| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 1,684,359 | T→C | 5.2% | D26D (GAT→GAC) | sigD → | RNA polymerase sigma‑28 factor SigD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 1,684,359 | 0 | T | C | 5.2% | 499.2 / 11.5 | 153 | D26D (GAT→GAC) | sigD | RNA polymerase sigma‑28 factor SigD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/85); new base C (5/3); total (65/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
GCATATTCGAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATATGATGCCCTTGAAAAATTTGACCCCA > NZ_CP034943/1684220‑1684498 | cATATTCGAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGAtt > 2:733547/1‑140 (MQ=255) cATATTCGAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGAtt > 1:836478/1‑140 (MQ=255) cATATTCGAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGAtt > 1:1436739/1‑140 (MQ=255) tagAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGTTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTTTGAAGATCATGTGCTTTTGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATg < 2:1160658/138‑1 (MQ=255) tCGAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATg < 2:1682571/140‑1 (MQ=255) tCGAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATg < 2:1661012/140‑1 (MQ=255) gAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATgcg < 1:852825/140‑1 (MQ=255) gAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATGTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATgcg < 2:1764675/140‑1 (MQ=255) gTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGtt < 2:1297979/140‑1 (MQ=255) aaaCAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACa > 1:339054/1‑140 (MQ=255) aCAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATg < 1:2140853/140‑1 (MQ=255) ggTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGc < 2:1898318/140‑1 (MQ=255) ggTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGc < 1:998071/140‑1 (MQ=255) ggTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGc < 1:1989435/140‑1 (MQ=255) ggTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGc < 1:1298939/140‑1 (MQ=255) ggTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGc > 1:721849/1‑140 (MQ=255) ggTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGACTTAATGCGCCGTTACATGCCGc > 1:364308/1‑140 (MQ=255) ggTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATGAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGc < 1:1589545/140‑1 (MQ=255) gTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCt < 2:522951/140‑1 (MQ=255) tGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCtt > 2:23391/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGAGCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGt < 1:2102710/140‑1 (MQ=255) aCGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCGTGTCACat < 1:610154/140‑1 (MQ=255) taattaaGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATg < 1:1738449/140‑1 (MQ=255) taattaaGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATg < 1:1573472/140‑1 (MQ=255) taaGGTATCAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAgg < 1:2211448/140‑1 (MQ=255) aTTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCAGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGATTGTCACATATCATGTAGGCAGAAt < 1:2303611/140‑1 (MQ=255) ggATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATgcg > 1:2433880/1‑94 (MQ=255) ggATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTc > 1:1026502/1‑140 (MQ=255) gATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCg < 2:648260/140‑1 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGTAACGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATTCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 1:494216/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 1:2074081/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 2:551352/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 1:530917/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 2:753626/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 1:142665/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 2:385932/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 2:455024/1‑140 (MQ=255) aTAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCgg > 2:44075/1‑140 (MQ=255) tAACAATTCAATCCTGGAATTATGAATATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGTAAAGAGCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATCTCCTGTAGGCAGAATTTCTGTCGGa < 1:1302845/140‑1 (MQ=255) tAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGa < 1:1818307/140‑1 (MQ=255) tAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGa < 1:1723608/140‑1 (MQ=255) aTGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGACAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTgac > 1:1455711/1‑138 (MQ=255) aTGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGcc > 1:1390756/1‑140 (MQ=255) aTGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGcc > 1:1390762/1‑140 (MQ=255) tGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAACGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCg > 2:305254/1‑140 (MQ=255) tGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCg > 2:3520/1‑140 (MQ=255) aaTCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGaaa > 2:1966598/1‑140 (MQ=255) tCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATg < 2:2248617/90‑1 (MQ=255) tCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATg > 1:2248617/1‑90 (MQ=255) tCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATc > 2:2121742/1‑140 (MQ=255) tCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGACTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATc > 2:1652322/1‑140 (MQ=255) cTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAg > 2:1859364/1‑140 (MQ=255) cTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAg > 2:2328098/1‑140 (MQ=255) ttGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGt > 2:2212368/1‑140 (MQ=255) gAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGACTTAATGCGCCGTTACATGCCGc > 1:787100/1‑89 (MQ=255) gAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGACTTAATGCGCCGTTACATGCCGc < 2:787100/89‑1 (MQ=255) aTGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATc > 2:2066978/1‑130 (MQ=255) aTGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATc < 1:2066978/130‑1 (MQ=255) tGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGACTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAg < 2:85977/140‑1 (MQ=255) gATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGa < 2:1791862/140‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCtt < 2:1436739/140‑1 (MQ=255) aGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCtt < 2:836478/140‑1 (MQ=255) gTGCTTTGGTCGCGCTGGATAGAGTGGAATGATCGTAAAGCCGTGTACGATTTAATGGGCCGTTAGATGCGGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTAt < 2:1250642/140‑1 (MQ=255) gTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATCTCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTAt < 1:1761132/140‑1 (MQ=255) cTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAg < 2:1543224/140‑1 (MQ=255) ttGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCGAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCGTGTCACATATCATGTAGGCAGCATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGCTCTTATGAGcc < 1:2321097/140‑1 (MQ=255) gACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTg > 2:1051713/1‑140 (MQ=255) gACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTg > 2:505195/1‑140 (MQ=255) cgcgCTGGAAAGAGTGGACAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAACTCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGt < 1:1006003/140‑1 (MQ=255) cgcTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTAt < 2:1723629/140‑1 (MQ=255) gcTGGAAACAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGACTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATg > 2:595504/1‑140 (MQ=255) cTGGAAAGAGTGTAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGc < 2:70481/140‑1 (MQ=255) cTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATc > 1:1306851/1‑105 (MQ=255) cTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATc < 2:767998/105‑1 (MQ=255) cTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATc > 1:767998/1‑105 (MQ=255) cTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGc < 2:723982/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 2:339054/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 1:1207124/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 2:1586459/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 2:2196603/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 1:883732/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 1:656555/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 1:288078/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 1:2223265/140‑1 (MQ=255) aggAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCt < 1:1806413/139‑1 (MQ=255) ggAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCtt < 1:90946/140‑1 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGt < 1:753626/140‑1 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGt < 1:44075/140‑1 (MQ=255) gagTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGttt < 2:348103/140‑1 (MQ=255) agTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGt < 2:950444/137‑1 (MQ=255) agTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGt > 1:950444/1‑137 (MQ=255) agTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCACAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTta > 1:1375845/1‑140 (MQ=255) ggAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTatat > 2:201985/1‑140 (MQ=255) aaaGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGAAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATatga > 1:1607520/1‑140 (MQ=255) cTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATATGATGCCCtt > 2:1865523/1‑140 (MQ=255) ggTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATATGATGCCCTTGAAAAAtt > 1:556368/1‑140 (MQ=255) gTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATATGATGCCCTTGAAAAAttt > 1:1446383/1‑140 (MQ=255) gTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATATGATGCCCTTGAAAAAttt > 2:1025801/1‑140 (MQ=255) gTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTGTATATGATGCCCTTGAAAAAttt > 2:1580128/1‑140 (MQ=255) tttAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATATGATGCCCTTGAAAAATTTGACCCCa > 2:705687/1‑140 (MQ=255) | GCATATTCGAACTGTTAAACAAGGTGAAAAAACGATTTAATTAAGGTATTAGGGGGATAACAATGCAATCCTTGAATTATGAAGATCAGGTGCTTTGGACGCGCTGGAAAGAGTGGAAAGATCCTAAAGCCGGTGACGATTTAATGCGCCGTTACATGCCGCTTGTCACATATCATGTAGGCAGAATTTCTGTCGGACTGCCGAAATCAGTGCATAAAGACGATCTTATGAGCCTTGGTATGCTTGGTTTATATGATGCCCTTGAAAAATTTGACCCCA > NZ_CP034943/1684220‑1684498 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |