| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,076,988 | Δ1 bp | 100% | coding (2195/3051 nt) | fdoG ← | formate dehydrogenase‑O, large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,076,988 | 0 | G | . | 100.0% | 1128.8 / NA | 231 | coding (2195/3051 nt) | fdoG | formate dehydrogenase‑O, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (100/131); total (100/131) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
ATACAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTTGTACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGGAA > CP009273/4076843‑4077132 | taCAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGt < 1:1238766/150‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTc < 2:66100/149‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTc < 1:1351695/149‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTc < 2:208489/149‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCa < 2:290107/150‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCa < 1:970978/150‑1 (MQ=255) aGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCAt > 1:732164/1‑150 (MQ=255) aacgcggcgGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATcg < 2:873996/147‑1 (MQ=255) cggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAtt > 1:98781/1‑150 (MQ=255) ggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTg > 2:952326/1‑150 (MQ=255) ttAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTggg < 2:389102/150‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac < 1:1280331/150‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaacg < 2:553175/150‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaacg < 2:582964/150‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac > 1:736668/1‑149 (MQ=255) atgcccatgcccAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCTGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCgaacgaac > 1:329161/1‑149 (MQ=255) atgcccatgcccAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCgaacgaac > 1:928000/1‑149 (MQ=255) cccatgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAg < 2:12741/150‑1 (MQ=255) ccatgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgt > 1:532026/1‑150 (MQ=255) atgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttg < 1:714979/150‑1 (MQ=255) atgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttg < 2:794050/150‑1 (MQ=255) tgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttgt < 2:1342082/150‑1 (MQ=255) tgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttgt < 2:448397/150‑1 (MQ=255) cccagcccagCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGttgttg > 2:46035/1‑150 (MQ=255) ccagcccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTgg > 2:839035/1‑150 (MQ=255) ccagcccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTgg < 2:502366/150‑1 (MQ=255) ccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCttt < 1:811294/150‑1 (MQ=255) cagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTc > 1:1435285/1‑150 (MQ=255) cGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCtt > 2:1129544/1‑149 (MQ=255) cGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTg < 1:825031/150‑1 (MQ=255) ttACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACg < 1:1329821/149‑1 (MQ=255) aCCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGAt < 1:541580/149‑1 (MQ=255) ccGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATaa > 1:499339/1‑150 (MQ=255) cGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAAc > 2:284231/1‑150 (MQ=255) gAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAAcc < 2:1334279/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAAcc < 2:347040/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAAcc < 2:732164/150‑1 (MQ=255) ggCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGc < 1:859256/150‑1 (MQ=255) gCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCa > 1:872118/1‑150 (MQ=255) ccAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCAc > 1:605072/1‑150 (MQ=255) ccAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCAc > 1:1015919/1‑150 (MQ=255) aGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCg < 2:348917/150‑1 (MQ=255) aCGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGt < 1:1147657/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCg > 1:769345/1‑149 (MQ=255) ggCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAGAATCCAGGAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCgg < 1:1214745/149‑1 (MQ=255) ggCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCgg < 1:267434/149‑1 (MQ=255) cGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATc < 1:1446120/150‑1 (MQ=255) gTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCg < 2:403508/150‑1 (MQ=255) gTTATCACGGCGTGCCATCTAGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCg > 2:1188640/1‑150 (MQ=255) aCGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAat < 2:1422266/149‑1 (MQ=255) aCGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAat < 1:438623/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCg < 1:655781/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCg < 1:1248565/150‑1 (MQ=255) 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cATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAgc < 2:130181/150‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAgcg < 1:88762/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCt > 1:239676/1‑149 (MQ=255) gTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGcc < 1:1196813/147‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCtt < 1:579762/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCt < 1:385586/148‑1 (MQ=255) tGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTAcc > 1:428655/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTAcc < 2:928000/149‑1 (MQ=255) ccTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCg < 1:146743/149‑1 (MQ=255) cTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGtt < 2:769345/150‑1 (MQ=255) ccGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTg < 1:1136488/148‑1 (MQ=255) ccGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGct > 1:471874/1‑150 (MQ=255) ccGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGct > 2:849785/1‑150 (MQ=255) cGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGctc < 2:1435285/150‑1 (MQ=255) ggCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGctct < 2:220347/150‑1 (MQ=255) ggCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGctct < 1:1285364/150‑1 (MQ=255) gCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCtctc > 1:393398/1‑150 (MQ=255) cGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCtctc > 2:1029765/1‑149 (MQ=255) cGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCtctc > 2:1097076/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCa > 2:556493/1‑150 (MQ=255) cAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATc < 2:1351182/149‑1 (MQ=255) cAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCg > 2:1387729/1‑150 (MQ=255) cAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCg > 1:175879/1‑150 (MQ=255) aGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGc > 2:1441690/1‑150 (MQ=255) aCCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCAct > 2:524543/1‑150 (MQ=255) ccGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCAct < 1:847688/149‑1 (MQ=255) cGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActtc < 1:135899/150‑1 (MQ=255) ggCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActtct < 2:1158240/150‑1 (MQ=255) gCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActtctt > 1:880430/1‑150 (MQ=255) gCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActtctt > 1:1379369/1‑150 (MQ=255) gAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTtcttct > 1:1041687/1‑150 (MQ=255) gAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTtcttct < 2:14751/150‑1 (MQ=255) gAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTtcttct < 2:1226369/150‑1 (MQ=255) aaaaTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTg < 1:193846/150‑1 (MQ=255) aaTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTg > 1:164480/1‑148 (MQ=255) aTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAg < 1:96212/150‑1 (MQ=255) cagcagCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGAt < 1:46035/149‑1 (MQ=255) agcagcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATgg < 1:786256/150‑1 (MQ=255) ccACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCAt > 1:1294952/1‑150 (MQ=255) ccACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCAt > 2:1074266/1‑150 (MQ=255) cacaGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATg > 1:529982/1‑150 (MQ=255) caGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCg > 1:1068447/1‑150 (MQ=255) | ATACAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTTGTACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGGAA > CP009273/4076843‑4077132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |