| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | CP009273 | 1,254,388 | IS5 (+) +4 bp | 29.2% | coding (142‑145/279 nt) | ychH → | DUF2583 family putative inner membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009273 | = 270860 | NA (NA) | 11 (0.160) | 11/274 | NT | 21.1% | noncoding (320/1221 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 1254391 | 40 (0.600) | coding (145/279 nt) | ychH | DUF2583 family putative inner membrane protein | |||||
| * | ? | CP009273 | 1254388 = | 40 (0.600) | 22 (0.320) | 20/276 | NT | 34.8% | coding (142/279 nt) | ychH | DUF2583 family putative inner membrane protein |
| ? | CP009273 | 2095230 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
GTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG > CP009273/1254240‑1254537 | gTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCt < 1:425007/150‑1 (MQ=255) aCATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTaa < 2:361058/149‑1 (MQ=255) aCATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTaa < 2:147989/149‑1 (MQ=255) actggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAGt > 2:1095423‑M1/145‑150 (MQ=255) actggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAGt > 2:717931‑M1/145‑150 (MQ=255) ggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAGTAtt < 2:697419‑M1/9‑1 (MQ=255) atGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTAtt > 2:401400/1‑150 (MQ=255) gataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAGTATTTtc < 2:3570‑M1/12‑1 (MQ=255) 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tGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTg < 2:21019/150‑1 (MQ=255) ggTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCg > 1:527804/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCACTGCTAAGCATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGCAGACCGTGATGGCg > 2:834159/1‑150 (MQ=255) attcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGc > 2:474934‑M1/98‑148 (MQ=255) aggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATg > 2:74384‑M1/93‑150 (MQ=255) 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aTGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAAc < 1:34805/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCCTTACTTGGGGGGTCGCCACTATGACAAACGTTTCCGCCGTAGCGATAATCGCCCTCATAGCTaa > 2:80088/1‑149 (MQ=255) gTGCAGTGCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattt < 1:232883‑M2/150‑139 (MQ=255) gTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACaa > 1:1052007/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAaataa < 2:686246/150‑1 (MQ=255) cAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAaataa < 1:709892/150‑1 (MQ=255) gTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATg < 1:941134/150‑1 (MQ=255) gCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgtc > 2:693894‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTAAggaaggtgcgaacaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgt > 1:24390‑M2/1‑5 (MQ=255) cTAAggaaggtgcgagcaagtccctgatatgagatcatgtttgtcatctggagccatagaacagggttcatcatgagtcatcaacttaccttcgccgacagtgaattcagcagtaagcgccgtcagaccagaaaagagattttcttgtcc < 1:960570‑M2/150‑147 (MQ=255) cTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGGCATAGCTAACAAATAATGCAg > 1:76843/1‑150 (MQ=255) | GTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG > CP009273/1254240‑1254537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |