| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3409928 = | 55 (0.770) | 6 (0.090) | 6/340 | NT | 8.3% | intergenic (‑494/‑42) | PP_3022/PP_3024 | Transcriptional regulator, AraC family/conserved protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 3450711 | 80 (1.150) | intergenic (‑125/+258) | PP_5558/PP_3069 | putative transcriptional xre family of phage origin/Outer membrane autotransporter | |||||
CTGAGCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTGCG > AE015451/3450478‑3450940 | ctGAGCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaa > 1:1095035‑M2/1‑234 (MQ=255) tGAGCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTa < 2:1091397‑M2/234‑2 (MQ=255) gAGCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaa > 2:994968‑M2/1‑232 (MQ=255) aGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTAc > 1:412982/1‑235 (MQ=255) tttCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATc < 2:33589/203‑1 (MQ=255) ggATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggt < 1:1146405/236‑1 (MQ=255) cttcttCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTag > 1:459227/1‑236 (MQ=255) tcttcCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGc > 2:120986/1‑212 (MQ=255) gcttcCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGcc < 2:858751/186‑1 (MQ=255) ttcCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcg < 2:372164/224‑1 (MQ=255) gtCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGAAGCACCCCGgtgagt > 1:675062/1‑235 (MQ=255) cGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcg < 1:278226‑M2/236‑79 (MQ=255) gAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGtctc < 2:197407/205‑1 (MQ=255) atgatgTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtgagtga < 2:990063/225‑1 (MQ=255) tgTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCg < 1:1017958/183‑1 (MQ=255) tgTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCg > 2:1017953/1‑183 (MQ=255) cGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTgg > 1:327850/1‑231 (MQ=255) cGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGCCGGTAGCAGCACCCCg > 2:385565/1‑206 (MQ=255) aTGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCttt < 2:713011/221‑1 (MQ=255) tCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCATCACCCCgg > 1:305951/1‑192 (MQ=255) tGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTAATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGCGCAGTTCCTTTGGCTGAGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATCGGCGgcc > 1:683785/1‑235 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGTTCTTTAc > 2:338550/1‑134 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtga < 1:64043/181‑1 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCGTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGggcg > 2:885361/1‑231 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTgg > 1:698539/1‑223 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGACCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggtc > 2:696961/1‑162 (MQ=255) cATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgcc > 2:682422/1‑233 (MQ=255) aTGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATGTTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCATCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGggcggc > 2:795271/1‑232 (MQ=255) aTGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCctgctgc > 1:700000/1‑218 (MQ=255) 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gaAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTggat > 2:532916/1‑184 (MQ=255) gaAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTgg > 2:388487/1‑184 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCTCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCATCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTGTTGCta > 1:571042/1‑179 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGc > 1:942526/1‑178 (MQ=255) 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ccATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTCAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCCCGGTCGGTAGCACCAccc > 2:75618/1‑152 (MQ=255) aGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATg < 1:73926/196‑1 (MQ=255) cAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtgagtg < 2:634072/151‑1 (MQ=255) cAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtgagtg > 1:634077/1‑151 (MQ=255) aaTGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt < 2:964379/220‑1 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ggCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTcagccagc > 1:1101811/1‑236 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcattgaatggatatcatgtgaagcttttaaaaaaagactactaccttcggcata < 1:1098245‑M2/235‑179 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTagcagcc > 2:1076767/1‑120 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtgagtg < 2:32386/133‑1 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtgagtg > 1:32387/1‑133 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGgtgt > 2:1131018/1‑155 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGtgttgt > 2:901750/1‑160 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGtgttgt < 1:901755/160‑1 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGcc > 2:1133109/1‑202 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCCTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt < 2:724642/203‑1 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGACGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGATGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt > 1:724647/1‑203 (MQ=255) cTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcatt < 2:627951‑M2/183‑129 (MQ=255) cTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagagacaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcatt > 1:627956‑M2/1‑55 (MQ=255) tAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAAt > 2:228258/1‑168 (MQ=255) tAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgccatag > 2:210334/1‑178 (MQ=255) tAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGccaa > 1:13765/1‑234 (MQ=255) tAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGc > 2:472030/1‑233 (MQ=255) cAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGa > 1:1090127/1‑236 (MQ=255) 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cTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTgcg > 1:736777/1‑235 (MQ=255) tAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATg > 1:972140/1‑200 (MQ=255) ggTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGGATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTgg > 2:161734/1‑151 (MQ=255) | CTGAGCGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATAC‑GGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTGCG > AE015451/3450478‑3450940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |