| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NZ_CP034943 | 1,936,643 | A→C | 5.3% | D3536E (GAT→GAG) ‡ | EO946_RS09735 ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP034943 | 1,936,643 | 0 | A | C | 5.3% | 1136.4 / 13.0 | 407 | D3536E (GAT→GAG) ‡ | EO946_RS09735 | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (159/212); new base C (31/4); total (190/217) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.34e-07 | |||||||||||
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Only 100 of 420 total aligned reads displayed.
GTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAACAGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTCCTAACA > NZ_CP034943/1936506‑1936782 | ttCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGAATGAACTTGGGTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCTCTCCGGCAAATAACAGAAGACCCAGCCGTACAGCATCCCcataat > 2:3608583/1‑140 (MQ=255) tCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTTGAAGTGGCTCTCCACCAATTAAAATATGACGAACCGGTACTCCTTCCCcaacaaa > 1:2460940/1‑138 (MQ=255) ggTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAACAGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTg < 1:4879275/140‑1 (MQ=255) ttGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAACAGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCa < 2:2706572/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAAATAAAAGATGACGAAGCGGTACTCCTTACCCAACAACTGCAGCTACCagcagcgt > 2:812589/1‑138 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCGCTCCTCCAATTAACAGATTAAGAAGCGGTACTACTTACCCATCATCTGCAGCTAACAGCAGCtt > 2:4366787/1‑140 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCTCTCCGCCAATTAACAGATTACGAAGCGGTACTACTTCCCCAACATCAGCAGCTACCACCACCtt > 2:185355/1‑140 (MQ=255) tttGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTGTTTGGAAGTGCCTCTCCGCCAATTAAAAGAAGACCAAACGGTACACCTTCCACATCAAGTGCACCTACAaccagcat > 2:4746301/1‑138 (MQ=255) tgtgATGGCATGTGCTGCTCTATCCTCGCCAAATAAGTGTATGAAATTGGTTACCGTCGTGTTTGGAATTGCCACTGCTCCACTTAACCGAAGAAGGAGCGGGACTCCGTCCCCATGATAAGCAGCGACCACCAGATTCa > 2:2926837/1‑140 (MQ=255) tgtgATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTTGTAGTGCCGCGCCTCCAATTAACAGATTACGAAGCCGGACTACTTACCCATCATCTGCACCTACCAGCAGCATCa > 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tCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTcc > 2:1749207/1‑140 (MQ=255) tCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTcc > 1:3095088/1‑140 (MQ=255) tCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTcc > 1:4027028/1‑140 (MQ=255) tCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGAACCCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTcc > 1:4984795/1‑140 (MQ=255) tCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGCCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAgg < 1:3800718/119‑1 (MQ=255) ccccATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTCCt < 2:4475421/140‑1 (MQ=255) ccATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTCCTaa > 2:4057331/1‑140 (MQ=255) ccATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTCCTaa > 2:3133623/1‑140 (MQ=255) atcatcTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTCCTaaca > 2:88040/1‑140 (MQ=255) | GTTTCGGTTGGTCCATATACATTTGTGATGGCAGGTGCTGCTCTATCCGCGCCAAATAAGTGTATGAACTTGGTTACCGTCGTTTTTGGAAGTGCCTCTCCTCCAATTAACAGATGACGAAGCGGTACTCCTTCCCCATCATCTGCAGCTACCAGCAGCTTCAAATGGGCGGGCGTCCCGTCGGTTACGTCAATGCGATGCTGTCGATAGTATTGGCATAAGGCCTCGCCATCAGACACCGCCTCTTTAGGAACGATAAACAAGGTATGTCCTAACA > NZ_CP034943/1936506‑1936782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |