:443232/1‑235 (MQ=255) tCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGCCTTGAAagcggcca < 1:744519‑M2/174‑9 (MQ=255) gTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTgc < 2:919544/196‑1 (MQ=255) caccacCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGc > 2:1260043/1‑209 (MQ=255) caccCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCACCCGCTCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTg < 1:329662/214‑1 (MQ=255) caccCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTCGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGTCCGCAGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGAtt < 2:1189184/233‑1 (MQ=255) tGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCtt > 2:123680/1‑143 (MQ=255) tCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTggcc < 2:1061758/208‑3 (MQ=255) 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cGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCg > 1:380713/1‑236 (MQ=255) cGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCg > 1:1095114/1‑236 (MQ=255) cGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAACAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTc > 1:800326/1‑235 (MQ=255) gATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCACCCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTg < 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ggttgcggttgGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACGCAGGTGATCGGTCGGCAATTGCAACACGGggtgg > 2:566075/1‑233 (MQ=255) ggttgcggttgGCGACCGGCACGCCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAagcggccagtcgcgggtacgcgtcggtgtgccgatcgccaaccgc > 1:1140600‑M2/1‑73 (MQ=255) gcggttgGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTttcaagaccttgttgtaccgctacagcggccagtcgcgggtacgcgtcggcgtgccggtcgccaaccgcaacc > 1:1140600‑M1/1‑45 (MQ=255) ggCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGc > 1:205859/1‑129 (MQ=255) cGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGGCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACGCAGGTGATCGCTCGGCAATTGCAACACGGGGTGGTCGTTGCCCAGATGATcc < 1:397344/235‑1 (MQ=255) 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ggCCGCTttcaagaccttgttgtaccgctacagcggccagtcgcgggtacgcgtcggtgtgccgatcgccaaccgcaaccgcagtgaagtggaggggctgatcggttgcttcatcaatacccaggtgctgca < 1:479644‑M1/132‑126 (MQ=255) tttcaagaccttgttgtaccgctacagcggccagtcgcgggtacgcgtcggtgtgccgatcgccaaccgcaaccgcagtgaagtggaggggctgatcggttgcttcatcaatacccaggtgctgcagaccgacatcgatccgactcagggtggtgcgcacctgctgagcca > 1:624702‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACGCAGGTGATCGCTCGGCAATTGCAACACGGGGTGGTCGTTGCCCAGATGATCCAACCAGTACTCCAGCTGGCGCGCCTG > AE015451/4792672‑4793134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |