| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 2,018,250 | A→T | 5.0% | I271I (ATT→ATA) | proC ← | pyrroline‑5‑carboxylate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 2,018,250 | 0 | A | T | 5.0% | 374.2 / 7.1 | 110 | I271I (ATT→ATA) | proC | pyrroline‑5‑carboxylate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/52); new base T (3/3); total (55/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TGTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCGGCAC > NZ_CP034943/2018113‑2018389 | tGTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAAt > 1:1211726/1‑140 (MQ=255)tGTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAAt > 1:2139808/1‑140 (MQ=255)tGTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAAt < 2:1895803/140‑1 (MQ=255) gTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGAGTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATc > 2:24935/1‑140 (MQ=255) gTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATc > 2:25054/1‑140 (MQ=255) gTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATc > 2:1391991/1‑140 (MQ=255) ttAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTAGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCg > 2:1810450/1‑140 (MQ=255) aaTGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCt < 2:1229277/140‑1 (MQ=255) gAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCttta > 1:1397909/1‑138 (MQ=255) gCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAAt > 1:2149008/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAAt > 1:986088/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCCTCGCTGATTTCCTTTTAAAGCTTAGCCGCATGATTAATCCCTTGAGAAAt > 1:305429/1‑140 (MQ=255) cTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGCTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGCGCTGCAGTTTTTTCGATATCTTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTTATTGCTTGAGAAATc > 1:1770612/1‑140 (MQ=255) cTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGCTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGCGCTGCAGTTTTTTCGATATCTTAGCTGATTTCCATTGAACGCATAGCCGCATGCTTTATTGCTTGAGAAATc > 1:1770702/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAACTCGCTtc > 1:1397227/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTtc > 2:692276/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTtc > 2:738649/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTtc > 1:570579/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTtc > 1:1475138/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTtc > 1:2379232/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCGTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTtc > 1:825746/1‑140 (MQ=255) tCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTGGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTacgc > 2:1638923/1‑140 (MQ=255) tCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGTACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTacgc > 1:2264636/1‑140 (MQ=255) tCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTccgc > 2:2293762/1‑140 (MQ=255) tCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTccgc > 2:2296008/1‑140 (MQ=255) tCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTccgc > 1:758545/1‑140 (MQ=255) tCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTccgc > 2:837090/1‑140 (MQ=255) gACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGct < 1:45569/140‑1 (MQ=255) ctctTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGctct > 1:1493839/1‑140 (MQ=255) ttCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTc > 1:2248772/1‑140 (MQ=255) ttCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTc < 1:1995833/140‑1 (MQ=255) tGTATCAGGCGTCACTTTCTCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGGCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTg < 2:1147786/140‑1 (MQ=255) tGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCCGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTACTTTGAACGCTTATCCGCAATCTTAATAGCTTTAGAAAAAGATTCAACGCCGCCGCTCATTTTAAATGCTTg > 1:952670/1‑140 (MQ=255) ggTATCAGGCGTCACTGTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGAGATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCGTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTg < 2:2214604/139‑1 (MQ=255) aTCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAg < 2:1416370/140‑1 (MQ=255) aTCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAg < 2:2204814/140‑1 (MQ=255) aTCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGGGCCGCGGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAg < 2:2317540/140‑1 (MQ=255) cAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGcc < 1:2325655/140‑1 (MQ=255) cAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGcc < 1:947941/140‑1 (MQ=255) cAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGGGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGcc < 1:1599705/140‑1 (MQ=255) ggCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCg > 2:413299/1‑140 (MQ=255) ggCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCg > 2:413288/1‑140 (MQ=255) cACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCGTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGgcagc > 1:1686859/1‑140 (MQ=255) aCTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGATCTTTTTCTATTATTGCAGCCCGgcagca < 2:2139808/140‑1 (MQ=255) cTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGAGTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCGTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGcagcag < 2:1919760/140‑1 (MQ=255) aTCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCCTGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTcgt > 2:1138409/1‑140 (MQ=255) aTCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTcgt > 2:312078/1‑140 (MQ=255) aTCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTcgt > 2:1900003/1‑140 (MQ=255) gATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCCTGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCgg < 2:76660/140‑1 (MQ=255) gATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCgg < 1:1411996/140‑1 (MQ=255) aTAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTTAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTACGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGGTCggg > 2:1173041/1‑139 (MQ=255) aTAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGt > 2:1961232/1‑140 (MQ=255) tAGCGGTTCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTg < 2:286166/140‑1 (MQ=255) tAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTg < 2:1312163/140‑1 (MQ=255) aGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGa > 2:134779/1‑140 (MQ=255) ggTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGt > 2:683191/1‑140 (MQ=255) ggTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTATCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTTCAGCCCGGCAGCAGTCGTTGCGTTCGGTGACGt > 1:1914238/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTGCTTTTAACGCTTAGCCGCAAGCTTAATCCCTTGAGAAATAGCGTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTAAAGGCGTGGAGCCCGGCAGCAGTCGTTACGTTCGGTGACGTGa > 1:1378907/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGTAAGCTTAGCCCCATGCTTAATAGCTTGAGAAATCGCTTCTCCCCCGCCGCTCTTTTTCAAAGCATTCAGCCCGGCAGCATTCGTTCCGTTCGGTGACGTGa > 1:1312163/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAACTCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGa > 1:1774092/1‑140 (MQ=255) tGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTg > 1:1735980/1‑134 (MQ=255) tGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGa > 2:2118846/1‑140 (MQ=255) cTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTg < 1:1349954/140‑1 (MQ=255) cTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTg < 1:256436/140‑1 (MQ=255) cTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTg < 2:736121/140‑1 (MQ=255) cTGTTTTTTCGATATCGACGCTGATGTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTg < 2:1606007/140‑1 (MQ=255) tGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATAgtgt < 2:621389/140‑1 (MQ=255) tGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGt < 2:1586947/140‑1 (MQ=255) tGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGt < 2:2334607/140‑1 (MQ=255) tGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGt < 2:1134530/140‑1 (MQ=255) tGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTGAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGt < 2:376127/140‑1 (MQ=255) tttCGATATCTTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTTATTGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCCGCTGCTGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTATCTCtt < 2:1770702/140‑1 (MQ=255) tttCGATATCTTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTTATTGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCCGCTGCTGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTATCTCtt < 2:1770791/140‑1 (MQ=255) tttCGATATCTTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTTATTGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCCGCTGCTGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTATCTCtt < 2:1770612/140‑1 (MQ=255) ttCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTa < 1:2134598/140‑1 (MQ=255) ttCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTa < 1:60414/140‑1 (MQ=255) ttCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTa < 1:1764634/140‑1 (MQ=255) ttCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTa < 2:2345764/140‑1 (MQ=255) atatCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTcgtt < 2:748094/108‑1 (MQ=255) atatCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTcgtt > 1:748094/1‑108 (MQ=255) tatCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGAcc < 1:2037370/140‑1 (MQ=255) tcgtcgCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGACATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTc < 2:2248772/140‑1 (MQ=255) tcgCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAgg < 1:2293762/140‑1 (MQ=255) cTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTg > 2:2132982/1‑140 (MQ=255) ttCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTtctc < 2:348427/140‑1 (MQ=255) ttAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTa < 1:2118143/109‑1 (MQ=255) ttAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTa > 2:2118143/1‑109 (MQ=255) gCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCg < 1:1909182/140‑1 (MQ=255) gCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCg < 1:2132982/140‑1 (MQ=255) gCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCg < 1:683191/140‑1 (MQ=255) gCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCg < 2:2358275/140‑1 (MQ=255) gCTTAATCGCGTGAGAAATCGCTGCTCCGCCGCCGCTCTTTGTCCAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCg < 2:600510/140‑1 (MQ=255) cTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCgg < 1:312078/140‑1 (MQ=255) cTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCgg < 1:1900003/140‑1 (MQ=255) cTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCgg < 1:1138409/140‑1 (MQ=255) ttAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCGGc < 1:1814223/140‑1 (MQ=255) ctAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCGGc < 1:837090/139‑1 (MQ=255) aaTCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCGGCAc > 1:543879/1‑140 (MQ=255) aaTCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTAAATGAGCATTTTTGCGGCAc > 2:118611/1‑140 (MQ=255) aaTCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCGCAGGCGGTTCTCCTGTTTCCATGAGCCTTTTTGCGGCAc > 1:987792/1‑140 (MQ=255) | TGTTAATGAACTGCTTCCAATCTTCACAACGACTCTTTTCATGTTTGTATCAGGCGTCACTTTATCACTCCTGATAGCGGTGCCGCTGTTTTTTCGATATCGTCGCTGATTTCCTTTGAACGCTTAGCCGCATGCTTAATCGCTTGAGAAATCGCTTCTCCGCCGCCGCTCTTTTTCAAGGCTTGCAGCCCGGCAGCAGTCGTTCCGTTCGGTGACGTGATATTGTCTCTTAAGACCTCAGGCTGTTCTCCTGTTTCCATGAGCATTTTTGCGGCAC > NZ_CP034943/2018113‑2018389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |