| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | = 495978 | 51 (0.550) | 4 (0.060) | 4/444 | 11.7 | 7.5% | intergenic (+2/‑251) | codon recognized:ACC/codon recognized:ACC | tRNA‑Thr/tRNA‑Thr |
| ? | BA000036 | 496304 = | 61 (0.890) | intergenic (+3/‑36) | codon recognized:ACC/codon recognized:ATG | tRNA‑Thr/tRNA‑Met | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTTCTGGATCTCTTTAGGTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAATTTTTTGAGGTTAGAAGCGGTGTTTTCGCAAATTGACAGGCTGATGGTAACATTGCCTGTGCTCCATAGGGGCGTAGCTCAATTGGCAGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAGGTTGCAGGTTCGATTCCTGTCGCCCCTGCAAGATGAACACCCTTGATCTG > BA000036/496007‑496602 | aTTTCTGGATCTCTTTAGGTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGtt > 1:626/1‑300 (MQ=255)aTTTCTGGATCTCTTTAGGTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGtt > 2:19978/1‑300 (MQ=255) tCTGGATCTCTTTAGGTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCt > 1:484747/1‑300 (MQ=255) aTCTCTTTAGGTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCCTGGTAAGGCAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTAt > 2:294360/1‑300 (MQ=255) ctctTTAGGTCACAACTGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTCGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGGTCGATTCTGTTAGGGGCCTCTGTTGTTTTTAttt > 2:101234/1‑299 (MQ=255) tttAGGTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTCGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGt > 1:439417/1‑286 (MQ=255) ttAGGTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGtt < 2:439417/286‑1 (MQ=255) ggTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTTCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTTCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAag > 1:456216/1‑300 (MQ=255) ggTCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAag > 2:343526/1‑300 (MQ=255) tCACAAATGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTaa > 1:342698/1‑297 (MQ=255) aaaTGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCACAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGGAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGt > 2:322740/1‑300 (MQ=255) aaTGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGtt < 1:126977/300‑1 (MQ=255) tGCACACCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTACGGCTTCAATGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTTAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAATGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTGTCGGTAGAGCTGtt > 2:482606/1‑298 (MQ=255) acacCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCa < 1:343526/300‑1 (MQ=255) cacCTGGCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAACGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTATGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTAGTAAGAGATGTTGAGcga > 1:516476/1‑298 (MQ=255) gCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTgg < 2:78996/299‑1 (MQ=255) gCAGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAAGTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCGGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtgtg < 1:215272/298‑1 (MQ=255) aGACGCACTCAAGGCGTGAGTTTTTAGTTTCATGCCACATGCATCGCTGTAGGGGTGCAAGTTAATCCAAGGAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGTTTCTGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAACGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCgg < 1:334092/300‑1 (MQ=255) cTCAAGGCGTGAGTCTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGCAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCCCAGTCGGTTGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCCCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCt > 2:526377/1‑300 (MQ=255) aaGGCGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGAGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGTGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTAAACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCa < 1:224369/299‑1 (MQ=255) tttAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGTTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGCTTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGGTCTGTTGAGCAATGTGACGGTGTTGCTCAGTGGTGAAGCagg > 2:410142/1‑298 (MQ=255) ttAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTCCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAACGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAATAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGc > 1:125659/1‑300 (MQ=255) 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aTTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGc > 1:383017/1‑300 (MQ=255) tAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCAt > 2:389235/1‑300 (MQ=255) aTCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCg < 2:342698/300‑1 (MQ=255) taatccTTTAGCTTCCTGCAGACTTGTGTTGCGGTTTCGGTTCGGGTTAAATTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGGTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTAGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACcgc < 1:250512/296‑1 (MQ=255) tAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGaaa > 1:50813/1‑300 (MQ=255) cTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTCCCGCGGATGAAACCg > 1:495787/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |