| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 2,680,400 | A→T | 10.3% | V417D (GTT→GAT) | EO946_RS13875 ← | LysM peptidoglycan‑binding domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 2,680,400 | 0 | A | T | 10.3% | 378.9 / 4.8 | 164 | V417D (GTT→GAT) | EO946_RS13875 | LysM peptidoglycan‑binding domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/68); new base T (6/10); total (79/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
AGCCGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCTTCTTTCTCTTCTTGACG > NZ_CP034943/2680261‑2680539 | aGCCGCTTCTTTCTCTTCCTGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCaa < 1:2187708/140‑1 (MQ=255)aGCCGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCaa > 2:20284/1‑140 (MQ=255)aGCCGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCaa < 1:3074650/140‑1 (MQ=255)aGCCGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCaa < 1:2388235/140‑1 (MQ=255)aGCCGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTACGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGCGCTCAGCGTGCTGCGGTTGAGCCGGTTATTTGTCTTATTGACGCAGAGCCGGCTCaa > 1:2493214/1‑140 (MQ=18) ccGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCTTGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTGCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCg > 2:389883/1‑140 (MQ=255) ccGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACg < 1:3380883/140‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACg > 2:4232648/1‑140 (MQ=255) ccGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGACTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACg < 1:2603257/140‑1 (MQ=255) ttctCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCgg < 1:4225572/140‑1 (MQ=255) tGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGc < 2:901084/140‑1 (MQ=255) tGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGc < 2:284046/140‑1 (MQ=255) tGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGc < 2:331663/140‑1 (MQ=255) cAGGCTCGGCCTGCTGCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGct < 2:3749915/140‑1 (MQ=255) ggCTCCGGATGCTCCGGTTGAGCAGCTTCTTGCGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGcttc < 2:3669742/140‑1 (MQ=14) gCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCGGCTTCTGTCTCTTCTTGACGGAATGCCGGCTCCACGTGCTCCGGTAGAGCCGCTTCTTCAGcttct > 1:3185542/1‑140 (MQ=18) gCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGcttct > 1:124886/1‑140 (MQ=255) ggCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTGCAGCTTCTTGAc > 2:2538221/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCATCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTGATGCTTCTTGACg > 2:3825716/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACg > 1:2362798/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTGCGGTTGAGCCGCTTCTTGTGCTTCTTGACg > 1:3341445/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTTCTTCTTGACg > 1:3419506/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGAc < 1:4249499/139‑1 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACg > 2:1456725/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACg > 1:4142887/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACg > 2:2954861/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTATGCTTCTTGACg > 1:2229559/1‑140 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTGTCTCTTCTTGACGGTGGGGGGGCTCAACGTGCTGCGGTTGAGCCGCGTCTTCTGCTTCTTGACg > 1:798338/1‑140 (MQ=17) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCGTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCAGGTTGAGCCGCTTCTTCTTCTTCTTGaag > 1:3536082/1‑138 (MQ=255) gCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCGTTATGTTGATGGGGGAGTGGGAGCTCATAGTCCTCCGGGGGAGCCGCTGGTGCTTCTTCTTGACg > 1:210042/1‑140 (MQ=12) cgtGCTCCGTGTGCTCCGATTCTTGCGCTTAATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGGCGCTTCTTTCGCGTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:760427/138‑1 (MQ=14) cccgCTCCGCTTGACCCGCGTCGTCCGCGTCATGACCGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCGACTTTCTCTACTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:3135891/137‑1 (MQ=17) cATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:685759/140‑1 (MQ=255) cATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:1075260/140‑1 (MQ=255) cATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:1582925/140‑1 (MQ=255) cATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:3795156/140‑1 (MQ=255) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGAGGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGTGCCGCTTCTATCTCTTCTTGACGGAGTTCGGGCTCTCCGTGCTCCGGTTGTGGCGCTTCTGGTGCTTGTTGACGGAGTg > 1:4295507/1‑140 (MQ=18) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTTAGCCGCTTCTTGTGCTTCTTGACGGAGTg > 1:1094254/1‑140 (MQ=255) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:543501/136‑1 (MQ=255) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg > 1:543501/1‑136 (MQ=255) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTg < 1:1456725/140‑1 (MQ=255) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTg < 1:937468/140‑1 (MQ=255) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTg > 2:2917179/1‑140 (MQ=255) cTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCGTGATGTTGTTGAGGGTGTGCCGGCTCATCGTGATCCGGTTGAGCCGCGTCTTCTGCTTCTTGagcgactg > 2:1277568/1‑133 (MQ=14) cTCCGATTGAGCCGCTTCGTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTg < 1:1462563/140‑1 (MQ=255) gATTGTGGCGCTTGTTCGGTTTCTTGCCGGCGTTCTTGCTCAGATTCCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTTTTGACGGATTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGTTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCggg < 1:2039442/140‑1 (MQ=17) cttGAGCCGCTTCTTCCGCTTCCTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGc < 2:1746425/139‑1 (MQ=255) cttGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGc < 2:208743/139‑1 (MQ=255) aTTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGc < 1:2419738/140‑1 (MQ=255) aTTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTATGCTTCTTGACGGAGTGCGGGc > 1:928009/1‑140 (MQ=255) aTTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTATCTCTTCTTGACGTGGTGACGGCTCAAAGTGCTCCGGTTGAGCCGCATCATAAGCTTCATGAAGGAATgacggc > 1:2740043/1‑135 (MQ=14) ccGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGtt > 1:3193377/1‑99 (MQ=255) cttcCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTcc < 2:691284/140‑1 (MQ=255) ctcccGCTCCATGACGGAGAGCGCGCTCACCGAGCTCCCGATGACCCGCTTCTTCGTCGTCTTGAGCGACAGCTGGCTCAACGTGCTACGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTcc < 2:3697768/137‑1 (MQ=9) cgtcCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCTGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCTGGCTCATCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTcc < 2:1189801/138‑1 (MQ=255) tcCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCgg > 1:2910012/1‑140 (MQ=255) tGCTGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGATTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCATCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTg < 2:1291209/140‑1 (MQ=255) cGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCg > 1:2443474/1‑113 (MQ=255) cGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGct > 2:1862459/1‑140 (MQ=255) cGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCGTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCg < 2:2443474/113‑1 (MQ=255) gCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCATCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGcttct < 1:998708/140‑1 (MQ=255) cAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTg > 2:1400718/1‑96 (MQ=255) cAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTg < 1:1400718/96‑1 (MQ=255) cAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCGTATGCTTCTTGAGGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGGTGAGCCGCTTCGTCTGCGTCTTGa > 2:1062552/1‑140 (MQ=17) cAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGGGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGa < 1:1913460/140‑1 (MQ=255) gCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACg > 2:4066496/1‑140 (MQ=255) gCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACg > 1:488634/1‑140 (MQ=255) cGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 2:2667285/140‑1 (MQ=255) cGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 1:133024/140‑1 (MQ=255) gCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGc > 1:2437223/1‑104 (MQ=255) gCTCCGGTTGAGCCGCGTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGc < 2:2437223/104‑1 (MQ=255) gtCCGGTTGAGCCGCGTCTTTCTCTTATTGACGTAGTGCAGGCTCTGCCTGCTCCGTTTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATg < 1:1099731/139‑1 (MQ=11) cTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCATCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATg < 2:784141/140‑1 (MQ=255) cTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGGGTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTGGGCGTCTTGACGGAATg > 1:1676115/1‑140 (MQ=17) cTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTGTGCGTCTTTACGGAATg > 2:1993487/1‑140 (MQ=255) cTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATg > 1:2983186/1‑140 (MQ=255) cTCCGGTTGAGCCGCTTCTTGCTCTTCTTCACGGAGTGCGGGCGCAACGTGCTGCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCGTCTTTACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGGTGAGCCGGTACTACATCATCCTGACGGactc > 2:238603/1‑137 (MQ=14) cTCCGGTTGAGCCGCGTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATg < 2:2910012/140‑1 (MQ=255) ggTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTGTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCGTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAgg > 1:4100741/1‑140 (MQ=255) ggTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTTCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCGTCTTATTCTTCTTGACGGAATGCAgg > 1:734955/1‑140 (MQ=255) gTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTATTCTGCTTCTTTACGGAATGGAggg > 1:2327220/1‑139 (MQ=255) gTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCGTGACGGAGTGCGGGCTCACCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGc < 1:3949642/140‑1 (MQ=255) ttGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg < 1:3294394/130‑1 (MQ=255) ttGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACgg > 2:3294394/1‑130 (MQ=255) gAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCa < 2:3054274/140‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGcttct < 2:2430922/119‑1 (MQ=255) ccGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCg < 2:1458911/140‑1 (MQ=255) ccGCTTCTCTCTCTTCGTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCg < 2:3388823/140‑1 (MQ=255) cGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGt < 1:594956/140‑1 (MQ=255) aGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGAc > 2:564188/1‑100 (MQ=255) aGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGGTCCGGTTGAGCTGCttcttt > 1:65801/1‑140 (MQ=255) aGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCttcttt > 1:4052006/1‑140 (MQ=255) aGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCttcttt > 1:3896874/1‑140 (MQ=255) aGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCttcgtt > 1:67355/1‑140 (MQ=255) tGCAGGCTCGGCATGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCAGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTATGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCAGCttctttat > 1:313873/1‑138 (MQ=11) aCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGACTGCAGGCACAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCTTCTTTCTCTTCTTGACg > 2:4270912/1‑140 (MQ=255) aCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCTTCTTTCggttctgttct > 2:4178848/1‑135 (MQ=255) aCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCTTCTTTCTCTTCTTGACg > 2:1370703/1‑140 (MQ=255) aCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCTTCTTTCTCTTCTTGACg > 1:1817610/1‑140 (MQ=255) aCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCTTCTTTCTCTTCTTGACg > 1:770837/1‑140 (MQ=255) | AGCCGCTTCTTTCTCTTCATGACGTAGTGCAGGCTCGGCATGCTCCGATTGAGCCGCTTCTTCCGCTTCATGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTTCTCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAACGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAGTGCGGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCCGCTTCTTCTGCTTCTTGACGGAATGCAGGCTCAGCGTGCTCCGGTTGAGCTGCTTCTTTCTCTTCTTGACG > NZ_CP034943/2680261‑2680539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |