| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | BA000036 | 2,083,859 | T→A | G444G (GGA→GGT) | Cgl1975 ← | Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BA000036 | 2,083,859 | 0 | T | A | 97.7% | 295.3 / NA | 87 | G444G (GGA→GGT) | Cgl1975 | Polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (46/39); minor base G (1/1); total (47/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCTTCTGCGCCGAGGATGTCGGTCAGTGCAACGTACTCGGTCTTGCCGTCGATTTCACCGGAAACAAGTCCCATGGCGATACCTGCAACAGGTGCCTTCAGTGGAACACCAGCGTTGTACAGGGACAGAGTGGATGCACAGACAGAGCCCATGGAGGTGGAGCCGTTGGAGCCCAGAGCTTCAGAGACCTGACGGATTGCGTATGGGAATTCCTCACGGGATGGGATTACTGGCAAAACTGCGCGTTCTGCAAGTGCACCGTGGCCGATTTCGCGGCGCTTTGGTGAGCCCACACGTCCGGTTTCACCGGTGGAGTATGGAGGGAAGTTGTAGTGGTGCATGTAGCGCTTCGCATCGCCTGGTGCCAGGGAGTCGATTTGCTGTTCCATCTTGAGCATGTCCAGGGTGGTGACACCAAGGATCTGGGTCTCGCCACGCTCGAAGAGGGAGGAACCGTGCGCACGTGGGATGAGCTCAACTTCTACTGCCAGGTCACGGATGTCGGTGACTCCGCGGCCGTCGATGCGGAAGTGATCGGTGAGGATCATGCGGCGCACGATGGCCTTCATGACAGCGTTGTATCCTGCACGGAT > BA000036/2083562‑2084155 | gTCTTCTGCGCCGAGGATGTCGGTCAGTGCAACGTACTCGGTCTTGCCGTCGATTTCACCGGAAACAAGTCCCATGGCGATACCTGCCACAGGTGCCTTCAGTGGAACACCAGCGTTGTACAGGGACAGAGTGGATGCACAGCCAGAGCCCATGGAGGTGGAGCCGTTGGAGCCCAGAGCTTCAGAGACCTGACGGATTGCGTATGGGAATTCCTCACGGGATGGGATTACTGGCAAAACTGCGCGTTCTGCAAGTGCACCGTGGCCGATTTCGCGGCGCTTTTGTGAGCCCACACGAcc > 1:123157/1‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |