New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 776753 | 34 (0.830) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 8.3% | coding (859/966 nt) | PP_0668 | putative Transmembrane sensor |
? | AE015451 | = 776769 | 34 (0.880) | coding (875/966 nt) | PP_0668 | putative Transmembrane sensor |
CAAATGATGGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTCTTCCATGCTGCTTCGCGACTCTGCCTCCGCGCACCGTCATCCGTTGGCCCTGGCCATT > AE015451/776564‑777004 | cAAATGATGGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGc > 1:615978/1‑224 (MQ=255) gatgGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAgcgtgcg < 1:607087/235‑1 (MQ=255) tgtTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGccc < 1:552753/236‑1 (MQ=255) gtTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGccc > 1:538061/1‑235 (MQ=255) cgcgCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATcc > 2:735913/1‑233 (MQ=255) cccATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTAccttgcct > 1:760543/1‑235 (MQ=255) caACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCAt > 1:713945/1‑236 (MQ=255) aGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTc < 2:339615/170‑1 (MQ=255) ccGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGtt < 2:294778/171‑1 (MQ=255) cgcgGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCaa < 1:757406/236‑1 (MQ=255) ggTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAAt > 1:436571/1‑236 (MQ=255) gCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTg > 1:185575/1‑130 (MQ=255) gaggaCATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCCTCCGGGTtg > 2:77479/1‑166 (MQ=255) gaggaCATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTTGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGaa > 1:375825/1‑208 (MQ=255) ggaCATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGAtaccgaccgcacgcaggctgccaatcgctgggtcgatgcccaagtggccatggcgg > 2:651345‑M2/1‑114 (MQ=255) ggaCATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGttt > 2:517036/1‑233 (MQ=255) ggaCATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCGTCCCGTTGCTCGAtaccgaccgcacgcaggctgccaatcgctgggtcgatgcccaagtggccatggcgg < 1:651346‑M2/170‑57 (MQ=255) gaCATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGtttt < 2:436570/233‑1 (MQ=255) cTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGCTACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATc < 2:278026/147‑1 (MQ=255) atgatCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTtggtg < 1:735914/236‑1 (MQ=255) ttACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGAtaccgaccgcacgcaggctgccaatcgctgggtcgatgcccaagtg > 1:238769‑M2/1‑75 (MQ=255) ccACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTTGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAg > 1:494229/1‑235 (MQ=255) ccACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAg > 1:93654/1‑235 (MQ=255) cACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCttt < 2:760542/172‑1 (MQ=255) cACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGa > 1:128554/1‑236 (MQ=255) aCTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGAt > 1:327432/1‑236 (MQ=255) ggCCTCGACCCAGCGAGTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGaaa < 2:93654/227‑1 (MQ=255) cGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCttt > 1:370410/1‑216 (MQ=255) gATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTCTTCCa > 2:332010/1‑224 (MQ=255) aGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCt > 2:490318/1‑171 (MQ=255) aGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCt < 1:490319/171‑1 (MQ=255) aGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTCTTCCATGCTGCTTCGCGACTCTGc > 1:454473/1‑236 (MQ=255) ggtcggtcCCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTg < 2:183606/190‑1 (MQ=255) ggtcggtACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGaaa < 2:494228/195‑1 (MQ=255) ccTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGtttttt > 1:740233/1‑115 (MQ=255) gatGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCCTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCCTACCCTGCCTTGGTGGGTTTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCg < 2:404680/130‑1 (MQ=255) gTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTc < 1:680731/142‑1 (MQ=255) gTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTc > 2:680730/1‑142 (MQ=255) cTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTCTTCCATGCTGCTTCGCGACTCTGCCTCCGCGCACCGTCATCCGTTGGCCCTgg < 1:662244/235‑1 (MQ=255) cTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTATTCCATGCTGCTTc > 1:428690/1‑196 (MQ=255) gcGATCCCGAACGTGCGTTGGCCACGCTCGCGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTCTTCCATGCTGCtt < 2:188768/193‑1 (MQ=255) gATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCtt < 2:371920/139‑1 (MQ=255) gATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCtt > 1:371921/1‑139 (MQ=255) aTACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTCTTCCATGCTGCTTCGCGACTCTGCCTCCGCGCACCGTCATCCGTTGGCCCTGGCCAtt > 1:656539/1‑236 (MQ=255) | CAAATGATGGTGTTCGACGCGCAGCAAGTCGGCGCCCCATCAACTGCACAACGCTTGCGCGAGGATTGGAGCCGCGGTGTGTTGGTGGCGGAGGACATGCCGCTGGTTCAGATGATCGACATTCTGCGCGATTACCGCCATGGCCACTTGGGCATCGACCCAGCGATTGGCAGCCTGCGTGCGGTCGGTACCTTCCCGTTGCTCGATACCGACCGTGCGTTGGCCATGCTCGAGCGTGCGTTGCCCATCCGGGTTGTGCGTACCTTGCCTTGGTGGGTCTCCATCGAGGCGGTCTGAAGTTTTTTCAAAATTCTTTTTCCGGTTTTGCGACGCTCATTCGCTTGGTGGGATGACGCTACTTCATCCTCTTTGCGAAAGGATTCTTCCATGCTGCTTCGCGACTCTGCCTCCGCGCACCGTCATCCGTTGGCCCTGGCCATT > AE015451/776564‑777004 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |