New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BA000036 | = 1115809 | NA (NA) | 96 (1.030) | 78/594 | 0.2 | 95.0% | intergenic (+13/+20) | Cgl1066/Cgl1067 | Transposase/Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |
? | BA000036 | 1413166 = | 5 (0.050) | intergenic (‑250/+399) | Cgl1352/codon recognized:TTG | Hypothetical membrane protein/tRNA‑Leu |
ATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAGGCGACCGCGGATTTAAGAGCAGAGGCTGCCACGAGCGCATCTTCACGGCTGTGTGTTGTACTAAAAGTACAGCGCACAGCCGTTCGTGCTTGATCCTCCTCAAGCCCCAACGCCAGCAACACATGGGATACCTCTCCGGAACCACAGGCAGAACCAGGGGAGCACACAATGCCTTGGCGTTCCAATTCCAGAAGAACAGTTTCAGATCCTATGCTGTCGAAGAGAAAAGATGCGTGTCCATCAATGCGCATCCTAGGATGT > BA000036/1115513‑1116105 | ataaGCGTGAAGGGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGt < 1:480078/300‑1 (MQ=14) aaGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTaa < 1:266490/300‑1 (MQ=31) gAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACctct > 1:553554/1‑300 (MQ=33) gaagaagaaCATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAACCGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGAc > 1:57239/1‑298 (MQ=21) gaagaaAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTACAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTCATTTGAAACAATACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAACACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCg > 2:444897/1‑300 (MQ=255) aagacGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCGGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCAccc < 1:412898/296‑1 (MQ=255) aTGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCct > 1:223098/1‑300 (MQ=39) 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attattGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCACGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACAGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGATTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAg < 1:220604/300‑1 (MQ=255) tGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAGGCGAc > 2:268987/1‑300 (MQ=255) aTCAGGGTCTGGTGGTGACGGGGCCGAATAAGGAGCACGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATGTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCGCTGACTAGCGTCACCCTCTGACGAAGGCGACcg < 2:411958/300‑1 (MQ=14) cTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGTGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCCTCGGTGCCTTATCCATCCAGGGCAGTTGGTCCATCAGATCAATGCACTCTACAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAACGTAACCCTCTGATTAAGACGACCGCGGAt > 1:193571/1‑300 (MQ=255) gggTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTGTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAGGCGACCGCGGATTTaa < 2:354499/300‑1 (MQ=255) ggTGTTGAAGGGGCCAGATAAGGAACGCGCGCAGTTGGGTCGTAGTGTGTTTAAGCGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCAGTCAGGGCAGGTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCGTAAACCTCTGACTAGCGTCACCCTCTGATTAAGGCGACCGCGGATTTAag < 2:271100/300‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
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