| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4053628 | 147 (2.380) | 7 (0.110) | 7/276 | NT | 4.5% | intergenic (+38/‑179) | typA/yihL | GTP‑binding protein/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | CP009273 | = 4493332 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATA > CP009273/4493184‑4493481 | gaAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTaa > 1:279198/1‑150 (MQ=255) aaGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAAt < 1:493866/150‑1 (MQ=255) aGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATc > 1:22256/1‑150 (MQ=255) gTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCt < 1:42624/150‑1 (MQ=255) tCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCtt > 1:474194/1‑150 (MQ=255) tCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCtt < 2:882498/150‑1 (MQ=255) tCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCtt > 1:994759/1‑150 (MQ=255) aGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTgg > 1:968500/1‑150 (MQ=255) gTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGt > 1:42126/1‑150 (MQ=255) ggTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTc < 2:825908/149‑1 (MQ=255) gTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTg < 2:737414/150‑1 (MQ=255) ttACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctgg < 1:1018019‑M2/148‑12 (MQ=255) aCGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGgtg > 2:809191/1‑150 (MQ=255) gCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGtt < 2:38096/150‑1 (MQ=255) cAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGttt < 1:163842/150‑1 (MQ=255) cAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGttt > 1:855309/1‑150 (MQ=255) gagaATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGGGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCAATAgccatcgctggcaggttttt > 2:233803‑M2/1‑130 (MQ=255) agaATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGt > 2:824242/1‑149 (MQ=255) aaTCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTaa > 1:150282/1‑149 (MQ=255) aaTCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAAc < 1:844363/150‑1 (MQ=255) aTCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAAc > 1:833302/1‑149 (MQ=255) gTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAAc > 2:521168/1‑150 (MQ=255) cGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATc < 2:790049/150‑1 (MQ=255) ggATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAg < 1:47794/150‑1 (MQ=255) aCCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTa > 1:760228/1‑149 (MQ=255) cAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACa > 2:470821/1‑149 (MQ=255) aGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACaaa < 2:1009131/150‑1 (MQ=255) aGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACaa > 2:72012/1‑149 (MQ=255) tCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTG‑TTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAata > 2:1063048/1‑150 (MQ=255) cAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAata > 2:1066704/1‑150 (MQ=255) aaGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAatat < 1:682952/150‑1 (MQ=255) agCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtct < 2:995374‑M2/150‑49 (MQ=255) agCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCt > 1:656397/1‑150 (MQ=255) tCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAAttt < 2:474194/150‑1 (MQ=255) tCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAAttt < 1:175218/150‑1 (MQ=255) tCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAAtt < 2:39648/149‑1 (MQ=255) aaTGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTtgt > 1:286904/1‑149 (MQ=255) tAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAg > 2:582808/1‑149 (MQ=255) aaaTCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACa > 2:249660/1‑149 (MQ=255) aTCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcga < 2:118448‑M2/150‑73 (MQ=255) tCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAAc < 1:521168/150‑1 (MQ=255) ggAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAAcgcg > 1:950457/1‑150 (MQ=255) aaaCAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcg < 1:688292‑M2/150‑79 (MQ=255) aaaCAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGtt > 2:168731/1‑150 (MQ=255) aCAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGtttt < 1:182766/150‑1 (MQ=255) aGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGtt < 1:765432/150‑1 (MQ=255) aGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTAtgt < 1:1018442/150‑1 (MQ=255) tCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGAtt < 1:440961/149‑1 (MQ=255) ccGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtga > 1:118448‑M2/1‑56 (MQ=255) ggATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCtt > 2:705012/1‑150 (MQ=255) gATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTg < 1:317893/150‑1 (MQ=255) aTTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAgccatcgctggcaggttttttatgactaaaaaacgaaattaatcgtctttcggtgcgcggttggcgcggcgacgatcgttttccgtcaggtgacgttt > 2:1018019‑M2/1‑52 (MQ=255) ttCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAAc > 2:440037/1‑124 (MQ=255) tCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAAcg < 1:440037/124‑1 (MQ=255) ttACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGttttt > 1:681145/1‑150 (MQ=255) acaGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGAt < 2:340037/150‑1 (MQ=255) cACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGt < 1:582808/150‑1 (MQ=255) gATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATaa < 2:324596/149‑1 (MQ=255) gATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATaa < 1:582664/149‑1 (MQ=255) aTCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACa < 1:809191/150‑1 (MQ=255) ggTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAgg > 1:617367/1‑149 (MQ=255) cAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGtat > 1:6414/1‑149 (MQ=255) aaCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGtata > 2:454200/1‑149 (MQ=255) aCTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGtata > 2:136152/1‑148 (MQ=255) aTCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGta > 2:811392/1‑150 (MQ=255) tAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGtata > 2:804927/1‑147 (MQ=255) aaCTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACa < 1:470821/148‑1 (MQ=255) aTCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGaaaa < 2:833302/148‑1 (MQ=255) aTCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAg < 2:100838/149‑1 (MQ=255) tCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCa < 2:279198/150‑1 (MQ=255) ggCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCaa < 1:147596/149‑1 (MQ=255) ggCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCa > 2:758515/1‑148 (MQ=255) gCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCa > 2:950024/1‑147 (MQ=255) gCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAg < 2:22256/150‑1 (MQ=255) aTTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGaa < 2:6414/150‑1 (MQ=255) aTTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGa > 1:252322/1‑149 (MQ=255) tAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGaaa > 1:916033/1‑149 (MQ=255) aaTCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAAt < 1:804927/149‑1 (MQ=255) aaTCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATa > 1:782836/1‑150 (MQ=255) | GAAGTCAGTGGGTTACGCAGAGAATCGTAACGGGATACCAGATCAAGAGCCTGTCCAATGTGCATAAAAAAATCCGGAAACAAGTGAGCGTTTCCGGATTCTTACACAGCCACTGGATCGGTCAACTGATCCTTAACTGATCGGCATTAATCTTGGTTCTGGTGTTTGTAACAAACTATCAGCTACAAAAATATGCTCAATTTGTGACATCAGTAACAAAACGCGTTTTGTTATGTGGATTGCTTGTTTTTTGATCTGGTATAACAGGTATAAAGGTATACAGAAAAGCAAAGAAATA > CP009273/4493184‑4493481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |