| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,484,919 | C→G | 100% | pseudogene (52/750 nt) | gapC ← | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,484,919 | 0 | C | G | 100.0% | 438.7 / NA | 117 | pseudogene (52/750 nt) | gapC | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (55/62); total (55/62) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TAAGTGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTATGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAA > CP009273/1484775‑1485065 | aGTGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAacac > 1:448917/1‑149 (MQ=255) aGTGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAacac > 1:313919/1‑149 (MQ=255) gTGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCa < 1:680086/150‑1 (MQ=255) tGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAg > 1:905765/1‑150 (MQ=255) tGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAg < 1:915990/150‑1 (MQ=255) aaTCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTc < 1:527061/150‑1 (MQ=255) aaTCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTc < 2:690906/150‑1 (MQ=255) aTCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTc > 2:766018/1‑149 (MQ=255) aTCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTc > 2:32456/1‑149 (MQ=255) ttCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGAcc > 1:847465/1‑150 (MQ=255) ccGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGAcc < 2:225390/148‑1 (MQ=255) ccGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGAc < 1:1093456/147‑1 (MQ=255) tAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATAc < 1:63146/150‑1 (MQ=255) aaaaTCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATAc > 2:911341/1‑149 (MQ=255) aaTCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGAc > 2:972283/1‑150 (MQ=255) aaTCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGAc < 2:212040/150‑1 (MQ=255) aaCGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGGCCaaa < 2:889307/150‑1 (MQ=255) aaCGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCaaa < 2:837746/150‑1 (MQ=255) aCGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCaaaa > 2:805068/1‑150 (MQ=255) gCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAAcc > 2:1029558/1‑150 (MQ=255) gCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAAcc > 2:56129/1‑150 (MQ=255) cTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCg < 2:288828/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGt > 1:676301/1‑149 (MQ=255) cAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGtt > 1:138765/1‑149 (MQ=255) cAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGtt < 1:851331/149‑1 (MQ=255) cAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTa < 2:332103/150‑1 (MQ=255) aGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTaa > 1:773267/1‑150 (MQ=255) ggAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATAc > 2:989346/1‑150 (MQ=255) gAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATAcc < 2:147916/150‑1 (MQ=255) gAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATAc > 1:797256/1‑149 (MQ=255) aaTGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATAcc > 2:959239/1‑149 (MQ=255) gTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACtt < 1:740968/150‑1 (MQ=255) gTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACt < 1:1005946/149‑1 (MQ=255) gTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACt > 1:219557/1‑150 (MQ=255) gTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACt > 2:762195/1‑150 (MQ=255) tAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTaa < 2:704680/136‑1 (MQ=255) tAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACt > 1:1049161/1‑149 (MQ=255) tAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTc < 2:83566/150‑1 (MQ=255) aaTCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGtt < 1:176875/149‑1 (MQ=255) aTCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGtttt < 1:996398/150‑1 (MQ=255) tttCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTg > 2:144440/1‑150 (MQ=255) tttCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGGCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCt < 1:742654/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGt < 2:448917/149‑1 (MQ=255) cagcagGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGt > 1:1045878/1‑148 (MQ=255) cagcagGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTc < 1:754913/149‑1 (MQ=255) cagcagGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTc < 1:1029558/149‑1 (MQ=255) cagcagGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTc < 2:313919/149‑1 (MQ=255) agcagGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAg > 1:838676/1‑150 (MQ=255) agGTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGaa < 2:341763/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGGCAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAAc < 1:1061687/150‑1 (MQ=255) ggCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTc < 2:847465/150‑1 (MQ=255) ggCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTc > 1:345217/1‑150 (MQ=255) ggCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTc > 2:205647/1‑150 (MQ=255) ggCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTc < 1:707466/150‑1 (MQ=255) gCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCg < 1:22535/150‑1 (MQ=255) gCGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCg < 1:962491/150‑1 (MQ=255) cGAGAATTTTTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCgg < 1:907967/150‑1 (MQ=255) ttttTGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGaaa < 2:853932/150‑1 (MQ=255) ggggAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTg < 2:74866/149‑1 (MQ=255) ggggAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTg < 1:331786/149‑1 (MQ=255) ggggAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTg < 1:189887/149‑1 (MQ=255) ggAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATc < 1:124959/150‑1 (MQ=255) gTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCttt < 1:13353/150‑1 (MQ=255) agaTCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTcc < 2:868393/149‑1 (MQ=255) gaTCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCag > 1:166/1‑149 (MQ=255) aTCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAg > 2:568220/1‑150 (MQ=255) aTAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGAAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATATGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc > 1:405382/1‑150 (MQ=255) tAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc > 1:875608/1‑149 (MQ=255) aGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc > 2:932843/1‑148 (MQ=255) aGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc > 2:164919/1‑148 (MQ=255) gCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAg < 2:585994/150‑1 (MQ=255) gACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTc > 1:74594/1‑104 (MQ=255) gACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGa > 2:657386/1‑150 (MQ=255) aCAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCa < 2:74594/104‑1 (MQ=255) cAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATg < 2:1565/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAGCGCCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATgg < 1:479626/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTa > 2:60189/1‑139 (MQ=255) aCGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAg < 1:60189/139‑1 (MQ=255) cGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCg < 1:991055/150‑1 (MQ=255) cGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCg < 2:1054945/150‑1 (MQ=255) gTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCgg > 1:632484/1‑150 (MQ=255) tCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCggg < 2:117824/150‑1 (MQ=255) cTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGTCGGGa > 1:921775/1‑150 (MQ=255) tATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGAt > 2:550226/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATg > 2:268537/1‑150 (MQ=255) tGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGAt < 2:166/148‑1 (MQ=255) gTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATggg > 1:683182/1‑150 (MQ=255) ttGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATggg > 2:593295/1‑149 (MQ=255) tGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTATCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc < 2:1095390/131‑1 (MQ=255) cTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAt > 1:461438/1‑150 (MQ=255) ttttGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtc > 2:636879/1‑150 (MQ=255) ttGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc > 2:727591/1‑150 (MQ=255) ttGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc > 1:5398/1‑150 (MQ=255) tGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc < 1:911341/149‑1 (MQ=255) tGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc < 2:676301/149‑1 (MQ=255) cAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATtct < 2:212337/149‑1 (MQ=255) aGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTca > 2:41217/1‑149 (MQ=255) gTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTcaca < 1:494119/150‑1 (MQ=255) aTCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGt < 1:805068/149‑1 (MQ=255) gACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGaaa > 2:611798/1‑150 (MQ=255) | TAAGTGAATCTTCCGTAAAATCAACGCTCCAGGGGAATGGTCCGTAGTTTGAATCATGTTTCAGCAGGTAGGCGAGAATTTATGGGGAAGTGAGATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAA > CP009273/1484775‑1485065 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |