New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2472115 | 56 (0.780) | 16 (0.230) | 14/336 | NT | 26.1% | intergenic (+19/+130) | PP_2166/PP_2167 | Anti‑anti‑sigma factor/putative PhoD‑like phosphatase |
? | AE015451 | 2472313 = | 37 (0.540) | coding (1783/1851 nt) | PP_2167 | putative PhoD‑like phosphatase |
TGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTCGAGCACATCCAGCAAGCGCCGGGGGAACTCGTTCTTGATTCCGCTGCTGGTCACCTGCCACAAGTGCG > AE015451/2472078‑2472543 | tcacggttattgcagtcgatgggcttcgatcaggtgttcaacatcgtcgatcgaccgataccctgcaccgattgcctgaccgacttgccgtcgcaggaccagaatgaagatgtggtgcgctccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccg < 1:688282‑M2/1‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCaaa > 1:700505/1‑225 (MQ=255) gCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCGTGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCt > 1:330436/1‑210 (MQ=255) caagatcgtcgatcgaccgataccctgcaccgattgcctgaccgacttgccgtcgcaggaccagaatgaagatgtggtgcgctccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCgg < 2:1146863‑M2/36‑1 (MQ=255) gaccgataccctgcaccgattgcctgaccgacttgccgtcgcaggaccagaatgaagatgtggtgcgctccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCg > 1:263398‑M2/184‑235 (MQ=255) cgattgcctgaccgacttgccgtcgcaggaccagaatgaagatgtggtgcgctccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCtg < 1:499628‑M2/68‑1 (MQ=255) tGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCtg > 2:1213718/1‑233 (MQ=255) gcCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTtca > 1:1085606/1‑173 (MQ=255) ccAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCa < 1:778918/201‑1 (MQ=255) accgacttgccgtcgcaggaccagaatgaagatgtggtgcgctccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGt < 1:628694‑M2/79‑1 (MQ=255) acCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGcc > 2:1012882/1‑216 (MQ=255) tgtgtCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTgg < 1:1017674/218‑1 (MQ=255) tgtgtCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTgg > 2:1017669/1‑218 (MQ=255) ggaccagaatgaagatgtggtgcgctccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAac > 2:772716‑M2/141‑160 (MQ=255) ggaccagaatgaagatgtggtgcgctccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAac < 1:772721‑M2/20‑1 (MQ=255) ccAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCAtt < 1:948118/179‑1 (MQ=255) cAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCTGCCCTGCtcat > 2:275387/1‑147 (MQ=255) cAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCt > 2:917836/1‑208 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGgcgc > 2:1163843/1‑232 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTgg > 1:1094766/1‑236 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTg < 2:1085601/148‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGc > 2:1019391/1‑189 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑caccac > 2:111189/1‑208 (MQ=255) tttACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCaaaaa > 2:52235/1‑133 (MQ=255) tttACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTAc > 1:308/1‑196 (MQ=255) tccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGctgtc > 2:599158‑M2/116‑184 (MQ=255) tccaaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCa < 2:925734‑M2/118‑1 (MQ=255) caaggtgctggaggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCt > 2:1267226‑M2/114‑180 (MQ=255) aCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCATAGCCGTTCCCCgg > 1:277915/1‑172 (MQ=255) cgcgAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAgc < 1:603856/234‑1 (MQ=255) gAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGa < 1:1010821/236‑1 (MQ=255) aggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTCAACCAGTTGAGCGGCGAg > 2:1109518‑M2/103‑233 (MQ=255) aggcgcacaagatcctcatgggcctgaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACACCCGTACCCCGGCCTTGCTCTGGCTGGGCGTAcg > 2:81836‑M2/103‑184 (MQ=255) gCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAgcg < 1:1140258/233‑1 (MQ=255) cTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTCCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTgg > 1:447214/1‑200 (MQ=255) aaaaaCTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCAtt < 2:447209/183‑1 (MQ=255) tGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCggcg > 1:390104/1‑213 (MQ=255) gaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTGATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCg > 2:704114‑M2/78‑180 (MQ=255) gaatgactccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCg < 1:704119‑M2/103‑1 (MQ=255) tctcACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCGCCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAgcggc > 2:224545/1‑201 (MQ=255) caaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGGCGAGc > 1:940050‑M2/69‑235 (MQ=255) caaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGGTGAGCGGCGAGCGCGGt > 1:1131477‑M2/69‑205 (MQ=255) tACGCCCGGTTTTTAACCTCTGTAGCCCCCCCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGcc < 2:397016/100‑1 (MQ=255) gTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCCCCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAACCCAGTTGAGCGGCGAg > 2:92939/1‑190 (MQ=255) ccccGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTCGAGCACATCCAGCAAGCGCCgg > 1:878713/1‑221 (MQ=255) ccGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CCCCACCTCCACTTCTcgccgc > 2:122695/1‑141 (MQ=255) ccGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGt < 1:992165/154‑1 (MQ=255) ccGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGt > 2:992160/1‑154 (MQ=255) ccGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTc > 2:1051064/1‑197 (MQ=255) ccGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTc < 1:1051069/197‑1 (MQ=255) aGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAgcggc > 2:1232739/1‑157 (MQ=255) aGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTCGAGCACATCCAGCCAGCGCCGGGGGAACTCGTTCTTGAt > 2:882139/1‑231 (MQ=255) gagctgatctatagcctgtgccggccGCCCCGGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGcc < 2:762333‑M2/159‑1 (MQ=255) gTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAg < 1:747204/148‑1 (MQ=255) cctgtgccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGGCACCACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCa > 2:1119912‑M2/13‑155 (MQ=255) gccggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCCCCGCGCTTGGTAAACCAGTTGCGCGGCGAg > 2:317302‑M2/8‑138 (MQ=255) cggccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTCGAGCACATCCAGCAAGCGCCGGGGGAACTCGTTCTTGATTCCGCTGCTGGTCACCTGCCACAAGTGCg < 1:639474‑M2/231‑1 (MQ=255) gccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTCGAGCACATCCAGCAAGCGCCGGGGGAAc > 2:784633‑M2/4‑194 (MQ=255) gccGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATCCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTACACCAGTTGCGCGGCGAgcgc > 2:45945‑M2/4‑137 (MQ=255) | TGCGCTGGAGCGGAGCTGATCTATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGCCTGCGCCCAAACACCAATGTGTGTCCACCCCCAATCAGGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTGTAAAAACTCTGAATCTCACTACGCCCGGTTTTTAAACTCTGTAGCCTCACCCCCGCCAGCATCCAGCTGGTACACCCGCGCCGGCCGCCCCTGTTCATCAAAAAACACCTGTCCCAGCCCGGCACCATTCCACAGCCGTTCCCCGGCCTTGCTGTGGCTGGGCGTACGCGG‑‑‑CACCACCTCCATTTCTCGGCGCTTGGTAAACCAGTTGAGCGGCGAGCGCGGTGCATACAACCAGCGGTTGAGCCGGTCGAGCACATCCAGCAAGCGCCGGGGGAACTCGTTCTTGATTCCGCTGCTGGTCACCTGCCACAAGTGCG > AE015451/2472078‑2472543 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |