| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,485,017 | A→G | 80.0% | intergenic (‑47/‑142) | gapC ← / → cybB | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment)/cytochrome b561 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,485,017 | 0 | A | G | 80.0% | 275.4 / 64.0 | 120 | intergenic (‑47/‑142) | gapC/cybB | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment)/cytochrome b561 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/12); new base G (53/43); total (65/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
ATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGG > CP009273/1484869‑1485162 | aTCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAg > 2:568220/1‑150 (MQ=255) aTAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGAAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATATGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc > 1:405382/1‑150 (MQ=255) tAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc > 1:875608/1‑149 (MQ=255) aGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc > 2:164919/1‑148 (MQ=255) gACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGa > 2:657386/1‑150 (MQ=255) aCAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGAt < 1:883600/150‑1 (MQ=255) cAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATg < 2:1565/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAGCGCCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATgg < 1:479626/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTa > 2:60189/1‑139 (MQ=255) aCGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAg < 1:60189/139‑1 (MQ=255) cGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCg < 1:991055/150‑1 (MQ=255) cGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCg < 2:1054945/150‑1 (MQ=255) gTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCgg > 1:632484/1‑150 (MQ=255) tCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCggg < 2:117824/150‑1 (MQ=255) tATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGAt > 2:550226/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATg > 2:268537/1‑150 (MQ=255) gTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATggg > 1:683182/1‑150 (MQ=255) ttGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGa > 1:1095390/1‑131 (MQ=255) ttGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATggg > 2:593295/1‑149 (MQ=255) tGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTATCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGAc < 2:1095390/131‑1 (MQ=255) ttttGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtc > 2:636879/1‑150 (MQ=255) ttGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc > 2:727591/1‑150 (MQ=255) ttGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc > 1:5398/1‑150 (MQ=255) tGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc < 1:911341/149‑1 (MQ=255) tGACTTCAAGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAAtctc < 2:676301/149‑1 (MQ=255) aGTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTca > 2:41217/1‑149 (MQ=255) gTAATCGACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTcaca < 1:494119/150‑1 (MQ=255) gACGCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGaaa > 2:605631/1‑150 (MQ=255) cgcAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacg < 1:362208/148‑1 (MQ=255) cgcAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacg > 1:849147/3‑150 (MQ=255) cgcAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacg < 1:989346/148‑1 (MQ=255) gcAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacg > 1:140903/2‑149 (MQ=255) aaCACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacgtaa > 1:601254/1‑150 (MQ=255) acacCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacgtaac > 2:608250/1‑150 (MQ=255) cacCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacgtaacg > 2:665052/1‑150 (MQ=255) acCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAaacgtaacg > 1:717846/1‑149 (MQ=255) cAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTAc < 2:219557/150‑1 (MQ=255) cAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTAc > 1:45533/1‑150 (MQ=255) tCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGa < 2:601254/150‑1 (MQ=255) aCCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGaaaa > 2:181992/1‑150 (MQ=255) cGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACg > 2:379607/1‑150 (MQ=255) cGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACg > 2:498817/1‑150 (MQ=255) cGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACg < 1:766018/150‑1 (MQ=255) aTACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACggg < 1:568220/150‑1 (MQ=255) gACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtga < 1:276037‑M1/150‑5 (MQ=255) ccAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatg > 2:649675‑M1/1‑144 (MQ=255) aaaCCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctg > 2:266705‑M1/1‑141 (MQ=255) aaaCCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAata < 1:144440/150‑1 (MQ=255) cGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaa > 1:37633‑M1/1‑137 (MQ=255) cGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaa > 2:267643‑M1/1‑137 (MQ=255) cGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATAttt > 1:512264/1‑149 (MQ=255) gTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaac < 1:113126‑M1/150‑15 (MQ=255) aaTACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaactta > 2:810657‑M1/1‑133 (MQ=255) ccAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAAtt < 1:32456/150‑1 (MQ=255) cAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgat > 1:923411‑M1/1‑128 (MQ=255) cAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAAttt > 1:111577/1‑150 (MQ=255) aCTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgattt < 2:743945‑M1/150‑25 (MQ=255) aCTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTg < 1:593295/150‑1 (MQ=255) cTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgattta < 1:932843‑M1/150‑26 (MQ=255) cTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGaa > 1:395859/1‑148 (MQ=255) cTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGaaaa < 1:188146/150‑1 (MQ=255) aTGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:138765‑M1/150‑34 (MQ=255) aTGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 1:566215‑M1/150‑34 (MQ=255) aTGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGcc > 2:165736/1‑150 (MQ=255) tGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 2:759829‑M1/1‑116 (MQ=255) gTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCg < 2:346825/149‑1 (MQ=255) ttttCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt < 2:140903‑M1/150‑38 (MQ=255) tttCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTa > 2:525428/1‑150 (MQ=255) ttCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 1:142518‑M1/1‑111 (MQ=255) ctcCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATg < 2:178174/149‑1 (MQ=255) cTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:959239‑M1/148‑43 (MQ=255) cTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 1:41217‑M1/147‑42 (MQ=255) cTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 2:1045878‑M1/147‑42 (MQ=255) cTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 1:920662‑M1/147‑42 (MQ=255) tCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAAc < 1:550226/148‑1 (MQ=255) tCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACg > 1:224151/1‑149 (MQ=255) aGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg < 2:797256‑M1/150‑50 (MQ=255) aGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 2:879961‑M1/1‑101 (MQ=255) gAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGaaaa > 1:197220/1‑150 (MQ=255) ttCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccata < 1:641188‑M1/150‑57 (MQ=255) cGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatatt > 1:186502‑M1/1‑92 (MQ=255) cGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatatt > 1:470738‑M1/1‑92 (MQ=255) ggATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatatt < 2:838676‑M1/149‑59 (MQ=255) tGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccac > 1:1043846‑M1/1‑88 (MQ=255) gAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccac > 2:186674‑M1/1‑87 (MQ=255) gAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccac > 2:496333‑M1/1‑87 (MQ=255) aaaaTTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccacc < 2:37633‑M1/149‑64 (MQ=255) ttGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGa > 2:735159/1‑149 (MQ=255) aTCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatt < 2:875608‑M1/149‑71 (MQ=255) aTCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAAt < 1:56129/149‑1 (MQ=255) aTCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATg < 2:199105/150‑1 (MQ=255) ccTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACAGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGt > 1:462525/1‑149 (MQ=255) cTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgt < 1:657386‑M1/149‑74 (MQ=255) ttCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATg > 2:222443/1‑150 (MQ=255) tCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagt > 2:1040664‑M1/1‑73 (MQ=255) tCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgtta < 2:717846‑M1/148‑76 (MQ=255) tCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATg < 1:727591/149‑1 (MQ=255) tCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATg < 2:197220/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCTATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGatgatgctgccatcttcctgatttattgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagt < 2:405382‑M1/149‑78 (MQ=255) ccAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATgg > 1:387444/1‑149 (MQ=255) | ATCATTAATAGCGACAACGTCTATGTTGCTTTTGACTTCAAGTAATCGACCCAACACCAGTCGACCGATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGG > CP009273/1484869‑1485162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |