| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NZ_CP034943 | = 767772 | 224 (1.110) | coding (193/645 nt) | EO946_RS03930 | hypothetical protein | |||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
GGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCA > NZ_CP034943/767633‑767911 | ggCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGTCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAgg‑‑‑g > 1:2852747/1‑140 (MQ=255) ggCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGGCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGACGCCTCCCAAGCCACGCACAGCCCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCCATGCCCgg‑‑‑g > 1:1013445/1‑140 (MQ=18) ggCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAgg‑‑‑g > 2:724565/1‑140 (MQ=255) ggCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAgg‑‑‑g > 1:2564645/1‑140 (MQ=255) 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cgccgcTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa > 2:464079/1‑140 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa > 2:2829907/1‑140 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa > 2:2418609/1‑140 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCACCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTCACCATCTGGATAACgc > 2:2592033/1‑139 (MQ=255) cgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCACTGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGCAGCCAGGCCCAGCGCCGCCGCCAAGGCCAGACCATGGGTCACCATCTGGATCACGa > 2:385997/1‑140 (MQ=18) cgcTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGatat > 2:1308187/1‑140 (MQ=255) cgaCCCATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGGCGGAGCCGCCGCCGAAGCCACGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACGATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTc < 1:2924268/138‑1 (MQ=21) cTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATaa < 2:537158/132‑1 (MQ=255) cTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTc > 2:3373462/1‑140 (MQ=255) cTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTc > 2:1834626/1‑140 (MQ=255) gCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCaa > 1:3294042/1‑140 (MQ=255) g‑‑‑gCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGc < 2:1156684/93‑1 (MQ=255) g‑‑‑gCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCa < 1:1333597/140‑1 (MQ=255) | GGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGG‑‑‑GCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCA > NZ_CP034943/767633‑767911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |