Predicted mutation | ||||||
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RA | BA000036 | 364,912 | A→C | E363D (GAA→GAC) | Cgl0344 → | ATPases involved in chromosome partitioning |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | BA000036 | 364,912 | 0 | A | C | 99.1% | 377.2 / NA | 105 | E363D (GAA→GAC) | Cgl0344 | ATPases involved in chromosome partitioning |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (50/54); total (51/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GTATTTGTTATCTCCTCTGCTAATCCTGGTGAGGGTAAGTCAACCACTTCTGTAAACCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGAAAAGGTCATTGCGGAGCTTGAGGAAAGCTTTGATTATGTGATCATCGATGCCCCTCCGGCGTTGGCGGTTACCGATGCTGCAGTTATTGGTCATGGCAAGGCTGGCATCCTGATTGCGGTCTCCGCAGGTTCTACAAAGAAGCCTGAGTTGGAAGCTACGCTGTCCACGCTTGAGAATGCGGATGCCAATGTTGTTGGCGTTGTCGCTACGATGCTCCCGCCTAAGTCTGTGGCTGGTTATGGCTACGGAAATTACGGCTACGGCGACACCTCCAAAATCAATGCCCCTAAGCCC > BA000036/364616‑365206 | gTATTTGTTATCTCCTCTGCTAATCCTGGTGAGGGTAAGTCAACCACTTCTGTAAACCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAg < 1:233210/300‑1 (MQ=255) tttGTTATCTCCTCTGCTAATCCTGGTGAGGGTAAGTCAACCACTTCTGTAAACCTAGCTTTGGCGCTGGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGt < 1:220949/299‑1 (MQ=255) tGTTATCTCCTCTGCTAATCCTGGTGAGGGTAAGTCAACCACTTCTGTAAACCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGCTCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCCCGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGTGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACACGCGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCAt > 1:155948/1‑300 (MQ=255) tGTTATCTCCTCTGCTAATCCTGGTGAGGGTAAGTCAACCACTTCTGTAAACCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGCGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCCGCTGAGATGGACAAGGTCAt > 1:155967/1‑300 (MQ=255) 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gCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCATTGCGGAGCTTGAGGAAAGCTTTGATTATGTGATCATCGATGCCCCTCCGGCGTTGGCGGTTACCGATGCTGCAGTTATTGGTCATGGCAAGGCTGGCATCCTGATTGCGGTCTCCGCAGGTTCTACAAAGAAGCCTGAGTTGGAAGCTACGCTGTCCACGCTTGAGAATGCGGATGCCAATGTTGTTGGCGTTGTCGCTACGATGCTCCCGCCTAAGTCTGTGGCTGGTTATGGCTACGGAAATTACGGCTACGGCGACACCTCCaaaa < 1:420775/299‑1 (MQ=255) cAGCTGAGATGGACAAGGTCATTGCGGAGCTTGAGGAAAGCTTTGATTATGTGATCATCGATGCCCCTCCGGCGTTGGCGGTTACCGATGCTGCAGTTATTGGTCATGGCAAGGCTGGCATCCTGATTGCGGTCTCCGCAGGTTCTACAAAGAAGCCTGAGTTGGAAGCTACGCTGTCCACGCTTGAGAATGCGGATGCCAATGTTGTTGGCGTTGTCGCTACGATGCTCCCGCCTAAGTCTGTGGCTGGTTATGGCTACGGAAATTACGGCTACGGCGACACCTCCAAAATCAATGcc < 1:494264/299‑1 (MQ=255) tGGACAAGGTCATTGCGGAGCTTGAGGAAAGCTTTGATTATGTGATCATCGATGCCCCTCCGGCGTTGGCGGTTACCGATGCTGCAGTTATTGGTCATGGCAAGGCTGGCATCCTGATTGCGGTCTCCGCAGGTTCTACAAAGAAGCCTGAGTTGGAAGCTACGCTGTCCACGCTTGAGAATGCGGATGCCAATGTTGTTGGCGTTGTCGCTACGATGCTCCCGCCTAAGTCTGTGGCTGGTTATGGCTACGGAAATTACGGCTACGGCGACCCCTCCAAAATCACTGCCCCTCAGccc > 1:81930/1‑299 (MQ=255) | GTATTTGTTATCTCCTCTGCTAATCCTGGTGAGGGTAAGTCAACCACTTCTGTAAACCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGAAAAGGTCATTGCGGAGCTTGAGGAAAGCTTTGATTATGTGATCATCGATGCCCCTCCGGCGTTGGCGGTTACCGATGCTGCAGTTATTGGTCATGGCAAGGCTGGCATCCTGATTGCGGTCTCCGCAGGTTCTACAAAGAAGCCTGAGTTGGAAGCTACGCTGTCCACGCTTGAGAATGCGGATGCCAATGTTGTTGGCGTTGTCGCTACGATGCTCCCGCCTAAGTCTGTGGCTGGTTATGGCTACGGAAATTACGGCTACGGCGACACCTCCAAAATCAATGCCCCTAAGCCC > BA000036/364616‑365206 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |