| Predicted mutation | ||||||
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| RA | BA000036 | 770,809 | G→A | L1112F (CTT→TTT) | Cgl0738 ← | Type II restriction enzyme, methylase subunits |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | BA000036 | 770,809 | 0 | G | A | 98.8% | 320.2 / NA | 83 | L1112F (CTT→TTT) | Cgl0738 | Type II restriction enzyme, methylase subunits |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (44/38); minor base T (1/0); total (45/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCAAAGTATCCCTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAGTGAATCAAGCACTGTTTGTGGGTGATAAAGCGACGCAGCACTTAAAAAGTTAATAGATTCCTGCGGAGCGCCATAGACATGTACGCCATATTTAACCAAGTCGTGGACGTCAAAAAGAATCAACTCATTAATGAACTGCCAGTGGCGGCGCAGACGCTCATATGCTCCCCGACGTAGCGGGGCAGCTTTTTTCTCAGTGAAGTGGGATTCGGGGTGGATCAGTGAGATCGCACCTGCCGGGGAGGCATTAGACCAAGTCTTTTCCATAAAGCCCCGGTAGAGGTCCGGGCG > BA000036/770513‑771100 | gTCAAAGTATCCCTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTCAGCCCAGGGAGATTACCTGACCCGTCATGACCAAATg > 2:555070/1‑299 (MQ=255) cAAAGTATCCCTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAATGaa > 1:396198/1‑299 (MQ=255) cAAAGTATCCCTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGAGACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAATGAAt < 2:283990/300‑1 (MQ=255) aaGTATCCCTTTGTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAATGAATCa < 1:236122/300‑1 (MQ=255) tATCCCTGTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAATGAATCAAGc < 1:451491/300‑1 (MQ=255) ccTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGCCCAGGGAGATTACCTGAACCGTCCTGGTCTAATGAATCAAGCACTg > 2:350720/1‑300 (MQ=255) acTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAATGAATCAAGCAcg < 2:121288/298‑2 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |