| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BA000036 | = 1115810 | NA (NA) | 56 (0.720) +ATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTA |
50/502 | 0.9 | 100% | intergenic (+14/+19) | Cgl1066/Cgl1067 | Transposase/Cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase and related enzymes |
| ? | BA000036 | 1693901 = | 0 (0.000) | coding (18/660 nt) | Cgl1598 | Pentose‑5‑phosphate‑3‑epimerase | |||||
ATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BA000036/1115513‑1115810‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCCACCGGAACGCACCTTGTTCACAGCG > BA000036/1693901‑1694198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATAAGCGTGAAGCGAAGACGAAAATGCGGACCCTTCTTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTTGTGATGTGTTGGCGTCTTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCCACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGCTTGCTCTAGGTTTACGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCCGGGCCGTTGGTCCCTAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCAT > 2:261436/1‑300ATAAGCGTGAAGCGAAGACGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGACGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAGACGAATTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCCGGGCAGTTGGTCCATCAGATCACTGCACTCTCAAACAGGAAGAGCCCAT > 2:261463/1‑300ATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCAT > 2:261440/1‑300 GTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTTATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTG > 1:107398/1‑300 TGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGC < 2:297985/300‑1 GAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCG > 1:190774/1‑299 AATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGAGAGTGCTCGCAAC > 1:451741/1‑300 TGCGGACCATTATTGAGCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCC < 1:3541/300‑1 CCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTGTGTTTAAACGAC‑TGGTGATGTGGTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAGCCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTT < 1:31952/300‑1 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CGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTACAACAGGAAGAGCCCCTTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACACATCATTTAAATTAGACATTATGG > 2:295162/1‑300 CGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTAT < 1:462489/298‑1 TGTTGGAGGGGCCGAATAAGGAACGCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTGAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGGACATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGTAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTA < 1:394288/300‑1 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AGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAAGTAAACATTATGGAGTACGTTGT < 2:319928/300‑1 GTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTC > 1:190983/1‑299 TTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACT > 1:218582/1‑300 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TGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATAATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCACTAAATCATAGACATCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGTTCTACTTCTTT > 1:52872/1‑300 TTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGCGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCG > 2:203542/1‑300 GGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACAT > 1:110367/1‑300 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TGGGATTGCTCGAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATGCTGCGGTGCCGTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGG < 2:321407/300‑1 GGATTGAACTAGGTTTCCGTAATTTGAAACACTACATTCAGCGGTGGCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTGCATAAGATCAATGCACTCTAAAACATGAAAAGACTATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTGAATCATAGCGCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTGTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCAGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGT < 2:421659/299‑1 GATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTAT > 1:147462/1‑300 GATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTAT < 1:295072/300‑1 GCTATAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGG < 2:266325/299‑1 CTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCCATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGCGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCAT > 1:213686/1‑300 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ATTTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATG < 2:110367/300‑1 TTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTG > 1:521916/1‑300 TTACTGCGCGAGTGCTCGCAACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTG > 1:521908/1‑300 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AACCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGACCATGTGGCGTACACAATCACGCCAC > 1:145432/1‑300 CCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCCACCG < 1:360093/300‑1 CCCATCATTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCAACCCCACTTAGCCCACAGGTCTACTCCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCACCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCCCCAGCTCTTCGATCTCCAGAGACCCCAGTGCCTCGGCCACGAGTCCGCGGGCATCATGCAGATCAGGTGAACATGGGGAGTACAAAAGCACGCaaacg > 2:14950/1‑295 TTTAAATTAAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTCAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTTGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGACTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCCGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCCCGCCACCGGAACGCA > 1:175973/1‑300 AAACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAG > 1:201444/1‑253 AACATTATGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGG < 2:201444/253‑1 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ATAAGCGTGAAGCGAAGAAGAAAATGCGGACCATTATTGATCAGCTTCGGGTGTTGAAGGGGCCGAATAAGGAACTCGCGCAGTTGGGTCGTAGTTTGTTTAAACGACTTGGTGATGTGTTGGCGTATTTCGATGTTGGTGTCTCCAACGGTCCGGTCGAAGCGATCAACGGACGGTTGGAGCATTTGCGTGGGATTGCTCTAGGTTTCCGTAATTTGAACCACTACATTCTGCGGTGCCTTATCCATTCAGGGCAGTTGGTCCATAAGATCAATGCACTCTAAAACAGGAAGAGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BA000036/1115513‑1115810‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGAGTACGTTGTGCCATGCCCTAAATCATAGCCCTCTTGTCTACCCCACTTAGCTCACAGGTCTACTTCTTTCGCAGCACTGCCACAAACATCGCATCGGTGCCGTGGCGGTGTGGCCACATCTGCACTGATTTCTCATCGCCGGTATCGGTCATGCCTGGCATGAACTCCGCAGCCTCAAGCTCTTCGATCTCCAGAGCCCCCAGTGCCTTGTCCACGATTCCGCGGGTTTCACGCAGATCAGGTGAACATGTGGAGTACACAATCACGCCACCGGAACGCACCTTGTTCACAGCG > BA000036/1693901‑1694198 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |