| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 768434 | 146 (0.960) | 3 (0.020) | 3/278 | 25.7 | 1.4% | coding (1521/1569 nt) | cydA | cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| ? | CP009273 | 4036882 = | 280 (1.950) | coding (105/627 nt) | dsbA | periplasmic protein disulfide isomerase I | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
CGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGTTTCGA > CP009273/768286‑768583 | cGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc < 1:897332/150‑1 (MQ=255)cGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTc < 2:1545415/150‑1 (MQ=255) gACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGtag > 1:962633/1‑148 (MQ=255) aCAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAATCAGCCTGAAAACCGGTCGc > 1:266857/1‑150 (MQ=255) cAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGc > 2:1835324/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTa > 1:1625865/1‑150 (MQ=255) cTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCGAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATc > 1:2026926/1‑150 (MQ=255) cTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATc < 1:2160253/150‑1 (MQ=255) tgtgGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCa > 2:2059864/1‑150 (MQ=255) tgtgGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCa > 1:2171803/1‑150 (MQ=255) tgGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCa < 1:373504/148‑1 (MQ=255) tgGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCa < 1:121613/148‑1 (MQ=255) gCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACttt < 1:893177/150‑1 (MQ=255) gCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACttt < 2:145570/150‑1 (MQ=255) gCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACtt < 1:187829/149‑1 (MQ=255) cGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGt > 1:786731/1‑150 (MQ=255) gTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTc > 1:2186514/1‑150 (MQ=255) aCTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTc > 1:850446/1‑150 (MQ=255) tGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCa > 1:1686533/1‑150 (MQ=255) tGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCa > 1:1803061/1‑150 (MQ=255) aCCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCa < 2:486596/148‑1 (MQ=255) aCCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCAc < 2:897493/149‑1 (MQ=255) aCCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCAc > 2:531650/1‑149 (MQ=255) cGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTAGTGCAGTCTTCCACGac > 1:1931164/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTGCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGact < 2:402787/150‑1 (MQ=255) gCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTc < 1:1416228/150‑1 (MQ=255) cGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCa < 2:164047/150‑1 (MQ=255) gATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAg > 1:1062918/1‑150 (MQ=255) gATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAg > 1:1701512/1‑150 (MQ=255) aTCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGc > 1:330902/1‑150 (MQ=255) ctcATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCg > 2:1236485/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCa > 1:537006/1‑150 (MQ=255) tcttctCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCAc > 2:1860079/1‑150 (MQ=255) cttctCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACg > 2:2016002/1‑150 (MQ=255) ttctCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGc > 2:591421/1‑150 (MQ=255) ctcAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCAc < 2:50501/146‑1 (MQ=255) aaTGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGa < 1:2007031/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGa < 2:1598336/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTgaga > 1:1928965/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGAc < 2:2110985/150‑1 (MQ=255) gTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAg < 2:2399291/149‑1 (MQ=255) tGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGa < 2:873617/150‑1 (MQ=255) gCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAg > 1:2302902/1‑150 (MQ=255) tGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAgtc > 1:596898/1‑150 (MQ=255) gATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAgtcg > 1:498973/1‑150 (MQ=255) tttGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAgtcgt > 1:1856551/1‑149 (MQ=255) gCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCaa < 1:932166/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCaaa < 1:1249795/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCaaa < 1:999322/149‑1 (MQ=255) cGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAAt > 1:1598950/1‑150 (MQ=255) ggCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAAt > 1:1975780/1‑149 (MQ=255) ggCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATg < 1:852901/150‑1 (MQ=255) gCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGa < 2:580626/150‑1 (MQ=255) gCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGa < 1:107760/150‑1 (MQ=255) tataCCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGGCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCGTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCg < 2:962633/148‑1 (MQ=255) cccTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTAt < 1:1737259/149‑1 (MQ=255) cccTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATg < 2:975691/150‑1 (MQ=255) cccTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATg < 1:129002/150‑1 (MQ=255) tggtggCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGc > 1:510337/1‑150 (MQ=255) gtggCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCg < 2:511440/149‑1 (MQ=255) gtggCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCg < 1:1027589/149‑1 (MQ=255) gCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGttt < 2:1033723/149‑1 (MQ=255) gAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATc > 1:594629/1‑150 (MQ=255) 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ttCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCtggtg < 1:688417/149‑1 (MQ=255) tCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGttt < 2:1035227/139‑1 (MQ=255) ttAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGAtt > 2:1647667/1‑121 (MQ=255) tAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGgctgc > 2:2140130/1‑150 (MQ=255) aaTGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGgctgc < 1:563993/149‑1 (MQ=255) aaTGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGgctg < 1:531650/148‑1 (MQ=255) aaTGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGgct < 2:1561967/147‑1 (MQ=255) ttCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGtt > 1:869310/1‑150 (MQ=255) aGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCg < 2:104203/150‑1 (MQ=255) gTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGt < 2:1931164/150‑1 (MQ=255) gTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGt > 2:1010392/1‑150 (MQ=255) tttGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGtt < 1:1792432/150‑1 (MQ=255) tGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTc < 1:1510411/149‑1 (MQ=255) tGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTc < 1:432085/149‑1 (MQ=255) cACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTctgc > 2:558258/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGAtt < 2:1062918/150‑1 (MQ=255) ggCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTgg < 1:2059864/149‑1 (MQ=255) gCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGtt < 1:1907104/150‑1 (MQ=255) cccAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGttt < 2:558184/150‑1 (MQ=255) cccAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGttt < 2:1718280/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTg > 1:113593/1‑150 (MQ=255) agcCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTc < 2:1149760/150‑1 (MQ=255) cTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGAtt > 2:519793/1‑135 (MQ=255) aaaaCCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTg < 2:74894/148‑1 (MQ=255) aaaaCCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGAc < 1:1015305/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACg < 1:558258/150‑1 (MQ=255) aCCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGt < 2:2186514/150‑1 (MQ=255) cGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGttt < 2:1299634/150‑1 (MQ=255) ggTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGTTTc < 2:2302902/150‑1 (MQ=255) gTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGTTTc > 1:2157680/1‑149 (MQ=255) gTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGTTTCg < 2:330902/150‑1 (MQ=255) tCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGTTTCGa < 2:1701512/150‑1 (MQ=255) | CGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATCTCATCTTCTCAATGGTGCTGATTTGCGGCCTGTATACCCTGTTCCTGGTGGCAGAATTGTTCTTAATGTTCAAGTTTGCACGCCTCGGCCCAAGCAGCCTGAAAACCGGTCGCTATCACTTTGAGCAGTCTTCCACGACTACTCAGCCGGCACGCTAAGACAGGAGTCGTCAAATGATCGATTATGAAGTATTGCGTTTTATCTGGTGGCTGCTGGTTGGCGTTCTGCTGATTGGTTTTGCAGTCACTGACGGTTTCGA > CP009273/768286‑768583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |