| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 416,070 | Δ1 bp | 6.0% | coding (1024/1320 nt) | brnQ → | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 416,070 | 0 | C | . | 6.0% | 223.3 / 8.7 | 67 | coding (1024/1320 nt) | brnQ | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/30); new base . (2/2); total (35/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
AACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCAAAGCATCTGCA > CP009273/415925‑416219 | aaCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGt > 1:244236/1‑150 (MQ=255) aCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTg > 2:189422/1‑150 (MQ=255) aCGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTg > 2:677146/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt < 2:746694/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt < 2:750457/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCt > 1:528755/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTA‑CGGTGCt > 1:108431/1‑149 (MQ=255) cTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATcc > 2:581343/1‑150 (MQ=255) tgCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGTTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTGCCGGTGCTGACCGCTATTTATccgc < 2:91482/149‑1 (MQ=255) cTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCgt > 1:304941/1‑150 (MQ=255) gtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTa > 2:346320/1‑150 (MQ=255) gtgCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTa > 1:919536/1‑150 (MQ=255) cAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCg < 2:453576/150‑1 (MQ=255) gAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCa < 1:826170/150‑1 (MQ=255) aaTTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCAc < 1:713823/150‑1 (MQ=255) aTTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACt > 2:682933/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTA‑CGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGtt > 2:587486/1‑150 (MQ=255) cAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTa < 2:767316/150‑1 (MQ=255) aGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATc > 2:652312/1‑134 (MQ=255) gtacgtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCg < 1:652312/134‑1 (MQ=255) gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGttt > 1:142539/1‑149 (MQ=255) gtacCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGttt > 1:443987/1‑149 (MQ=255) tctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCt > 1:763658/1‑150 (MQ=255) tctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCt > 1:553170/1‑150 (MQ=255) ctctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCt > 1:838299/1‑149 (MQ=255) tctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCa > 1:684293/1‑150 (MQ=255) ctTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAt > 1:967891/1‑150 (MQ=255) aTCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAt < 2:553170/147‑1 (MQ=255) cGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCAtggtgg > 1:83437/1‑150 (MQ=255) gTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTA‑CGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGc < 2:108431/149‑1 (MQ=255) aCGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCa > 1:954908/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATa < 2:36974/150‑1 (MQ=255) gtgtTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAAtt < 2:714402/148‑1 (MQ=255) gtgtTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCg < 2:142539/150‑1 (MQ=255) tttATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTa > 1:543728/1‑85 (MQ=255) ttATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTAt < 2:543728/85‑1 (MQ=255) tCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCcgcg < 2:838299/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTg < 2:231960/150‑1 (MQ=255) ggcggcTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGAtt < 2:181383/150‑1 (MQ=255) ggcTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCt < 1:317762/150‑1 (MQ=255) cTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTcc > 1:738721/1‑150 (MQ=255) cTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTcc > 1:821987/1‑150 (MQ=255) tctcGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTccgc > 2:547735/1‑150 (MQ=255) cGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGa > 2:465635/1‑150 (MQ=255) gtggtTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGtt > 2:61602/1‑149 (MQ=255) tggtTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTa < 2:684293/150‑1 (MQ=255) gtTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTAt > 1:816509/1‑149 (MQ=255) cGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCtttt > 2:276378/1‑150 (MQ=255) ggCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTA‑CGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCttttt < 1:693856/149‑1 (MQ=255) gacTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGATTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCttt < 1:346320/146‑1 (MQ=255) gCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTg < 2:967891/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATtct < 1:864265/150‑1 (MQ=255) ccAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATtct < 2:443987/150‑1 (MQ=255) cAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATtctc < 2:475684/150‑1 (MQ=255) cAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATtctc < 2:108163/150‑1 (MQ=255) cAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATtctc < 2:304941/150‑1 (MQ=255) cTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGAc > 2:375838/1‑150 (MQ=255) cTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGAc < 2:528755/150‑1 (MQ=255) cTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGAc < 1:682933/150‑1 (MQ=255) gATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACgg > 2:252289/1‑150 (MQ=255) aTCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACg < 2:244236/148‑1 (MQ=255) ccAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGAt > 1:140626/1‑150 (MQ=255) aGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCa < 1:677146/150‑1 (MQ=255) aTCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCa > 2:105248/1‑148 (MQ=255) cGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCAAAGCATc > 2:373153/1‑150 (MQ=255) gTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCAAAGCATCt > 2:841565/1‑150 (MQ=255) gTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCAAAGCATCt < 1:293417/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCAAAGCATCTGCa < 1:375838/150‑1 (MQ=255) | AACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGAATTCTTTGCCCAGTACGTACCGCTCTCTTATCGTACGCTGGTGTTTATCCTCGGCGGCTTCTCGATGGTGGTTTCTAACCTCGGCTTAAGCCAGCTGATCCAGATCTCCGTACCGGTGCTGACCGCTATTTATCCGCCGTGTATCGCACTGGTTGTATTAAGTTTTACACGCTCATGGTGGCATAATTCGTCCCGCGTGATTGCTCCGCCGATGTTTATCAGCCTGCTTTTTGGTATTCTCGACGGGATCAAAGCATCTGCA > CP009273/415925‑416219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |