| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | 607566 = | 207 (0.660) | 87 (0.280) | 37/248 | NT | 22.9% | coding (409/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein |
| ? | NZ_CP034943 | = 607835 | 382 (1.240) | coding (678/1125 nt) | EO946_RS03185 | collagen‑like protein | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607644‑607566‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCC < NZ_CP034943/607835‑607697 CTCCGGCTTGTCAGGCTTAGCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTGCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCTTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCA < 2:1378191/140‑1 cgtgtTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGT < 2:110952/135‑1 ggtTGGTCCGGCTTACCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAG < 2:265038/137‑1 gttgtTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTGGCTCAGGCTGGTGCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC < 2:2279205/135‑1 gtTGGTCCGGGTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC < 2:4158749/138‑1 gtTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC < 1:3737904/138‑1 gtTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC < 1:264176/138‑1 gtTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC < 2:4370839/138‑1 gtTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC > 1:4145128/3‑140 gtTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGC < 2:2393103/138‑1 GTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCT < 1:230135/140‑1 TCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTG < 1:4397688/140‑1 gcgTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGC < 2:3000603/137‑1 GCTTCGCGGGTAGCTGCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGC < 2:2695815/140‑1 GCTTACCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGC < 2:3499365/140‑1 cgCGGTAGCTTCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCG < 1:4777709/138‑1 CCGCTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCACCGGCTGGACCGACTTCCCCAGTAGACCATGTGGCTCCCGT > 2:4176339/1‑140 CGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTC > 2:3396165/1‑140 TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCT < 2:658559/140‑1 TAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGGAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCT < 2:101534/140‑1 CTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACTTCCCCAGTAGCGCCTGTGGCTCCGGTCGCTCCG > 2:702927/1‑140 gaCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCGCCAGTTGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGG < 1:2803115/138‑1 TCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGc > 1:4688620/1‑139 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTCGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT < 2:4767450/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT < 2:2294580/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT < 2:5097889/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGT < 2:5097972/140‑1 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCATGTGGC > 1:5191966/1‑125 CCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCATGTGGC < 2:5191966/125‑1 CTCCGGCTGGTGCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCG < 1:3722286/140‑1 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCTGTAGCCCCTGTGGCTCCGGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCG < 2:4293362/140‑1 CTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCG < 2:4811918/140‑1 CCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 1:2996896/140‑1 CCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 1:288997/140‑1 CCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGGAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 1:3476753/140‑1 CCGGCTGGTCCGACGTCCCCACTAGCCCCTGGGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGGAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 1:692060/140‑1 CCGGCGGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGC < 1:1335944/140‑1 GCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 1:2118006/140‑1 GCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGGGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 1:1852851/140‑1 GCTGCTCCTCCTGCCCCAGTAGCCCCCGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTC < 1:1300825/140‑1 CTGGTGCGACGTCCCCAGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCC < 2:2192640/140‑1 CTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGGGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCC < 2:3714709/140‑1 GTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGCCGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCGGTCGCTCCGGTGGGTCCGGCTTCCCCG > 1:1035173/1‑140 TCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCGAGTAGCCCCTGGGGCGCCCGTCGCTCCGGTTGGACCGGCTTCGCCGG > 1:3047188/1‑140 TCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGG < 2:122270/140‑1 tactgCCCCTGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 1:1116847/135‑1 gacgTCCCCCGTCGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCAGGATGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTTGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 1:1304143/136‑1 gacgTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 1:5181592/136‑1 cgTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGGGGGTCCGGCGTCACCGGTAGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGGGGTGCGGGTGCACCGGTGGCT > 2:2267108/3‑140 gTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTC > 1:4608365/2‑140 CCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 1:3396165/140‑1 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTG > 1:4838067/1‑140 CCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGGGGTCCGGGTGCCCCGGTCGCTCGTG > 2:517180/1‑140 CCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCGCTGTGGCTCCCGTCGCGCCGGGTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGT > 2:3065776/1‑140 AGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCG > 1:4494710/1‑140 AGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGGCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCG > 1:4331260/1‑140 TAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 1:1238666/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCCGTAGCCCCAGTGGCTCCCGGCGCGCCGGGTGGGGCGGATTGCGCGGTAGCGCCTGTCGCTCCG > 1:1248204/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTGCGGGTTCCCCGGTCGCTCCTGTCGCTCCG > 1:4800763/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:2525405/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGGCGCTCCGGTTGGGCCGGGTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCG > 1:4018945/1‑140 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGC > 2:315047/1‑91 CCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGC < 1:315047/91‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGCCGTCCCCCGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGGCCGGCTGCACCGGTAGCTCCTGTGGGTCCGGC > 1:160636/1‑140 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGT < 1:3134524/77‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT > 2:4159348/1‑54 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCT < 1:4159348/54‑1 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG > 1:624974/1‑43 CCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAG < 2:624974/43‑1 CTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCT < 2:4145128/140‑1 TGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTG > 1:3664783/1‑140 TGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGCGTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTG > 1:687139/1‑140 TGTCGCTCCGGTCGCTCGGGGTGGTCCTGATTCCGCTGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTGCGACGTGCCCAGTCGCCCCGGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTG < 2:3575270/140‑1 GTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCGTCCCCAGTAGCGCCTGTGGCTCCCGTCGCTGCGGGTTGTCCGGGTTCACCGGTAGCTCCTGGGGCTCCGGCTGG > 1:624632/1‑140 GTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGGTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGgggc > 1:2399248/1‑136 GTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGGTGGTCCGGGTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGG > 1:4972034/1‑140 GTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGAC < 2:1398805/65‑1 GTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGAC > 1:1398805/1‑65 GTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCG > 1:4087614/1‑36 CTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCG < 2:4493370/140‑1 CCCTTCGCTGCTGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 2:4332494/140‑1 CCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 1:1161563/140‑1 CCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 2:4015760/140‑1 CCCGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTTTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGGGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGC < 2:2388576/140‑1 CCGTCGCTGCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCT < 2:1738527/140‑1 CCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCT > 1:5130951/1‑140 CCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT < 2:3513566/38‑1 CCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCT > 1:3513566/1‑38 CGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCcg > 2:4177084/1‑45 CGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCcg < 1:4177084/47‑3 GTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGacgtc < 1:4178825/140‑6 GTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGacgtc < 1:583580/140‑6 GTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGacgtc < 2:1183350/140‑6 GTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGacgtc < 1:4191667/140‑6 GTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTC < 1:2638344/140‑1 GTCGCTCCGGTTGGTACGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCGCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGacgtc < 1:3264987/140‑6 TCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCC < 2:494583/140‑1 TCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCC < 2:1238666/140‑1 TCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGT < 2:4618124/64‑1 TCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGT > 1:4618124/1‑64 CTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP034943/607644‑607566‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGACGTCCCCAGTAGCCCCTGTGGCTCCCGTCGCTCCGGTTGGTCCGGCTTCCCCGGTAGCTCCTGTCGCTCCGGCTGGTCCGGCTTCC < NZ_CP034943/607835‑607697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |