| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,076,988 | Δ1 bp | 100% | coding (2195/3051 nt) | fdoG ← | formate dehydrogenase‑O, large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,076,988 | 0 | G | . | 100.0% | 596.3 / NA | 123 | coding (2195/3051 nt) | fdoG | formate dehydrogenase‑O, large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (62/61); total (62/61) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TACAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTTGTACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGGAA > CP009273/4076844‑4077132 | taCAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCg < 2:281649/149‑1 (MQ=255) aCAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCCGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGGTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGAT‑TACCGt > 2:748409/1‑149 (MQ=255) aCAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGGGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGt > 2:378119/1‑149 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTc < 1:730307/149‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCa < 1:89231/150‑1 (MQ=255) cAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCa < 1:16015/150‑1 (MQ=255) aGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATTACGGCGTGCCATCTGGGTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCAt > 2:245105/1‑150 (MQ=255) aaTGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATcg < 1:140016/150‑1 (MQ=255) aTGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCCGACGGGTCGGCGTTATCACGGCCTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCCAAAATCCATCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATcgc > 2:952981/1‑150 (MQ=255) cggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAtt < 2:744365/150‑1 (MQ=255) cggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAAtt > 1:251170/1‑150 (MQ=255) ggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTg > 1:967157/1‑150 (MQ=255) ggTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTg < 2:718933/150‑1 (MQ=255) gTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCGGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTgg < 1:170732/150‑1 (MQ=255) aaGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGc > 1:183456/1‑149 (MQ=255) aaGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGc > 1:420771/1‑149 (MQ=255) cGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac < 2:450392/150‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac < 2:944688/150‑1 (MQ=255) cGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaac > 2:266877/1‑150 (MQ=255) ggCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaacg < 2:518360/150‑1 (MQ=255) gCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaacg > 2:563499/1‑149 (MQ=255) gCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaacg > 2:83258/1‑149 (MQ=255) ccatgcccatgcCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGcgaacgaa > 1:1012267/1‑150 (MQ=255) gcccatgcccaGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACt > 1:57498/1‑148 (MQ=255) 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ccagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCttt > 1:104828/1‑150 (MQ=255) cagcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTc > 2:860999/1‑150 (MQ=255) agcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCt > 2:1047098/1‑150 (MQ=255) agcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCt > 1:116504/1‑150 (MQ=255) gcGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCtt > 2:385610/1‑150 (MQ=255) 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ggATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTg > 1:197685/1‑150 (MQ=255) ggATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTg > 1:126097/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCg < 1:378119/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCg > 1:432458/1‑149 (MQ=255) ggCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCgg < 1:506860/149‑1 (MQ=255) ggCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCgg < 1:1055179/149‑1 (MQ=255) gTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCg < 1:829912/150‑1 (MQ=255) ttATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCgg > 2:412849/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGAGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAAAGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAatat < 2:523528/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATc > 2:336959/1‑150 (MQ=255) 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cTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGtt > 2:803350/1‑150 (MQ=255) cTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGtt < 2:666624/150‑1 (MQ=255) cGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGctc < 2:633357/150‑1 (MQ=255) cGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGct < 1:343051/149‑1 (MQ=255) cGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGAAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGct < 1:631312/149‑1 (MQ=255) 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cAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGAT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCg < 1:748409/150‑1 (MQ=255) aGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGt > 1:751623/1‑114 (MQ=255) gCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGc > 1:381454/1‑149 (MQ=255) tACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCAc > 1:990885/1‑150 (MQ=255) aCCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCAct > 2:238915/1‑150 (MQ=255) ccGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActt < 1:245105/150‑1 (MQ=255) ccGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCAc < 1:939006/148‑1 (MQ=255) cGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActtc < 2:432458/150‑1 (MQ=255) agCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCActtct < 1:802815/149‑1 (MQ=255) cGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACttcttc > 1:1052573/1‑150 (MQ=255) gAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTtcttct < 2:967157/150‑1 (MQ=255) aTCCAGCAGCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTg > 1:756250/1‑147 (MQ=255) cagcagCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATg < 1:511612/150‑1 (MQ=255) cagcagCCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATg > 2:382399/1‑150 (MQ=255) gcagcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGc < 1:545790/150‑1 (MQ=255) cagcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCt < 1:860999/150‑1 (MQ=255) gcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCa > 2:755465/1‑150 (MQ=255) gcCACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCa < 1:31199/150‑1 (MQ=255) ccACAGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCAt < 1:244528/150‑1 (MQ=255) caGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCg < 1:336959/150‑1 (MQ=255) caGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCg < 2:802111/150‑1 (MQ=255) caGGAGGTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCg < 1:1091182/150‑1 (MQ=255) aggaggTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCgg < 2:439448/150‑1 (MQ=255) aggaggTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCg > 1:205795/1‑149 (MQ=255) gaggTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGGaa > 2:594863/1‑150 (MQ=255) gaggTT‑TACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGGaa > 2:290889/1‑150 (MQ=255) | TACAGAATGCGGCGGTTAAGCGGCCATGCCCATGCCCAGCCCAGCGTGTTACCGAGGCCAGACGGATCGGCGTTATCACGGCGTGCCATCTGGTTGCCTTCCGGCGTCCAGCTACCGGCGAAAATCCAGCAGCCACAGGAGGTTGTACCGTCATCGCGCAATTGGGCGAACGAACTAAGTTGTTGGCCTTTCTTGACGATAACCGCACCGGTTGCCGGATCGGTAATATCGGCCAGCGCCTTACCGTTGCTCTCCATCGCCACTTCTTCTGAAGATGGCTCATGCGGAA > CP009273/4076844‑4077132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |