New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1893964 = | 40 (0.980) | 4 (0.100) | 4/318 | NT | 10.7% | coding (90/843 nt) | PP_1699 | 2‑pyrone‑4,6‑dicarboxylic acid hydrolase |
? | AE015451 | 1894002 = | 29 (0.750) | coding (128/843 nt) | PP_1699 | 2‑pyrone‑4,6‑dicarboxylic acid hydrolase |
CTGCCCGAAACCCGTGGCCGCAACCTTGAATCTGCACCTGCGCCGGAAACGGCCGGTGCCGTCGCCAAGTAACCTGAACCTGTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCATGGGGCAAGACATGCCT > AE015451/1893788‑1894231 | ctgccCGAAACCCGTGGCCGCAACCTTGAATCTGCACCTGCGCCGGAAACGGCCGGTGCCGTCGCCAAGTAACCTGAACCTGTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCg > 1:5756/1‑236 (MQ=255) ttccgccaaggtcgcctgctcgacatcccgctccagcatcaccaccccgcgcagttgccctggcacggtctgcaaggcgctgagcaggtagcggttgtcggtacccaggaagctgggctggaccagtacgccatggctgaaaccatgggcccgcagttggcccaggtagtcgcccagcggcgcatcgtagttgggcgcataacgccgctggGCGACt < 2:728345‑M2/6‑1 (MQ=255) cccGCAACCTTGAATCTGCACCTGCGCCGGAAACGGCCGGTGCCGTCGCCAAGTAACCTGAACCTGTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCaa < 1:250348/214‑1 (MQ=255) ttGAATCTGCACCTGCGCCGGAAACGGCCGGTGCCGTCGCCAAGTAACCTGAACCTGTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCggg < 2:5756/213‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGGAAACGGCCGGTGCCGTCGCCAAGTAACCTGAACCTGTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCG‑CAT‑CGTAGTTGGGCGCATAACGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCAt > 2:500445/1‑207 (MQ=255) cgcCGGAAACGGCCGGTGCCGTCGCCAAGTAACCTGAACCTGTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGcc < 2:422236/213‑1 (MQ=255) cctgTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGa > 2:445310/1‑140 (MQ=255) tGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCa > 2:535936/1‑233 (MQ=255) gagaACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATg < 2:681334/155‑1 (MQ=255) gcggttgtcggtacccaggaagctgggctggcccagtacgccatggctgaaaccatgggcccgcggttggcccaggtagtcgcccagcggcgcatcgtagttgggcgcataacgccgctggGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCTATgg < 2:413572‑M2/31‑1 (MQ=255) cATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCtt < 2:603421/183‑1 (MQ=255) cATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCtt > 1:603422/1‑183 (MQ=255) tgtcggtacccaggaagctgggctggaccagtacgccatggctgaaaccatgggcccgcagttggcacaggtaggcgcCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GTGCCGCTGGGCGACTACCTg < 1:192669‑M1/49‑1 (MQ=255) cccGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTACCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCCACt > 1:85480/1‑236 (MQ=255) ccGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTAc > 2:445810/1‑200 (MQ=255) ccGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACt < 1:535937/235‑1 (MQ=255) aCCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCgggg < 1:451055/236‑1 (MQ=255) aCCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCgg < 1:438566/234‑1 (MQ=255) tGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCt < 2:722448/177‑1 (MQ=255) ccATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCt < 2:721308/175‑1 (MQ=255) aTCGACAGCCACGCCCACGGGGTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCg < 2:142065/130‑1 (MQ=255) aGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCg < 2:373899/124‑1 (MQ=255) aCGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTccagccc < 2:369101/134‑1 (MQ=255) cGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGTCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAAc > 1:244963/1‑194 (MQ=255) ccataggcccgcagttggcccaggtagtcgcCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACCGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGGCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGc < 2:413572‑M1/121‑1 (MQ=255) tGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGggcggt > 1:174411/1‑184 (MQ=255) caggtagtcgcccagcggcacatcgtagttgggcgcataacgccgctggGCGCCTACCTGTGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACa < 1:192669‑M2/78‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGAcc > 2:159690/1‑153 (MQ=255) agtcgcCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGaa < 2:728345‑M1/211‑1 (MQ=255) agccagcGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAgggg > 1:43873/1‑236 (MQ=255) agccagcGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAgggg > 1:211420/1‑236 (MQ=255) CAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGGCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAg > 2:244962‑M1/1‑151 (MQ=255) GCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAA‑TGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCt < 1:440435‑M1/236‑1 (MQ=255) CGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCagc < 2:19235‑M1/146‑2 (MQ=255) gcgcatcgtagttgggcgcataacgccgctggGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTccagc < 2:671908‑M2/57‑1 (MQ=255) gcgcCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGGGGCAGGGGGGGACGCCTCAACCt > 1:97315/1‑236 (MQ=255) ccAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCATg < 1:256968/236‑1 (MQ=255) aCTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCAACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCATgggg > 2:386927/1‑236 (MQ=255) tACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCATGGGGCa < 1:697149/236‑1 (MQ=255) tACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCATGGGGCa < 1:677950/236‑1 (MQ=255) g‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGa < 2:485816/195‑1 (MQ=255) gccgctggGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGa > 1:45686‑M2/9‑190 (MQ=255) cgctggGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCa > 1:640621‑M2/7‑219 (MQ=255) gctggGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCATGGGGCAAGACATGCCt > 1:254658‑M2/6‑235 (MQ=255) gGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCt > 1:593499‑M2/2‑64 (MQ=255) gGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCt < 2:593498‑M2/63‑1 (MQ=255) | CTGCCCGAAACCCGTGGCCGCAACCTTGAATCTGCACCTGCGCCGGAAACGGCCGGTGCCGTCGCCAAGTAACCTGAACCTGTTTGTATGAGAACCATGCCCGACGCACCCGCTTTGCACCTGACTGCCATCGACAGCCACGCCCACGTGTTCAGCCGTGGGCTGAACCTGGCCAGCCAGCGGCGTTATGCGCCCAACTACG‑AT‑GCGCCGCTGGGCGACTACCTGGGCCAACTGCGGGCCCATGGTTTCAGCCATGGCGTACTGGTCCAGCCCAGCTTCCTGGGTACCGACAACCGCTACCTGCTCAGCGCCTTGCAGACCGTGCCAGGGCAACTGCGCGGGGTGGTGATGCTGGAGCGGGATGTCGAGCAGGCGACCTTGGCGGAAATGGCCCGATTGGGAGTCAGGGGGGTACGCCTCAACCTCATGGGGCAAGACATGCCT > AE015451/1893788‑1894231 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |