| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 374,648 | Δ1 bp | 30.4% | coding (380/1110 nt) | frmA ← | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 374,648 | 0 | T | . | 30.4% | 186.9 / 80.4 | 69 | coding (380/1110 nt) | frmA | alcohol dehydrogenase class III/glutathione‑dependent formaldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/20); new base . (10/11); total (38/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.77e-03 | |||||||||||
CCGGTGGTCACGCCACAGCCCAGCAGGCAGACGTGTTCATGGTTTGCTTCTGGATTAATTTTTGCCAGAGACACTTCCGCGACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAGGTTTGAC > CP009273/374507‑374796 | tggtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAAc < 2:1335708‑M2/17‑1 (MQ=255) gtcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACg > 2:773716‑M2/132‑150 (MQ=255) tcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACgg > 1:593017‑M2/131‑150 (MQ=255) tcacgccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACgg > 1:168700‑M2/131‑150 (MQ=255) ccacagcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGggtggt > 1:579852‑M2/126‑150 (MQ=255) agcccagcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGt < 2:1242310‑M2/29‑1 (MQ=255) agcaggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTgg > 1:765538‑M2/117‑150 (MQ=255) ggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATc < 1:372632‑M2/38‑1 (MQ=255) ggcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGaaa > 1:544553‑M2/113‑126 (MQ=255) gcagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGaaaa < 2:544553‑M2/15‑1 (MQ=255) cagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAg > 2:1124357‑M2/111‑150 (MQ=255) cagacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAgg > 2:1446074‑M2/111‑150 (MQ=255) agacgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAgg < 2:159712‑M2/41‑1 (MQ=255) acgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGcc < 1:87176‑M2/43‑1 (MQ=255) cgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAATCGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCt < 1:42369‑M2/44‑1 (MQ=255) cgtgttcatggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCt < 1:820000‑M2/44‑1 (MQ=255) catggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTAccc < 2:1219448‑M2/49‑1 (MQ=255) ggtttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTgg > 1:1070627‑M2/98‑150 (MQ=255) tttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGt > 2:655405‑M2/96‑149 (MQ=255) ttgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGtt < 1:655405‑M2/55‑1 (MQ=255) tgcttctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGttt < 1:263797‑M2/56‑1 (MQ=255) ctggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTcgcg < 2:168700‑M2/61‑1 (MQ=255) ggattaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAAcc > 2:1245287‑M2/87‑150 (MQ=255) ttaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGc < 1:442238‑M2/67‑1 (MQ=255) ttaatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGc > 2:989346‑M2/84‑149 (MQ=255) aatttttgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAAccgta < 2:1351891‑M2/68‑3 (MQ=255) tgccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAAcaca > 2:644333‑M2/76‑148 (MQ=255) ccagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAgg > 1:938337‑M2/74‑150 (MQ=255) cagagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGt > 2:1153340‑M2/73‑150 (MQ=255) agagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGtt < 1:773716‑M2/79‑1 (MQ=255) agagacacttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGt > 2:641939‑M2/72‑149 (MQ=255) acttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGtttt < 2:79282‑M2/85‑1 (MQ=255) cttccgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTg < 2:880941‑M2/86‑1 (MQ=255) cgcgactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAg < 1:63081‑M2/90‑1 (MQ=255) gactacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAAc > 1:1074483‑M2/58‑150 (MQ=255) actacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAAc > 1:787167‑M2/57‑149 (MQ=255) ctacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGAc < 2:268163‑M2/95‑1 (MQ=255) tacggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGa > 1:502476‑M2/55‑149 (MQ=255) cggtgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGa > 1:566209‑M2/53‑147 (MQ=255) tgtattcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACt > 1:877978‑M2/50‑150 (MQ=255) ttcactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTca < 1:1010172‑M2/104‑1 (MQ=255) cactgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCacac < 1:779538‑M2/106‑1 (MQ=255) actgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCacac < 2:1070627‑M2/107‑1 (MQ=255) actgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACt > 1:700049‑M2/43‑150 (MQ=255) tgaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcg > 2:674199‑M2/41‑150 (MQ=255) gaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcgc > 1:242569‑M2/40‑150 (MQ=255) gaatgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcgc > 1:1139185‑M2/40‑150 (MQ=255) atgtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTcgccg < 1:1124357‑M2/113‑1 (MQ=255) gtagagcaccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCa > 2:177722‑M2/36‑150 (MQ=255) caccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCcgc > 1:1400433‑M2/30‑150 (MQ=255) accccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCgg > 2:1054602‑M2/29‑150 (MQ=255) ccccatgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCgg > 1:156212‑M2/28‑150 (MQ=255) catgtagtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGgtgt > 1:416885‑M2/25‑149 (MQ=255) tagtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTaaa < 2:1394974‑M2/129‑1 (MQ=255) agtgataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGc > 1:1183613‑M2/20‑150 (MQ=255) agtgataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCg > 2:1182890‑M2/20‑150 (MQ=255) gataaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGa > 1:579522‑M2/17‑150 (MQ=255) ataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGa > 1:105826‑M2/16‑150 (MQ=255) ataaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGa > 1:272052‑M2/16‑150 (MQ=255) taaagcggctgcccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGAt < 2:1359717‑M2/136‑1 (MQ=255) taaagcggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATc < 1:989346‑M2/136‑1 (MQ=255) ggctgcccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATgg < 1:1245287‑M2/142‑1 (MQ=255) cccGCCCGTTG‑AAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGcc < 2:230262‑M2/147‑1 (MQ=255) ccGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGc > 2:1264576‑M2/3‑149 (MQ=255) cGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCa < 1:684330‑M2/149‑1 (MQ=255) gCCCGTTGTAAGAAAAGCGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTCCCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTGTTGCCAGAACGACAGAACACACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAg < 2:593017/150‑1 (MQ=255) cccGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAgg > 2:274969/1‑150 (MQ=255) ccGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAGGt < 2:1074483/150‑1 (MQ=255) tGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAGGTTTGa > 2:1057003/1‑150 (MQ=255) tAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAGGTTTGAc < 1:1153340/149‑1 (MQ=255) | CCGGTGGTCACGCCACAGCCCAGCAGGCAGACGTGTTCATGGTTTGCTTCTGGATTAATTTTTGCCAGAGACACTTCCGCGACTACGGTGTATTCACTGAATGTAGAGCACCCCATGTAGTGATAAAGCGGCTGCCCGTTGTAAGAAAAACGGGTGGTGCCGTCTGGCATCAGGCCTTTACCCTGGGTTTCGCGAACCGCAACACAGAGGTTAGTTTTGCCAGAACGACAGAACTCACACTCGCCGCACTCCGCGGTGTAAAGCGGGATCACATGGTCGCCAGGTTTGAC > CP009273/374507‑374796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |