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Missing coverage evidence... | ||||||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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? | BA000036 | 2981682 = | 0 (0.000) | coding (18/1521 nt) | Cgl2796 | NAD‑dependent aldehyde dehydrogenases |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCAGGTTTCTGCAACTGCGATTTCTTCCAGGTGCTCTTCCATGCGGTCCGCAATGCGGTGCAGGATCAGAGCACGTTCAGCGACAGAAGTCTTGCCCCACGCATCAGCGGCTGCATGTGCAGCATCCAGTGCAAGCTCCACGTCCGCTGCGGTGCCACGTGCGACCTCACAGAAAACTTCACCAGTGACAGGTGAAATGTTCTCAAGGTACTGGCCCTCTACCGGTGGAACCCACTTGCCACCAATGTAGTTCTCGTAGCGCTTTTCATAGTTAACGATCGAGCCTTCGGTTCCTGGATTTGCGTAGACAGTCATTGGGTCTCCTTTGGGCCACCTCCACCTGAGCACTACCTGTGCGTCAGGTGACACTTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAAATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAAATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTAATTGGCGAAAGCACGAAACGGGCACCTCCAAAAGATAAATGGAGGTGC > BA000036/2981385‑2981980 | taacaggggctgctgatccaatcggttttgccggcacccaatatgacggcatccatggcactgagcccaccgctgccctagtcggtgcaacagtgtgggattcgccctcaacgcattccggttattggaatgaccaggagttcctgggcaatgtggcggaggtggttcgcggcaaatagaaaagccgccgcacactggaggatgtgtgaggcagcttttctaggacttaacgcttagatcagaacagtccggttgggtttggatcgtaggagaccccatcatttaaattaaacattaAtt < 2:483818‑M2/3‑1 (MQ=255) 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ttaaacattaATTTGCGTAGACAGACATTGGGTCTCCTTGGGGCCACCTCCACCTGAGCACTACCTGTGCGTCAGGTGACACTTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAGATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAGATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTAATTGGCGAAAGCACGAAACGGGCACCTCCAAAAGATaaa < 1:450210‑M2/290‑1 (MQ=255) aacattaATTTGCGTAGACAGACATTGGGTCTCCTTTGGGCCACCTCCACCTGAGCACTACCTGTGCGTCAGGTGACACTTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAAATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAAATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTAATTGGCGAAAGCACGAAACGGGCACCTCCAAAAGATAAATg > 1:292586‑M2/8‑299 (MQ=255) aacattaATTTGCGTAGACAGACATTGGGTCTCCTTTGGGCCACCTCCACCTGAGCAATACCTGTGCGTCAGGTGACACGTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAAATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAAATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTAAGTGGCGAAAGCACGAAACGGGCACCTCCAAAAGATAAATg < 1:88191‑M2/292‑1 (MQ=255) cattaATTTGCGTAGACAGACATTGGGTCTCCTTTGGGCCACCTCCACCTGAGCACTACCTGTGCGTCAGGTGACACTTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAAATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAAATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTAATTGGCGAAAGCACGAAACGGGCACCTCCAAAAGATAAATGGAg < 1:498528‑M2/295‑1 (MQ=255) taATTTGCGTAGACAGACATTGGGTCTCCTTTGGGCCACCTCCACCTGAGCACTACCTGTGCGTCAGGTGACACTTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAAATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAAATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTACTTGGCGAAAGCCCGATACGGGCACCTCCAAACGATAAATGGAGCTg > 2:450181‑M2/3‑300 (MQ=255) aATTTGCGTAGACAGACATTGTGTCTCCTTTGGGCCACCTCCACCTGAGCACTACCTGTGCGTCAGGTGACACTTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAAATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAAATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTAATTGGCGAAAGCACGAAACGGGCACCTCCAAAAGATAAATGGAGGTGc > 1:54222‑M2/2‑300 (MQ=255) | CCAGGTTTCTGCAACTGCGATTTCTTCCAGGTGCTCTTCCATGCGGTCCGCAATGCGGTGCAGGATCAGAGCACGTTCAGCGACAGAAGTCTTGCCCCACGCATCAGCGGCTGCATGTGCAGCATCCAGTGCAAGCTCCACGTCCGCTGCGGTGCCACGTGCGACCTCACAGAAAACTTCACCAGTGACAGGTGAAATGTTCTCAAGGTACTGGCCCTCTACCGGTGGAACCCACTTGCCACCAATGTAGTTCTCGTAGCGCTTTTCATAGTTAACGATCGAGCCTTCGGTTCCTGGATTTGCGTAGACAGTCATTGGGTCTCCTTTGGGCCACCTCCACCTGAGCACTACCTGTGCGTCAGGTGACACTTGGTCAACGATTGTGACAACGCGCACATTCGCACGCTTAGCAGCCACCATATTCACGAAAATCAATCCGCGCTAGAACCCCCGTTAAATTCACCCCCTTTTCTCAAAATTCTCGCAGCTCAACGCCGAAAGCCTTTCAAAAGTTATTACCCCTGTTCGGGTGGTTATACATGTATCTAATTGGCGAAAGCACGAAACGGGCACCTCCAAAAGATAAATGGAGGTGC > BA000036/2981385‑2981980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |