| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 2,297,033 | C→A | 9.3% | R1030L (CGC→CTC) ‡ | sbcC ← | Exonuclease SbcC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 2,297,033 | 0 | C | A | 9.3% | 167.8 / 11.0 | 54 | R1030L (CGC→CTC) ‡ | sbcC | Exonuclease SbcC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/23); new base A (2/3); total (28/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.99e-02 | |||||||||||
GCACCAGCAGGCCCAGGGCGCTGCCGCCGCGCTTGAGGCGGTAGCGACGGGCCAGCTGACGTAGCTGGGCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCTTTTTCCGCGCCTTGCAAA > AE015451/2296803‑2297239 | gcaccagcaGGCCCAGGGCGCTGCCGCCGCGCTTGAGGCGGTAGCGACGGGCCAGCTGACGTAGCTGGGCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACTCATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGgcggcg > 1:517318/1‑235 (MQ=255) ggCCCAGGGCGCTGCCGCCGCGCTTGAGGCGGTAGCGACGGGCCAGCTGACGTAGCTGGGCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTggc < 1:202494/222‑1 (MQ=255) aGGGCGCTGCCGCCGCGCTTGAGGCGGTAGCGACGGGCCAGCTGACGTAGCTGGGCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATATTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGcc > 2:663945/1‑234 (MQ=255) gACGGGCCAGCTGACGTAGCTGGGCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTc > 1:1234908/1‑235 (MQ=255) aGCTGACGTAGCTGGGCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGc > 1:1022939/1‑236 (MQ=255) gatGACGTAGCTGGGCGTTAGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCAGGCCCAGCGTGGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCCGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGc > 1:793760/3‑235 (MQ=255) gggCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCCGGTCAAGGCTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTgctgct < 1:566223/213‑1 (MQ=255) ggTCAAGGTTATGGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGTGGCGGGCCCAGCGTTTCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTGGTCGGcc < 2:798587/158‑1 (MQ=255) cAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGc > 1:103970/1‑154 (MQ=255) cAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAgg > 2:1203392/1‑233 (MQ=255) ggtGTCGCCTTGGGCGCTCTTGCGGAACACATCCCCGGAGGCCGAGCCGATCAGGGCATTGCGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGgtcgtc < 2:15161/145‑1 (MQ=255) ccTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCgtggt > 1:6472/1‑236 (MQ=255) gCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTc > 2:1110946/1‑233 (MQ=255) ccttgggcgatcttgcggaacacatcaccggaggccgaaccgatcagggcattgaggcgggcccagcgttgccactgctggtgggcctgttcgatttctgccgccagcaGGCC‑‑CACCAGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGgc < 1:715182‑M2/46‑1 (MQ=255) ccttgggcgatcttgcggaacacatcaccggaggccgaaccgatcagggcattgaggcgggcccagcgttgccactgctggtgggcctgttcgatttctgccgccagcaGGCC‑‑CACCAGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGgc > 2:715177‑M2/110‑155 (MQ=255) cGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACg > 1:470795/1‑236 (MQ=255) gCGGAACACATCACCGGAGTCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGc < 1:33948/202‑1 (MQ=255) aCCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAg > 2:655417/1‑184 (MQ=255) cGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTc < 2:490639/166‑1 (MQ=255) ccGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCgg < 1:1207584/171‑1 (MQ=255) gAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGTCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGgc > 1:1140144/1‑235 (MQ=255) cGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGc > 2:476028/1‑145 (MQ=255) cGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGt > 1:1217802/1‑236 (MQ=255) cAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGGGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGGCGGCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATtgc > 1:233719/1‑127 (MQ=255) aGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAg > 2:822891/1‑224 (MQ=255) tGAGGCGGGCCCCGCGTTGCCGCTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGcc < 2:229315/134‑1 (MQ=255) tGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTg > 1:88118/1‑235 (MQ=255) ggCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAggg > 2:1063222/1‑168 (MQ=255) ggCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAggg < 1:1063227/168‑1 (MQ=255) ggCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGAt > 1:1025622/1‑207 (MQ=255) cGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGGCTGGTCGATTTCTGCCGCCCGCGCCTGGTGGGCCTGCTggcggc > 2:138218/1‑73 (MQ=255) aggcgggcccagcgttgccactgctggtgggcctgttcgatttctgccgccagcaGGCC‑‑CACCAGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCATCAcgcg < 1:349259‑M2/181‑1 (MQ=255) ggcgggcccagcgttgccactgctggtgggcctgttcgatttctgccgccagcaGGCC‑‑CACCAGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCgt < 2:1136656‑M2/115‑1 (MQ=255) ggcgggcccagcgttgccactgctggtgggcctgttcgatttctgccgccagcaGGCC‑‑CACCAGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCgt > 1:1136661‑M2/55‑169 (MQ=255) ccAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGGGgtgt > 2:990052/1‑176 (MQ=255) cAGCGTTGCCACTGCTGGGTGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCGGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTca < 2:1082890/216‑2 (MQ=255) cGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCt < 2:585740/151‑1 (MQ=255) cGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGAcc < 2:384529/165‑1 (MQ=255) aCTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCt > 1:470298/1‑234 (MQ=255) tgctgGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCgtggt < 2:316417/161‑1 (MQ=255) ctgGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAg < 2:6472/192‑1 (MQ=255) gggCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCtttt > 1:615940/1‑236 (MQ=255) ggCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCtt > 2:1247845/1‑233 (MQ=255) gTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCTTTTTCcgcg > 1:858434/1‑236 (MQ=255) gATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGt < 2:1124318/153‑1 (MQ=255) gATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCTGTTTCCGCGCCtt > 1:1011250/1‑236 (MQ=255) aTTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGcc > 2:444776/1‑51 (MQ=255) aTTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGcc < 1:444781/51‑1 (MQ=255) tCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCtt < 2:985653/130‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCgcgc < 2:1228709/184‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCGGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCTTTTTCCGCGCCTTGCaaa < 1:893052/235‑1 (MQ=255) ccgccAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCGCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAg < 2:978917/110‑1 (MQ=255) gccAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATgg > 1:235869/1‑211 (MQ=255) aGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCcgcg < 1:87492/153‑1 (MQ=255) cgcCTGGTGGGCCTGGTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGTCGCATGGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGAtg < 2:152854/156‑1 (MQ=255) cgcCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGGCGGCCTGTTGTGCACGCAATGCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGt < 2:351468/169‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCTTTTTCCGCGCCTTGCaaa < 2:588705/216‑1 (MQ=255) | GCACCAGCAGGCCCAGGGCGCTGCCGCCGCGCTTGAGGCGGTAGCGACGGGCCAGCTGACGTAGCTGGGCGTTGGCGTGGTGCAGCAGCAGGTCAAGGTTGTAGCCTTGGGCGATCTTGCGGAACACATCACCGGAGGCCGAACCGATCAGGGCATTGAGGCGGGCCCAGCGTTGCCACTGCTGGTGGGCCTGTTCGATTTCTGCCGCCAGCGCCTGGTGGGCCTGCTGGCGGCGCTGGTCGTCGGCCTGTTGTGCACGCAATTCGGCGCATTGCTGCTCGTGGTTTGCCAGGCGTTCGCGCAGTTCGGCCAAGGCTTGCTCCAGGGCTTGGACCGTGGTGTCCACGGTCATCTGTGCCGCGTGATGCTGCAGGCGCTGTTCGCGCTCCTGCAGCAGGACGCGGCCCTGCTCGATGGCTTTTTCCGCGCCTTGCAAA > AE015451/2296803‑2297239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |