| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1737987 = | 81 (1.130) | 11 (0.170) | 10/316 | NT | 12.8% | coding (32/348 nt) | yffB | putative glutathione‑dependent thiol reductase |
| ? | AE015451 | = 1777401 | 77 (1.200) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATCGAAGGCCGTC > AE015451/1777170‑1777636 | cTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcagg > 1:286728‑M2/1‑232 (MQ=255) aTCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:1094276‑M2/1‑227 (MQ=255) ttgttTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 1:1146311‑M2/1‑219 (MQ=255) tttCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCACAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTagag < 1:236575/236‑1 (MQ=255) gTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCgtgt < 1:691438/236‑1 (MQ=255) tGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGTAAGGATATCGTTGCGTAAAGCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGAATCTATTGGGGTCGCAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACAGGGCCTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcagg > 2:682723‑M2/1‑208 (MQ=255) tGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAgg < 1:743144/236‑1 (MQ=255) agaATTGTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 2:133036‑M2/1‑206 (MQ=255) gaATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAgg < 2:1235737/233‑1 (MQ=255) atcaagatcaCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCg < 1:954194/216‑1 (MQ=255) aagatcaCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:1028971‑M2/1‑191 (MQ=255) agatcaCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAgg < 1:924395/218‑1 (MQ=255) caCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 1:729589‑M2/1‑186 (MQ=255) caCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt < 2:729584‑M2/202‑17 (MQ=255) cggacggaTCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCa < 1:940554/235‑1 (MQ=255) cggacggaTCTTGGGCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATACGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:27192‑M2/1‑184 (MQ=255) acggaTCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt < 2:954189‑M2/197‑17 (MQ=255) acggaTCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAg > 2:570190/1‑234 (MQ=255) gaTCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGcc > 1:1246472/1‑236 (MQ=255) tcgTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCgtgt < 2:202227/196‑1 (MQ=255) gCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcagg > 2:615683‑M2/1‑167 (MQ=255) gCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCgt < 1:1029621/190‑1 (MQ=255) gAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct < 1:634594‑M2/170‑7 (MQ=255) gAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 2:634589‑M2/1‑164 (MQ=255) gAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGTTTGCAAGTAGCCACAATCTGTCCggt > 1:438140/1‑234 (MQ=255) cTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGCTTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGGAGGACATTGTGTACATTGGGGtt > 1:297805/1‑206 (MQ=255) ggggAAGGATATCGTTGCGGAAAGCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAAtc < 2:348247/220‑1 (MQ=255) atatCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaa > 1:1282625‑M2/1‑149 (MQ=255) tCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGc < 2:1270566/196‑1 (MQ=255) cGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgta < 2:1060276‑M2/162‑18 (MQ=255) cGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCgg > 1:63337/1‑235 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggcttt < 2:457754‑M2/145‑9 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggcttt > 1:457759‑M2/1‑137 (MQ=255) ccAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 2:1066324‑M2/1‑128 (MQ=255) ccAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCAt < 1:20191/160‑1 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGAt > 1:122939/1‑234 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATc > 1:477025/1‑235 (MQ=255) aaaTGCATCCGTAATCACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATcc < 2:728472/234‑1 (MQ=255) gTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGTCGTAGAGCgtgt > 1:1228912/1‑140 (MQ=255) gTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGTCGTAGAGCgtgt < 2:1228907/140‑1 (MQ=255) aaaCACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggatt > 1:1160551‑M2/1‑113 (MQ=255) acacCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGccc < 1:1163518/236‑1 (MQ=255) aTTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGAt > 2:888154/1‑211 (MQ=255) tCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCg < 2:223958/124‑1 (MQ=255) cTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCTCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATc > 1:221788/1‑209 (MQ=255) cTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGcccc < 2:63336/236‑1 (MQ=255) tGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGCCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGGTTTGATGCCGTagag < 2:555014/117‑1 (MQ=255) ggggTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGGCGGTTTAAATTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCa > 2:287663/1‑157 (MQ=255) ggTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCATCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGt > 1:370760/1‑232 (MQ=255) gTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTAtt < 1:777786/236‑1 (MQ=255) gAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctcccc < 2:665034‑M2/162‑73 (MQ=255) gAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCg > 1:1138211/1‑189 (MQ=255) gAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCt > 1:753013/1‑226 (MQ=255) aaaCGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTACAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTg < 2:659600/233‑1 (MQ=255) aCGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGcc < 2:951743/206‑1 (MQ=255) aCGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGt > 1:83250/1‑225 (MQ=255) aCGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAg > 1:851694/1‑236 (MQ=255) cGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCaa < 1:1205588/148‑1 (MQ=255) gAACAAAAACGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGGTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCg > 2:84918/1‑184 (MQ=255) gAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCa < 2:1284863/146‑1 (MQ=255) ggCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTcgcg < 1:674076/164‑1 (MQ=255) ggCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTAtt < 1:897129/218‑1 (MQ=255) cgcAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGt < 2:1047662/211‑1 (MQ=255) ccGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGtt < 1:745988/205‑1 (MQ=255) gtgCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACGTGGCGTCCcaggctgtgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcg > 2:235641‑M2/2‑63 (MQ=255) cgcCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGgcg < 2:408795/191‑1 (MQ=255) cATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcagggtttgatgccgtaaagagtttaagtca > 2:321992‑M2/1‑57 (MQ=255) tatTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcg < 1:288465‑M2/161‑107 (MQ=255) tatTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcg > 2:288461‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGGcc > 1:180885/1‑218 (MQ=255) ttAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttaatgccgt < 2:586567‑M2/63‑17 (MQ=255) ttAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTg < 2:1151411/191‑1 (MQ=255) ttAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCg < 1:841915/210‑1 (MQ=255) aaGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATc < 1:986316/192‑1 (MQ=255) aGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGa > 2:1253247/1‑208 (MQ=255) aGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGAtctc < 1:709736/236‑1 (MQ=255) gCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGtt < 2:1045273/181‑1 (MQ=255) gCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGAtgtg > 2:459768/1‑197 (MQ=255) cATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATc > 1:606625/1‑236 (MQ=255) aTTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct < 1:1025‑M2/42‑7 (MQ=255) aTTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCTCTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGCTCCTcgc > 2:96540/1‑149 (MQ=255) aTTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCgatga < 1:630717/224‑1 (MQ=255) aTTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCgatga > 2:630712/1‑224 (MQ=255) ttAACTGCGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCg < 2:600727/197‑1 (MQ=255) tAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGgcg < 2:377925/164‑1 (MQ=255) gggCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACg > 2:778456/1‑133 (MQ=255) gggCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGt > 1:998999/1‑236 (MQ=255) ggCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCgatga > 1:2607/1‑215 (MQ=255) tttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTgg < 2:554026/199‑1 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTc > 1:451284/1‑181 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTc < 2:451279/181‑1 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCgc > 1:649353/1‑207 (MQ=255) ttAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGc > 1:358256/1‑236 (MQ=255) cGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCtgtg < 1:685823/235‑1 (MQ=255) ggTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCtgt < 2:451607/233‑1 (MQ=255) ggttaaCTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctg > 2:215377‑M2/3‑16 (MQ=255) tttAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGtt < 1:659956/154‑1 (MQ=255) gTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGtt > 2:194974/1‑161 (MQ=255) cccAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCga > 1:837362/1‑187 (MQ=255) ccaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgacatcgatccactcagcgccacggctgtcacggtatagatcggtcatcttggccgaacggtgacccagcagtcgctgtgcatctcgaccttcttcgtcatgtagcctggccgccagggaccgctgctca > 2:774541‑M2/1‑1 (MQ=255) | CTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATCGAAGGCCGTC > AE015451/1777170‑1777636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |