Predicted mutation | ||||||
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RA | BA000036 | 770,809 | G→A | L1112F (CTT→TTT) | Cgl0738 ← | Type II restriction enzyme, methylase subunits |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | BA000036 | 770,809 | 0 | G | A | 99.0% | 389.0 / NA | 102 | L1112F (CTT→TTT) | Cgl0738 | Type II restriction enzyme, methylase subunits |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (42/58); minor base T (1/0); total (43/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TCAAAGTATCCCTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAGTGAATCAAGCACTGTTTGTGGGTGATAAAGCGACGCAGCACTTAAAAAGTTAATAGATTCCTGCGGAGCGCCATAGACATGTACGCCATATTTAACCAAGTCGTGGACGTCAAAAAGAATCAACTCATTAATGAACTGCCAGTGGCGGCGCAGACGCTCATATGCTCCCCGACGTAGCGGGGCAGCTTTTTTCTCAGTGAAGTGGGATTCGGGGTGGATCAGTGAGATCGCACCTGCCGGGGAGGCATTAGACCAAGTCTTTTCCATAAAGCCCCGGTAGAGGTCCGGGCGTTGAT > BA000036/770514‑771105 | tCAAAGTATCCCTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCCGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAATGaa > 2:364521/1‑300 (MQ=255) 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ccGTCATGATCAAATGAATCAAGCACTGTTTGTGGGTGATAAAGCGACGCAGCACTTAAAAAGTTAATAGATTCCTGCGGAGCGCCATAGACATGTACGCCATATTTAACCAAGTCGTGGACGTCAAAAAGAATCAACTCATTAATGAACTGCCAGTGGCGGCGCAGACGCTCATATGCTCCCCGACGTAGCGGGGCAGCTTTCTTCTCAGTGAAGTGGGATTCGGGGTGGATCAGTGAGATCGCACCTGCCGGGGAGGCATTAGACCAAGTCTTTTCCATAAAGCCCCGGTAGAGGTcc > 2:348196/1‑300 (MQ=255) tCATGATCAAATGAATCAAGCACTGTTTGTGGGTGATAAAGCGACGCAGCACTTAAAAAGTTAATAGATTCCTGCGGAGCGCCATAGACATGTACGCCATATTTAACCAAGTCGTGGACGTCAAAAAGAATCAACTCATTAATGAACTGCCAGTGGCGGCGCAGACGCTCATATGCTCCCCGACGTAGCGGGGCAGCTTTTTTCTCAGTGAAGTGGGATTCGGGGTGGATCAGTGAGATCGCACCTGCCGGGGAGGCATTAGACCAAGTCTTTTCCATAAAGCCCCGGTAGAGGTCCggg > 2:233033/1‑300 (MQ=255) cAAATGAATCAAGCACTGTTTGTGGGTGATAAAGCGACGCAGCACTTAAAAAGTTAATAGATGCCTGCGGAGCGCCATAGACATGTACGCCATATTTAACCAAGTCGTGGACGTCAAAAAGAATCAACTCATTAATGAACTGCCGGTGGCGGCGCAGACGCTCATATGCTCCCCGACGTAGCGGGGCAGCTTTTTTCTCAGTGAAGTGGGATTCGGGGTGGATCAGTGAGATCGCACCTGCCGGGGAGGCATGAGACCAAGTCTTTTCCATAAAGCCCCGGTAGAGGTCCGGGCGTTGAt < 1:159604/300‑1 (MQ=255) | TCAAAGTATCCCTTTTTCTTATCGGTGGTTTCATTCCAGCCACTGGAGAACTGCAGCCCGAGTTCTTTGATACGAGGTGCAGAAGCCAACTTTTCCAACACTGCTGCTGCTTCCGTGTTGACGGTATAAACCATGCGGGTATCCAAGTATGGCGTTTGTTCATCCTCCAGGATGGACTTCCACACCGTCAAAGTATCGGCATTGACCAGTTGGATACGGTCCTTGTGTGGGCGACGGTCCCAGTTGCCATTGTCGTCTTTAAGACCAGGGAGATTACCTGAACCGTCATGATCAAGTGAATCAAGCACTGTTTGTGGGTGATAAAGCGACGCAGCACTTAAAAAGTTAATAGATTCCTGCGGAGCGCCATAGACATGTACGCCATATTTAACCAAGTCGTGGACGTCAAAAAGAATCAACTCATTAATGAACTGCCAGTGGCGGCGCAGACGCTCATATGCTCCCCGACGTAGCGGGGCAGCTTTTTTCTCAGTGAAGTGGGATTCGGGGTGGATCAGTGAGATCGCACCTGCCGGGGAGGCATTAGACCAAGTCTTTTCCATAAAGCCCCGGTAGAGGTCCGGGCGTTGAT > BA000036/770514‑771105 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |