| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 1,268,722 | T→C | 6.6% | intergenic (+32/‑168) | EO946_RS06595 → / → uxaC | NAD(P)/FAD‑dependent oxidoreductase/glucuronate isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 1,268,722 | 0 | T | C | 6.6% | 285.6 / 6.7 | 91 | intergenic (+32/‑168) | EO946_RS06595/uxaC | NAD(P)/FAD‑dependent oxidoreductase/glucuronate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/31); new base C (3/3); total (57/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGCAAATTCTACACCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCAAAATGTTAACGTTAA > NZ_CP034943/1268584‑1268857 | gTGCAAATTCTCCACCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTATTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAgtg < 1:213088/140‑1 (MQ=255)gTGCAAATTCTACACCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAgtg < 2:2366464/140‑1 (MQ=255) aaaTTCTACACCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAGGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTcc < 2:1779655/140‑1 (MQ=255) acacCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCggg < 1:328395/140‑1 (MQ=255) cacCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAATGTACGATATTTGACACATATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTAATGAA‑TCTGGCATTGCCAAAAGCATTCCTTTccgagt > 2:1981214/1‑135 (MQ=255) cacCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAATGTACGATATTTGACACATATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTAATGAA‑TCTGGCATTGCCAAAAGCATTCCTTTccgagt > 2:1874139/1‑135 (MQ=255) cacCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAATGTACGATATTTGACACATATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTAATGAA‑TCTGGCATTGCCAAAAGCATTCCTTTccgagt > 2:1683706/1‑135 (MQ=255) cacCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGa < 1:787256/140‑1 (MQ=255) cacCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGa < 1:539588/140‑1 (MQ=255) cacCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGa < 1:2075838/140‑1 (MQ=255) cTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCtt > 2:375062/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCtt > 2:1631204/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCtt > 1:1370350/1‑140 (MQ=255) cTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAAt < 1:447508/140‑1 (MQ=255) cTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAAt < 1:1398782/140‑1 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGTCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:25696/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGTCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:25710/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGTCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:2054837/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGa < 2:1865859/125‑1 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGa > 1:1865859/1‑125 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:894214/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 2:2152710/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:660574/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:113109/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:1474854/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:64070/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 2:1512847/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:1386329/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 2:1888319/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 2:1927045/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:157544/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:1650519/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 1:1729249/1‑140 (MQ=255) ttCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATg > 2:2370962/1‑140 (MQ=255) tCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGt < 2:1370350/140‑1 (MQ=255) tCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCtttttt > 1:1244088/1‑140 (MQ=255) tCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCtttttt > 1:2148494/1‑140 (MQ=255) tCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCtttttt > 1:512596/1‑140 (MQ=255) gaAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTa < 1:700995/140‑1 (MQ=255) gaAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTa < 2:1476096/140‑1 (MQ=255) agaagCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTg > 2:931996/1‑140 (MQ=255) agaagCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACAATAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGTACAGTGACAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTACGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTg > 2:116609/1‑140 (MQ=255) aagCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCt > 2:1322398/1‑140 (MQ=255) aagCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCt < 1:2251533/140‑1 (MQ=255) gTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGtt > 2:1631445/1‑140 (MQ=255) gTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGtt > 2:1273199/1‑140 (MQ=255) gTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGtt > 2:1991388/1‑140 (MQ=255) cTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAAcatttcat < 2:512596/140‑1 (MQ=255) cTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAAcatttcat < 2:1244088/140‑1 (MQ=255) cTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTCACGTTAACATTTCAtttt > 1:1633936/1‑140 (MQ=255) cTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCAtttt > 1:2001668/1‑140 (MQ=255) cTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCAtttt > 1:1254148/1‑140 (MQ=255) cTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCAtttt > 1:1497229/1‑140 (MQ=255) cTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCAtttt > 1:514806/1‑140 (MQ=255) cTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTGTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTGTTATTGCTAACGTTAACATTTCAtttt > 1:2001611/1‑140 (MQ=255) tAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGACTGGCTTACTAAACCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCAGGCAATGTCTTTTTTTTTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCa < 2:1671933/140‑1 (MQ=255) tAACTCACATTAAAGGACTTGTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCa < 2:1671932/140‑1 (MQ=255) aaCTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCaa > 1:1605778/1‑140 (MQ=255) acaTTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAag > 1:2075481/1‑140 (MQ=255) acaTTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAag > 1:325443/1‑140 (MQ=255) acaTTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAag > 1:457622/1‑140 (MQ=255) acacgACTGTTCAGCCTGGCGTACAAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCCGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGAtt < 2:2154652/136‑1 (MQ=255) aaaGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGAtt < 2:236110/140‑1 (MQ=255) aaaGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGAtt < 2:1225926/140‑1 (MQ=255) aaaGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGAtt < 2:641350/140‑1 (MQ=255) aCTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATcc < 2:1650519/140‑1 (MQ=255) tttCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTAATGAA‑TCTGGCATTGCCAAAAGCATTCCTTTCCGAGTGCTTTCTGGCAATGTCTTTTTTTATGTTTA‑TGACAGCGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCaaag < 1:1981214/140‑4 (MQ=255) tttCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTAATGAA‑TCTGGCATTGCCAAAAGCATTCCTTTCCGAGTGCTTTCTGGCAATGTCTTTTTTTATGTTTA‑TGACAGCGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCaaag < 1:1874139/140‑4 (MQ=255) tttCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTAATGAA‑TCTGGCATTGCCAAAAGCATTCCTTTCCGAGTGCTTTCTGGCAATGTCTTTTTTTATGTTTA‑TGACAGCGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCaaag < 1:1683706/140‑4 (MQ=255) ttCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTCACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCaga > 1:662280/1‑140 (MQ=255) ttCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCaga > 2:545804/1‑140 (MQ=255) ggattACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAAtata < 2:1200960/137‑1 (MQ=255) ggCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAAtata < 2:948770/140‑1 (MQ=255) cTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATaaa > 1:1646355/1‑140 (MQ=255) cTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATaaa > 1:2125902/1‑140 (MQ=255) aaTCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTCACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGtaaa > 2:976556/1‑140 (MQ=255) aaTCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGtaaa > 2:906930/1‑140 (MQ=255) ttttGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGTtaaaataaaa > 2:713244/1‑140 (MQ=255) ttttGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGtaaaataaaa > 2:1085865/1‑140 (MQ=255) ttttGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGtaaaataaaa > 2:984368/1‑140 (MQ=255) tttGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTaaaataaaaa > 2:1069706/1‑140 (MQ=255) tgtgAACTCGGACATTGCCAATAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTGCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCACAGAAGAGATTGATGCCAGAAGAATATAAAGGTaaaataaaaata > 1:21108/1‑140 (MQ=255) tgtgAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTaaaataaaaata > 1:685948/1‑140 (MQ=255) tgtgAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTaaaataaaaata > 1:2411384/1‑140 (MQ=255) aCTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCa < 1:2370962/140‑1 (MQ=255) aCTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCa < 1:1888319/140‑1 (MQ=255) aCTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCa < 1:1512847/140‑1 (MQ=255) tCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCaaa < 2:113109/140‑1 (MQ=255) tCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTGTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCaaa > 2:248963/1‑140 (MQ=255) cAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCAAAATgttaacgtt < 1:62271/140‑1 (MQ=255) cAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCAAAATgttaacgtt < 1:1140603/140‑1 (MQ=255) aaaGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCAAAATgttaacgttaa < 2:157544/140‑1 (MQ=255) aaaGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCAAAATgttaacgttaa < 2:662280/140‑1 (MQ=255) | GTGCAAATTCTACACCGCTTAAAGGTCTTCCTGCTTCCTTGATGAAAGAAGCAAGTAACGTACGCTACTTAACTCACATTAAAGGACTTTTCAGCCTGGCTTACTAATCCTTTTTGTGAACTCGGACATTGCCAAAAGTGTTCCTTTCGGGATGCTTTCCGGCAATGTCTTTTTTTGTTTTTATTGCTAACGTTAACATTTCATTTTCAAAAAAGAGATTGATCCCAGAAGAATATAAAGGTAAAATAAAAATAAATCAAAATGTTAACGTTAA > NZ_CP034943/1268584‑1268857 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |