| Predicted mutation | |||||||
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| ? | AE015451 | 5681416 = | 1 (0.010) | intergenic (‑134/+70) | PP_4986/PP_4987 | Channel protein, hemolysin III family/putative Chemotaxis protein | |||||
GGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGC‑‑‑‑GCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGC > AE015451/5681189‑5681640 | ggCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctg < 1:261969‑M1/235‑9 (MQ=255) gCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgca < 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1:782888‑M1/113‑77 (MQ=255) aGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcct > 2:782883‑M1/1‑37 (MQ=255) cGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacgaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctgccag > 2:671057‑M1/1‑35 (MQ=255) gCCCCAGTCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctgccagctccaacctgcccagcgccacat < 2:697945‑M1/232‑200 (MQ=255) ccccAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCcggggctgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccactccagaccaccaggccctgcgcctcacatcctaaccaaggtcaggttgcagatccgcgtcacgcaccagcctttccaatgcgaccaggtccggtacccgcgccacctgctcacccacctgcaccgctgccagctccaacctg < 1:1224386‑M1/218‑187 (MQ=255) 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GGCCCGCGGCCACGATCAGCCAGATGGCACCAATAGCAGCGAGGACGGCACCGACCAGGTGGGTCCAGGCGTTGAAGCGTTCACCGTAATACATGCAAACACAGACCTCCTGAGGTGGGCTGGGTTCCTGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGC‑‑‑‑GCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGCCACATCCACGTAGTTCAGCTGGCTGTCGAGCTTGC > AE015451/5681189‑5681640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |