| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 607623 = | 273 (0.990) | 24 (0.090) +AGTAGCCCCT |
17/248 | 5.6 | 7.4% | coding (466/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
| ? | NZ_CP034943 | = 607846 | 374 (1.350) | coding (689/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607656‑607623‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTG < NZ_CP034943/607846‑607708 |||||||||| TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTTGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCT < 2:1513254/140‑1 TCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGG < 2:687896/140‑1 gCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGGCCCCAGTCGCCCCTGGGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT < 1:1425193/139‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGg > 1:1525917/1‑139 GTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTAGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGGCCCGGTGGCTCCCGGCGCTCCGGGTGG > 1:556725/1‑140 tgGCTCCGGCTGGTGCGACGTCCCCAGTAGCGCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGT < 2:3180927/138‑1 TCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGT < 2:1027436/140‑1 TCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGT < 2:1027346/140‑1 TCGCGCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGGGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGT < 1:322735/140‑1 CTCCGGCTGGTGCGACTTCCCCAGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCGGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCG < 2:1849019/140‑1 TCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGG > 2:1507092/1‑140 CCGCCTGGTCCGACGTCCCCAGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 2:875774/140‑1 GCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 2:1526975/140‑1 GCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 2:3017844/140‑1 GTCCGCCGTCCCCCGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCG < 2:2183354/140‑1 TCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCGTCACCGG > 2:3786044/1‑140 TCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGG < 1:627804/140‑1 acgTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCGCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGC < 1:2543380/137‑1 gCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 2:676275/139‑1 CCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 1:4162575/140‑1 CCCTGTAGCCCCGTTGGCTCCTGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCCGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 2:2946963/140‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGGTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGGCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 2:3928722/140‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG < 1:3744616/140‑1 cccGTAGCCCCTGGGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT < 2:3738582/137‑1 CCAGTAGCCCCGGGGGCTCCCCGCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGGCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT < 2:3944856/140‑1 TAGCCCGGGTGGGTCCCGTCGCCGCGGTTGGTCCGGCTGCGCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGGCCCCAGTCGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:3493569/140‑1 TAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTCGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:978876/140‑1 TAGCCCCAGTGGCTCCCGTCTCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGGCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:2422140/140‑1 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGCCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTAGCTCCGGGTGGGCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:2936261/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:4068301/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:2936325/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCGCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGGAGCTCCTGTGGCTCCG > 1:4206358/1‑140 CCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGG < 2:3149943/140‑1 CCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGG < 1:2676240/140‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCTGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTC < 1:2454020/71‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCGGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTC > 2:2454020/1‑71 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGC > 1:2418405/1‑140 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGCCCCTGTCGCTCCCGTCGCGGCGGGTGGGCCGGCTTCGCCGGTAGCTCCTGGCGGTCCGGg > 1:1002897/1‑139 CCTGTGGCTCCCGTCGCACCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGAAGTCCCCAGTAGCCGCTGTGGCTCCCGTCGCGCCGGTTGGTCCCGCTTCCCCGGTCGCTCGTGTCGGTCCGGg > 1:530311/1‑139 TGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCGGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTGCCCCGGTAGCTCCTGTGGCTCCGGCTG > 1:3090812/1‑140 TGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTG > 1:2966681/1‑140 |||||||||| TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607656‑607623‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCTCCTGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTG < NZ_CP034943/607846‑607708 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |