| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 6,132,525 | T→C | 17.8% | E443G (GAG→GGG) | copA‑II ← | copper resistance protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 6,132,525 | 0 | T | C | 17.8% | 164.6 / 5.7 | 74 | E443G (GAG→GGG) | copA‑II | copper resistance protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/21); new base C (9/5); total (47/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACTTAGGCGTTGGACTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGAT > AE015451/6132294‑6132735 | aaCTTAGGCGTTGGACTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGc > 1:1116233/1‑236 (MQ=255) cTTAGGCGTTGGACTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGcc < 1:1102551/235‑1 (MQ=255) gCGTTGGACTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCAtttt < 1:572048/235‑1 (MQ=255) cTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCAtct > 2:1197990/1‑217 (MQ=255) cTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCAtct < 1:1197995/217‑1 (MQ=255) cTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGa > 1:790574/1‑234 (MQ=255) gTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCAtct > 1:4823/1‑211 (MQ=255) ctGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCCGCCAtt > 1:406478/1‑236 (MQ=255) gCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCa < 2:559091/196‑1 (MQ=255) cTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCTCAGCCAtttt > 2:1094216/1‑184 (MQ=255) cTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgtg > 2:808963/1‑190 (MQ=255) gcgcCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCgg < 2:961055/184‑1 (MQ=255) ccATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTCTGGTCCATACCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGCTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCCGCCa > 1:849711/1‑156 (MQ=255) aTACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGcc > 1:200005/1‑177 (MQ=255) ttCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGc > 1:964200/1‑203 (MQ=255) ttCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGc > 1:89182/1‑227 (MQ=255) aTGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCgg > 2:638810/1‑166 (MQ=255) tgctgcTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATccc > 1:1104731/1‑235 (MQ=255) gctgctGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTTcc > 1:990094/1‑222 (MQ=255) gctgctGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCAt > 1:431547/1‑168 (MQ=255) gctgctGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAg > 1:653990/1‑236 (MQ=255) gctgctGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGGCg > 2:653780/1‑163 (MQ=255) gtgGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCgg > 2:1170131/1‑158 (MQ=255) tgGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGt > 1:881765/1‑206 (MQ=255) tgGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAttt > 1:386574/1‑235 (MQ=255) atCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGATCCATACCGGTCATGCTGCCCTCGTCCACCCCAGCCAtttt > 2:785859/1‑180 (MQ=14) tCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATcc < 1:960415/217‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGt > 1:679591/1‑234 (MQ=255) ggCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCtgtg < 2:595417/135‑1 (MQ=255) ggCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCAtgctg < 2:63388/154‑1 (MQ=255) aTGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGcc < 2:371516/144‑1 (MQ=255) aTGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCgg > 1:225724/1‑190 (MQ=255) aTGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGc > 1:1172017/1‑199 (MQ=255) aTGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCt > 2:276892/1‑128 (MQ=255) cgccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGTTCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGGCCATCCCAGCCATTTTGCtggg > 1:372025/1‑173 (MQ=255) gccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGcc > 2:1211412/1‑139 (MQ=255) gccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATTCCGGTCATGTTGc > 1:85196/1‑194 (MQ=255) ggTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTc < 1:172654/182‑1 (MQ=255) ggTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCa > 1:265240/1‑198 (MQ=255) ggTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCAGGGTCCATCCCAGCCATTTTTCtg > 1:310372/1‑167 (MQ=255) tCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCTTGGTCCATccc > 2:516754/1‑139 (MQ=255) tCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGc > 1:485216/1‑214 (MQ=255) tGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTc < 1:889716/164‑1 (MQ=255) gCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCg > 2:489365/1‑160 (MQ=255) gCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGCTCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCcgt > 2:79438/1‑149 (MQ=255) ggtGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgt < 2:485211/193‑1 (MQ=255) tCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGc < 1:84048/193‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAtttt > 1:21831/1‑226 (MQ=255) cGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTAATCCATGCCGGCCAtg > 1:25572/1‑104 (MQ=255) ccATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCAtttt < 2:1116228/127‑1 (MQ=255) aTGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCCGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCCTGCTGCCGTGGTCCATCCCCGACCTTTTGCTGTGGTGCATggc > 2:702112/1‑138 (MQ=14) aTGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGCCATGTTGCCGTGGTCCAt > 2:977534/1‑161 (MQ=255) tGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAtttt < 1:937769/172‑1 (MQ=255) gccTTGGTCCATCCCATCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTc < 2:905101/139‑1 (MQ=255) gccTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTc > 2:727396/1‑153 (MQ=255) ggTCCATCCCATCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTcc < 2:458435/149‑1 (MQ=255) cATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGcc < 2:294738/106‑1 (MQ=255) cATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCtgt < 1:817345/164‑1 (MQ=255) aGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAttt > 1:795173/1‑152 (MQ=255) tCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTg > 2:131892/1‑173 (MQ=255) tctgGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGcc < 2:141791/59‑1 (MQ=255) ggTCCATGCCGGCCATGCCGCCGGGGTCCATCGCAGCCATTTTGCTGTGATCCAGGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGc < 2:97611/153‑1 (MQ=255) gTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGc > 2:661810/1‑156 (MQ=255) cATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCTGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCgt > 1:906352/1‑199 (MQ=255) cATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCa > 2:180215/1‑131 (MQ=255) cATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTCGTCCATCCCAGCCAtt > 2:359277/1‑181 (MQ=255) gCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATGCCGGCCCtgtctcttatac > 1:347128/1‑226 (MQ=255) gCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATACCGGCCAtgctg < 2:173629/61‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCCGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCCGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCACACCAg > 2:1038041/1‑123 (MQ=14) cGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCCTTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGATGCCGTGGTCCATcc > 2:302860/1‑120 (MQ=255) ggCCATGCCGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATcc < 2:1096808/167‑1 (MQ=255) gCCATGCCGCCGTGGTCCAACTCACCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCAtttt < 1:493248/80‑1 (MQ=255) cgccgTCGTCCATCCCATCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGc < 2:1197612/139‑1 (MQ=11) gccgTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATcccg > 2:563338/1‑111 (MQ=255) ccgTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGc < 2:849706/85‑1 (MQ=255) cgTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGTTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAtttt < 2:984364/162‑1 (MQ=255) cccATCCCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCAtttt < 2:239014/112‑1 (MQ=255) acctcAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGCCATGtt < 1:276896/180‑1 (MQ=255) | AACTTAGGCGTTGGACTCATAGTCTGCATGTCGACCAAGGGGTTGTTAGTCTCTGAGGCTGGGTGAGACTGCATGGCGCCACCCATACCTTCCATGCTGCTGTGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTATGGTCCATATCGGCCATGCCGCCTTGGTCCATCCCAGCCATCTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGCCGCCGTGGTCCATCTCAGCCATTTTGCTGTGATCCATGCCGGCCATGCTGCCATGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGTCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATGCCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATCCCAGCCATTTTGCTGTGGTCCATACCGGCCATGTTGCCGTGGTCCATGCCGGCCATGCTGCCGTGAT > AE015451/6132294‑6132735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |