| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 19796 = | NA (NA) | 5 (0.070) | 5/276 | NT | 7.5% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | CP009273 | = 2461501 | 62 (0.900) | coding (168/363 nt) | gtrA | CPS‑53 (KpLE1) prophage; bactoprenol‑linked glucose translocase (flippase) | |||||
AAGTACACCTCTATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTG > CP009273/2461352‑2461650 | aaGTACACCTCTATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTc < 1:183833/150‑1 (MQ=255) gTACACCTCTATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTca > 2:240360/1‑149 (MQ=255) gTACACCTCTATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTca > 1:450679/1‑149 (MQ=255) cacCTCTATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACAt < 1:1017062/149‑1 (MQ=255) ctctATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCaa < 2:387706/150‑1 (MQ=255) tctATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAg > 2:5198/1‑150 (MQ=255) tATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAgg > 2:1193202/1‑149 (MQ=255) tATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAgg > 1:32281/1‑149 (MQ=255) ttGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCAt < 2:739911/150‑1 (MQ=255) ttGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCAt < 1:236213/150‑1 (MQ=255) tgCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACt < 1:1001708/149‑1 (MQ=255) aaCACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAAc < 1:864655/149‑1 (MQ=255) cacCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGAt < 1:245454/150‑1 (MQ=255) cacCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGAt < 1:696037/150‑1 (MQ=255) cacCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGAt < 2:311443/150‑1 (MQ=255) cccTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATgc < 2:676338/150‑1 (MQ=255) ttATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATgcgc > 1:717998/1‑149 (MQ=255) acacTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACAt > 2:750531/1‑150 (MQ=255) cacTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATg > 2:715351/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCt < 2:1007110/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCt < 1:671097/150‑1 (MQ=255) gtggtTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGTAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTatat < 1:1188031/150‑1 (MQ=255) tggtTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa > 2:355344‑M2/1‑107 (MQ=255) tggtTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATg > 1:581331/1‑150 (MQ=255) tggtTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATg < 2:384856/150‑1 (MQ=255) tttGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTgg < 2:409575/149‑1 (MQ=255) gtgtTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTc < 2:1142184/149‑1 (MQ=255) tgtTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCAt > 1:220210/1‑150 (MQ=255) gTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATgggg < 1:5198/149‑1 (MQ=255) tATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgt < 1:10836‑M2/150‑60 (MQ=255) cTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACt > 1:1083715/1‑150 (MQ=255) aTGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACt > 1:975326/1‑148 (MQ=255) tGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTg < 2:1038573/148‑1 (MQ=255) tGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGa < 2:1190195/149‑1 (MQ=255) tGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAg > 2:228188/1‑150 (MQ=255) tGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAg > 1:496493/1‑150 (MQ=255) gTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGt > 1:1004005/1‑150 (MQ=255) tCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGt < 1:750531/149‑1 (MQ=255) gcATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTAc > 2:97223/1‑150 (MQ=255) aCCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGAt < 2:603497/150‑1 (MQ=255) aCCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGAt < 1:715351/150‑1 (MQ=255) cAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATa < 1:240360/150‑1 (MQ=255) aaaCTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGa > 1:817471/1‑147 (MQ=255) aaaCTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAg < 1:397275/150‑1 (MQ=255) cTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATg < 2:1092414/150‑1 (MQ=255) gCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgcgc < 1:523453/149‑1 (MQ=255) cAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt < 1:1119094‑M2/150‑101 (MQ=255) aGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACt > 2:513226/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACtt > 1:94141/1‑150 (MQ=255) gTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc < 1:609364‑M2/149‑103 (MQ=255) tttCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTcc > 2:493770/1‑150 (MQ=255) tttCGTTGGGGCTGTGAACTTTAGCTTCTTCGCGCATGCAACCTTCCAATTCAAGGCATCGTCTAGAACGCTGCGCTACTTGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGACCTGCTGTTTGATGGGCGGCTGATAGATGCGCACTTcc > 2:989054/1‑150 (MQ=255) gTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccg < 2:957356‑M2/150‑109 (MQ=255) gTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTccccc < 2:850515/149‑1 (MQ=255) gtgGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgat > 2:108556/1‑149 (MQ=255) gtgGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgat < 2:407904/149‑1 (MQ=255) tgGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGATTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgatga < 2:32281/150‑1 (MQ=255) ggCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgatga > 1:596038/1‑149 (MQ=255) gCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTg < 1:140286/150‑1 (MQ=255) cTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGt > 2:974260/1‑150 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCAc > 2:29419/1‑150 (MQ=255) aGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCAcc > 1:252638/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCt < 2:991614/150‑1 (MQ=255) cttcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTtct < 2:142917/149‑1 (MQ=255) cgcgAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTcc < 2:273507/148‑1 (MQ=255) cgcgAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCg < 2:1083715/149‑1 (MQ=255) gcgAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGc < 1:1193202/149‑1 (MQ=255) gAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCAt > 1:713065/1‑150 (MQ=255) aTGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCAt > 1:707788/1‑148 (MQ=255) tGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAg > 1:657368/1‑150 (MQ=255) cAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGcc > 2:345819/1‑150 (MQ=255) aTTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGgt < 2:52006/150‑1 (MQ=255) ttCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGgtg > 1:817103/1‑150 (MQ=255) tCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaatt > 2:637357‑M2/1‑2 (MQ=255) tCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaatt < 1:724845‑M2/150‑149 (MQ=255) tCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaat > 2:203121‑M2/1‑2 (MQ=255) cggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattc < 1:664294‑M2/150‑150 (MQ=255) | AAGTACACCTCTATTGGTGTGCTGAACACCCTTATACACTGGGTGGTTTTTGGTGTTTGTATCTATGTCGCGCATACAAACCAAGCTCTTGCAAACTTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTG > CP009273/2461352‑2461650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |