| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,076,988 | Δ1 bp | 100% | coding (2195/3051 nt) | fdoG ← | formate dehydrogenase‑O, large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,076,988 | 0 | G | . | 100.0% | 557.5 / NA | 114 | coding (2195/3051 nt) | fdoG | formate dehydrogenase‑O, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (61/53); total (61/53) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTTGTACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGG > CP009273/4076846‑4077130 | cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCa < 1:537706/150‑1 (MQ=255)cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCa < 2:37844/150‑1 (MQ=255) gAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATc < 1:729310/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATcgc > 1:509646/1‑150 (MQ=255) aTGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATcgc < 1:706989/150‑1 (MQ=255) cggcggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCgcgc > 1:512497/1‑149 (MQ=255) cggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAtt > 1:120740/1‑150 (MQ=255) cggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAtt < 1:752660/150‑1 (MQ=255) cggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAtt < 1:347179/150‑1 (MQ=255) cggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAtt > 1:533799/1‑150 (MQ=255) ttAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTggg < 1:720238/150‑1 (MQ=255) aaGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGc > 1:906610/1‑149 (MQ=255) aGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcg < 2:512497/149‑1 (MQ=255) gCGGCCATGCTCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaa > 2:812523/1‑150 (MQ=255) gCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaa < 2:810990/150‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac < 1:245407/150‑1 (MQ=255) ggCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac > 2:629648/1‑149 (MQ=255) ggCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac > 2:263268/1‑149 (MQ=255) atgcccatgcccAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCgaacgaac > 2:242290/1‑149 (MQ=255) atgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCaa > 1:697445/1‑129 (MQ=255) atgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttg > 1:643469/1‑150 (MQ=255) atgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttg < 2:342045/150‑1 (MQ=255) atgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttg > 1:182674/1‑150 (MQ=255) tgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAt < 2:697445/129‑1 (MQ=255) tgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttgt < 2:889742/150‑1 (MQ=255) tgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttgt > 2:627155/1‑150 (MQ=255) cccagcccagCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAgttgtt < 2:643469/149‑1 (MQ=255) cccagcccagCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGttgttg < 1:498437/150‑1 (MQ=255) ccagcccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTgg > 1:298097/1‑150 (MQ=255) gcccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCt > 1:820474/1‑150 (MQ=255) gcccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCt < 2:990051/150‑1 (MQ=255) ccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCttt > 2:717711/1‑150 (MQ=255) ccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCttt < 2:886334/150‑1 (MQ=255) cagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTc < 2:253972/150‑1 (MQ=255) cagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTc > 1:186786/1‑150 (MQ=255) agcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCt < 1:445884/150‑1 (MQ=255) agcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCt > 2:573015/1‑150 (MQ=255) gcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCtt < 1:717711/150‑1 (MQ=255) cGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTg < 1:307242/150‑1 (MQ=255) gtTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGAc > 1:308431/1‑149 (MQ=255) ttACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACg < 1:629648/149‑1 (MQ=255) aCCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGAt > 2:249093/1‑149 (MQ=255) gAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAAcc < 1:653766/150‑1 (MQ=255) cAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCAcc > 2:817380/1‑150 (MQ=255) aGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCg < 2:523962/150‑1 (MQ=255) gACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCgg < 1:333483/150‑1 (MQ=255) aCGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGt > 1:583856/1‑150 (MQ=255) cGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGtt < 1:79178/150‑1 (MQ=255) cGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGtt < 2:120740/150‑1 (MQ=255) gTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCg > 2:314715/1‑150 (MQ=255) 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cGGCGTACAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGct < 1:519155/149‑1 (MQ=255) ggCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGctct < 2:243900/150‑1 (MQ=255) gCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCtctc < 2:762957/150‑1 (MQ=255) cGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTcc < 1:845102/150‑1 (MQ=255) tCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCAt < 2:381752/150‑1 (MQ=255) cAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATc < 1:190871/149‑1 (MQ=255) cAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCg > 1:92087/1‑150 (MQ=255) gCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTAc > 1:971521/1‑133 (MQ=255) gCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGc > 2:323770/1‑149 (MQ=255) cTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTAcc < 2:971521/133‑1 (MQ=255) aCCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCAct > 1:429590/1‑150 (MQ=255) ccGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActt > 2:414200/1‑150 (MQ=255) ccGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActt > 1:607645/1‑150 (MQ=255) ccGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActt < 2:78696/150‑1 (MQ=255) ccGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCAc < 1:184053/148‑1 (MQ=255) gCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActtctt > 2:893462/1‑150 (MQ=255) gAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTtcttct < 1:298701/150‑1 (MQ=255) gAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTtcttct < 1:405437/150‑1 (MQ=255) aaaaTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTtcttct > 1:162276/1‑149 (MQ=255) aaaaTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTg < 1:987560/150‑1 (MQ=255) aaaTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTg > 2:565717/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTg > 1:584486/1‑147 (MQ=255) cagcagCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACTGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATg > 2:813431/1‑150 (MQ=255) cagcagCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGAt < 1:323770/149‑1 (MQ=255) cagcagCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATg < 1:432767/150‑1 (MQ=255) agcagcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATgg < 1:627155/150‑1 (MQ=255) cagcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCt > 2:135329/1‑150 (MQ=255) gcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCa > 2:445351/1‑150 (MQ=255) ccACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCAt < 2:509646/150‑1 (MQ=255) aggaggTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCg > 2:241806/1‑149 (MQ=255) | CAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTTGTACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGG > CP009273/4076846‑4077130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |