| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 4,964,454 | C→T | 100% | D302N (GAC→AAC) | fleQ ← | Transcriptional regulator FleQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 4,964,454 | 0 | C | T | 100.0% | 302.0 / ‑6.8 | 80 | D302N (GAC→AAC) | fleQ | Transcriptional regulator FleQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (40/39); total (41/39) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TACGGGTGCATGATCGCCATGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGG > AE015451/4964225‑4964675 | tACGGGTGCATGATCGCCATGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTcgcg > 1:1096474/1‑236 (MQ=255) cATGATCGCCATGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGc > 1:653029/1‑236 (MQ=255) tGATCGCCATGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCg < 1:1092381/236‑1 (MQ=255) gATCGCCATGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGATATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTAGATAGGGAACACGTTCGGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGACGGTGCCg > 1:794681/1‑235 (MQ=255) cATGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTc > 2:1111524/1‑234 (MQ=255) aTGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGa > 2:778275/1‑235 (MQ=255) gACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGtt < 1:862690/235‑1 (MQ=255) gCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCtt < 2:1119170/232‑1 (MQ=255) cTCGCGTACGTTGCCCGGCCCGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCg < 1:391332/236‑1 (MQ=255) cTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGtt < 2:977947/220‑1 (MQ=255) gcgTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCg > 1:585613/1‑236 (MQ=255) cGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACCCAGCGACATGAGCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCg < 1:154947/228‑1 (MQ=255) gCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCg < 2:1048238/224‑1 (MQ=255) cccGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCgatgat < 1:1029742/236‑1 (MQ=255) ccGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGc < 2:1134020/189‑1 (MQ=255) aGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACg < 1:154073/236‑1 (MQ=255) aGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACg < 1:1111529/236‑1 (MQ=255) gCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTcgcg > 2:219907/1‑174 (MQ=255) gCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGttt > 1:1102377/1‑186 (MQ=255) cGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATgg < 2:248435/182‑1 (MQ=255) cGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCCCAGCga > 1:760367/1‑209 (MQ=255) cATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTtgt < 2:1165338/194‑1 (MQ=255) ggAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCAc < 2:1197507/234‑1 (MQ=255) gAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTTCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGtt < 1:1016469/168‑1 (MQ=255) aaTTGAAGCGAATGGAACCGCGCGTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCgatgat < 2:225377/196‑1 (MQ=255) cGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCg > 2:644032/1‑175 (MQ=255) cccGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTa < 1:458958/210‑1 (MQ=255) ttCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACCCGTTCAGGCGGTAGTCCAGGGTTTCGCGGAACGTGCCGTCCTCg > 2:194699/1‑135 (MQ=255) ttCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAATGTGCCGTCCTCGATCCTGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGatgatg > 1:383783/1‑174 (MQ=255) cATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCt > 1:933890/1‑236 (MQ=255) tGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCt > 2:673490/1‑234 (MQ=255) cgcgAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCtt > 2:184472/1‑140 (MQ=255) cgcgAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCACGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCg > 1:1254899/1‑153 (MQ=255) gcgAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCAc > 2:615573/1‑163 (MQ=255) gcgAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGa < 1:553424/201‑1 (MQ=255) gcgAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGa > 2:553419/1‑201 (MQ=255) gcgAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGAc > 1:1120455/1‑235 (MQ=255) cgACATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGcc < 2:898997/111‑1 (MQ=255) aaaTCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCtt < 1:946093/229‑1 (MQ=255) aaTCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACg > 2:464783/1‑219 (MQ=255) tgcatcaGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAg < 2:453624/187‑1 (MQ=255) atcaGCAAGGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGc < 2:462081/154‑1 (MQ=255) aaCGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAg < 2:957950/180‑1 (MQ=255) ggATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCGCGAAg > 2:190074/1‑176 (MQ=255) gATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTgca > 2:1157441/1‑188 (MQ=255) aTGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtc < 1:1105414/236‑1 (MQ=255) tGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGACGGTACg > 2:297116/1‑178 (MQ=255) tGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACgcagca < 1:1051637/198‑1 (MQ=255) tGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGGTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTGTGGGTCTTGTCGCGACCCACGCGCTCGTCGGCACGCt > 2:181999/1‑180 (MQ=255) cTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcgtc < 1:1284896/235‑1 (MQ=255) ttCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCacac < 2:933885/188‑1 (MQ=255) tCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAg < 1:518631/236‑1 (MQ=255) cACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAgg < 1:464788/235‑1 (MQ=255) aCCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcg > 2:449313/1‑228 (MQ=255) aCCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcg < 1:449318/228‑1 (MQ=255) aCCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGa > 1:1142180/1‑235 (MQ=255) cGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCg > 1:22762/1‑216 (MQ=255) gCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAgg > 1:219561/1‑236 (MQ=255) cACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCAcgc < 2:446035/150‑1 (MQ=255) cACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCAcgc > 1:446040/1‑150 (MQ=255) cACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAg > 1:898832/1‑232 (MQ=255) aCGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGAt > 2:951402/1‑216 (MQ=255) gCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTAccg < 1:1011896/236‑1 (MQ=255) cAGCGGCGCCTTTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTtcg < 1:705666/217‑1 (MQ=255) cgcCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGtt < 1:621900/234‑1 (MQ=255) ccATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCGTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGCTTCGGGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCCTGTCGCCGactcc > 2:986881/1‑204 (MQ=255) gggAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCCACGGCATGTCGCCGTTTTCGTCGAGGAACAGGGCACCGCCGTTGGCCAGTTCGacac > 1:287028/1‑235 (MQ=255) aaCACGTTCAGGCGGTGGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAg < 1:354445/200‑1 (MQ=255) aaCACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCaa > 1:1276420/1‑176 (MQ=255) aaCACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGccgccg > 1:193974/1‑189 (MQ=255) aaCACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGccc < 1:771659/236‑1 (MQ=255) acacGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCg < 1:940437/236‑1 (MQ=255) acGTTCAGGCGGTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCgct > 2:414392/1‑186 (MQ=255) 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ggTAGTACAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTgg > 2:476405/1‑234 (MQ=255) tagtaCAGGTTTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTgg < 2:1142175/232‑1 (MQ=255) aCAGGTTTTCGCGGAAGGCGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTCTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGCttt > 1:283307/1‑174 (MQ=255) | TACGGGTGCATGATCGCCATGCGCTCGACCAGGTTGGCCAGCTCGCGTACGTTGCCCGGCCAGCCGTGACGACACAGCGACATGATCGAGGCGGAATTGAAGCGAATGGAACCGCGCTTCTCGTGCTCCATGCGCGAAATCAGCTCGTTCATCAGCAACGGGATGTCTTCCACCCGCTCACGCAGCGGCGCCATTTCGATAGGGAACACGTTCAGGCGGTAGTACAGGTCTTCGCGGAAGGTGCCGTCCTCGATCATGGTTTCGAGGTTCTTGTGCGTCGCAGCGATGATGCGCACGTCGATGCTTTGGGTCTTGTTGCTACCCACGCGCTCGAAGGTACGCTCCTGCAGCACACGCAGCAGCTTGACCTGCATCGGCAACGGCATGTCGCCGATTTCGTCGAGGAACAGGGTACCGCCGTTGGCCAGTTCGAAACGCCCGGCACGGCTGG > AE015451/4964225‑4964675 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |