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| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| ? | BA000036 | 1693901 = | 0 (0.000) | coding (18/660 nt) | Cgl1598 | Pentose‑5‑phosphate‑3‑epimerase | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GAGAAGCGCCTTGGAACATGGACCCGTGCGGCCGTAATGGTTGCACGGCTCGAGGGTGACCACCGCCGTGCCCCCGTTGGCACGCACTCCGGCAGCTGCAAGCGCCACCACTTCGGCGTGCGGGCCACCAGGAGGTGCCGTGGCGCCAACGCCAACGACCTCGCCGTCGGCGTCCAAAATGACAGCGCCGACTGGCGGATTAGGGCTGGTGGTGCCTCGGACTTGATCTGACACGTGGTGGGCCAGATCTAACGCGTGCGCAACATCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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CGCAACCCATCCTTTAAATTAAACATTCTGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTCGCTCCCAGTTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACCAACATCGCATCGGTTCCGTTGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCCTCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTCCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCCGGTGAACATGTGTAGTACCCAATCACGC > 1:89366/1‑300 GCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCC < 1:149647/300‑1 CATAATTTAAATTAAACATCATGGAGTACGTGGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCCCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCCACCGGA < 2:431486/300‑1 TCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAACCATCGCATCGGTTCCGTGGCGGTGTTGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAACCTCTTCGATCTCCAGCGCCCCCAGTGCCTTGTTCACGACTCCTCGGGTTTCACGCAGATCCGGTCAACATGTGGGTTACACAATCACGCCACCGGAAC > 2:326862/1‑300 TCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGGGTATCCAATCACGCCACCGGAAC > 2:9228/1‑300 AACATTATGGAGTCCGTTGTTCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCCCTTAGCTCACAGGTCTACTTCCTTCGCAGCACTGCCACCAACATCGCATCGGTGCCGTGGCTGTGTGGCCAAATCTGCACTGATCTCTCATCGCCGGTATCGGTCTTGCCTGGCATGAACCCCGCAGCCCCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGGGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACACACCCGCCACCGGAACGCACCTTGTTCA > 2:357756/1‑300 TTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCCACCGGAACGCACCTTGTTCACAGC < 1:490636/300‑1 TTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGCCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCCACCGGAACGCACCTTGTTCACAGC > 1:156814/1‑300 TTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGCCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATAACGCCACCGGAACGCACCTTGTTCACAGC > 1:156811/1‑300 |||||||||||||||||||||| GAGAAGCGCCTTGGAACATGGACCCGTGCGGCCGTAATGGTTGCACGGCTCGAGGGTGACCACCGCCGTGCCCCCGTTGGCACGCACTCCGGCAGCTGCAAGCGCCACCACTTCGGCGTGCGGGCCACCAGGAGGTGCCGTGGCGCCAACGCCAACGACCTCGCCGTCGGCGTCCAAAATGACAGCGCCGACTGGCGGATTAGGGCTGGTGGTGCCTCGGACTTGATCTGACACGTGGTGGGCCAGATCTAACGCGTGCGCAACATCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BA000036/1692989‑1693280‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCCACCGGAACGCACCTTGTTCACAGC > BA000036/1693901‑1694197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |