| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 607479 = | 224 (1.120) | 3 (0.020) | 3/218 | 9.2 | 1.9% | coding (322/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
| ? | NZ_CP034943 | = 607604 | 133 (0.820) | coding (447/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607642‑607479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcttccccggtagctcctgtcgctccGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCTGT < NZ_CP034943/607604‑607467 CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGC > 1:216866/1‑140CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGC < 1:1570282/140‑1CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCACCAGGAGACCCTGTGGCGCCCGTGGCCCCGGCTGGTCGGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCCGCTGGTGCAGC > 1:1311514/1‑140 GGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGGTGGTCCAGCTT > 2:2701029/1‑140 GGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCGGGTCCGGCTTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTCGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCgt > 2:679470/1‑138 GCTGGTCCGGCTTGCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTC < 2:939831/140‑1 cCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGG > 1:2785938/2‑140 TCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGG > 1:1823185/1‑140 TCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCGTCCCCGG > 1:1227101/1‑140 gcgtCTTCCCCGGTAGCTCCGGTCTCTCCGGCCGGTCCGGCGTCTCCCGTAGCCCCTGTCGCTCCGGTGGCGACGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGTTGGTCCAGCTTCCCCGGT < 1:2533863/136‑1 gCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTACGGCTGGTGCGGCTTCCCCTCTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCACGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGT < 2:2583418/139‑1 cgGGCGTCCCCGGTCGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTGCCCCAGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGT < 2:2401336/138‑1 CCGGCGTCCCCGGTCGCTCCGGTCGGTCCGGCTCGTGCGGCCTCCGCGCTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGT < 2:1179428/140‑1 CCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGT < 2:48231/140‑1 GGCTTCCCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGCTCCGGCTTCGCCAGGAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAG < 2:2922851/140‑1 CCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGGCCGGCTTCCCCGCTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCCGCTTCCCCGGTAGCTCCTG > 2:2981691/1‑140 CCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGCAGGTCCGGCTTCGCCTGTTGCCCCTGTGGCTCCTGTGGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT < 1:2620153/140‑1 gAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCCGTAGCCCCTGGGGCTCCGGTGGCTGCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 1:224968/139‑1 TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGGCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCCGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:882272/140‑1 GTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGGCGCTCCAGCTGGTCCAGCTGCCCCGGGAGCTCCGGTGGCTCCGGgcgc > 2:742242/1‑136 CCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAG > 1:1474581/1‑90 CCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAG < 2:1474581/90‑1 CCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGC < 1:2064641/134‑1 CCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGC > 2:2064641/1‑134 CGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTT > 1:2675823/1‑68 CGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCAGCTT < 2:2675823/68‑1 GCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGT > 1:3074015/1‑56 GCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGT < 2:3074015/56‑1 GCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCC > 1:2161806/1‑51 GCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT > 2:709279/1‑47 GCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGT < 1:709279/47‑1 CTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 2:1408621/37‑1 CTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC > 1:1408621/1‑37 ccgttctCTCCTGTCTCTCCGGCTGCTCCGTCTGCCCCTGTATCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCTGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT < 1:1570840/133‑1 GTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGC < 2:98617/140‑1 TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 2:1683500/140‑1 TCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGTCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTG < 1:1335213/140‑1 CCTGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCTTCACCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCGCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGT < 2:2619876/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGT < 2:2851876/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGT > 1:2144457/1‑140 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGT < 2:407166/140‑1 TGTCGCTCCGGCAGGTCCGGCTTCCCCCGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTGGCACAGGCTGGTCCGGCTACGCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCG < 1:3066289/140‑1 GTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGC < 1:2365591/140‑1 GTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCC < 1:254878/35‑1 TCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCTGTAGCTCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCAGATGGTACAGCTTGCCCGGTAGCGCCTGTCGCTCCTGTGGCT > 1:133881/1‑140 CTCCGGCTGCTCCGGCTTCCCCCGTAGGCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCT < 2:2044466/140‑1 CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCTGT > 1:2108840/1‑140 CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCTGT > 1:3052269/1‑140 CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCGGTCGCTCCTGTCGCGCCTGT > 1:1313576/1‑140 CCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607642‑607479‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcttccccggtagctcctgtcgctccGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTGGCCCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCCGTCGCTCCAGCTGGTCCAGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCTGTCGCTCCTGT < NZ_CP034943/607604‑607467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |