| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.69e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
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agcaGCAAACTACTCATCAGTGATGTCTGCTACAAGCCCACATTGATCTTCCACCTGTTCTTGTGCCACCGGAGATTCAACCCCGATCGCCAGCAACATAACAGCAGAAGCCCCCACTAGTCTTCGTACCAACCGCATATATCAAACCTTTACCTGTCGGAAAAATGTGTACAAGCTGAGGATAAGCATAAATTCGCTTAAGAGCTGGATGAAAGAGGAAACGCTCCTCTTTTCTACCCGAAAAAGGGTGTAAGGATTGCACTGCTTAAGTGACATTAGGCCCTCCCGGGCAAATCCtt < 2:468285/297‑1 (MQ=255) tactCATCAGTGATTTCTTCTACAAGCTCAAATTGATCTTCCACCTGTGCTTGAGCCACCGGAGATGCAACCCCGATGGCCAGCACCATAACAGCAGAACCCCCCACTAGTCTTCGTACCAACCGCATATATCAAACCTTTACCTGTCGGAAAAATGTGTACAAGCTGAGGATAAGCATAAATTCGCTTAAGAGCTGGATGAAAGAGGAAACGCTCCTCTTTTCTACCCGAAAAAGGGTGTAAGGATTGCACTGCTTAAGTGACATTAGGCCCTCCCGGGCAAATCCTTATTCGAaca > 2:545812/1‑298 (MQ=255) gTGATTTCTTCTACAAGCTCAACTTGATCTTCCACCTGTGCTTGAGCCACCGGAGATGCAACCCCGATGGCCAGCAACATAACAGCAGAAACCCCCACTAGTCTTCGTACCAACCGCATATATCAAACCTTTACCTGTCGGAAAAATGTGTACAAGCTGAGGATAAGCATAAATTCGCTTAAGAGCTGGATGAAAGAGGAAACGCTCCTCTTTTCTACCCGAAACAGGGTGTAAGGATTGCACTGCCTACGTGACATTAGGCCCTCCCGGGCAAATCCTTATTCGACCACAGTCTCCaa > 2:243836/1‑299 (MQ=255) | GGTTGCCATCAGTCGTGCACCCTCGTTAAGTCGCGCTTCCGCAACTTCTAGCTGGTCAGCTTTCTCCTTGCTTACCCCCTCCGGTAACTCGATAACATCTGAACGCATGTCCCCTGCAACTATGTCCCGCTTAGGCAGCGGGAGTTCCTCGACATTATCTTTACTATCGTTGACTTGCTCGTGATACTCAACGACTACTTCTGGATGTGCTGTTTCGTAATCCTCAAGTTGTTCCTCAACTGTTGGAGCATTCCTATTGGGAACATAATCAACACCGTCATCAGCAAACTACTCATCAGTGATTTCTTCTACAAGCTCAAATTGATCTTCCACCTGTGCTTGAGCCACCGGAGATGCAACCCCGATGGCCAGCAACATAACAGCAGAAACCCCCACTAGTCTTCGTACCAACCGCATATATCAAACCTTTACCTGTCGGAAAAATGTGTACAAGCTGAGGATAAGCATAAATTCGCTTAAGAGCTGGATGAAAGAGGAAACGCTCCTCTTTTCTACCCGAAAAAGGGTGTAAGGATTGCACTGCTTAAGTGACATTAGGCCCTCCCGGGCAAATCCTTATTCGAACACAGTCTACAA > BA000036/1994014‑1994610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |