BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NZ_CP034943	2,073,360	A→T	7.3%	G311G (GGT→GGA)	EO946_RS10385 ←	NTTRR‑F1 domain

Read alignment evidence...
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*	NZ_CP034943	2,073,360	0	A	T	7.3%	494.5 / 4.9	168	G311G (GGT→GGA)	EO946_RS10385	NTTRR‑F1 domain
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (84/67); new base T (10/3); total (97/71)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.57e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 176 total aligned reads displayed.

TTACTCCCGTTACTCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTCGCA  >  NZ_CP034943/2073221‑2073495

ttactcccgttactcccgttactcccgTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGa                                                                                                                                         <  2:4772170/140‑1 (MQ=255)

ttactcccgttactcccgttactcccgTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGa                                                                                                                                         <  1:511890/140‑1 (MQ=255)

ttactcccgttactcccgttactcccgTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGa                                                                                                                                         <  1:2332222/140‑1 (MQ=255)

ttactcccgttactcccgttactcccgTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGa                                                                                                                                         <  1:3522967/140‑1 (MQ=255)

     cccgtttctcccgttcctcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGGTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGt                                                                                                                                    <  1:4319674/140‑1 (MQ=255)

     cccggtactcccggttctcccgttGCGCCAGGTTCCCCGGGTGCACCAGTTGATCCCGGTGCACCACTTGATCCCGGTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGt                                                                                                                                    <  1:4580765/140‑1 (MQ=25)

        gttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGCTCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTgg                                                                                                                                 <  2:1309148/140‑1 (MQ=255)

        gttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTgg                                                                                                                                 >  2:3546066/1‑140 (MQ=255)

        gttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTgg                                                                                                                                 <  1:3113988/140‑1 (MQ=255)

        gttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTgg                                                                                                                                 >  2:2454483/1‑140 (MQ=255)

        gttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTgg                                                                                                                                 <  2:2786352/140‑1 (MQ=255)

        gttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGATGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTgg                                                                                                                                 <  1:4812251/140‑1 (MQ=255)

         ttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGGACCAGTTGGTCCAGTTggg                                                                                                                                >  2:2382665/1‑139 (MQ=18)

         ttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGt                                                                                                                                >  1:5139567/1‑140 (MQ=255)

         ttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACATGTTGGt                                                                                                                                >  1:3180016/1‑140 (MQ=255)

         ttactcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCAGTAGCACCCGTGGCTCCGGTTGATCCAGTTGGTCCTGTTgct                                                                                                                                >  2:2658986/1‑138 (MQ=14)

             tcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTg                                                                                                                            >  2:3892532/1‑140 (MQ=255)

             tcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGGTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTAGCACCAGTGGCTCCTGTTGGTCCCGTAGGACCTGTTCGTCATg                                                                                                                            >  2:68625/1‑140 (MQ=18)

              cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCTGTTGATCCAGTTGCTCAAATTGAGCCCGTGGCTCGGGATGATGACGTATCTCGCGTCGCACAAGTAGCTCATGTTGATCCCGTGGGGCGGGTTGGTGCTGt                                                                                                                           >  2:2883141/1‑140 (MQ=9)

              cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTGGCTCCTGTTGCTCCTGTTGCTCCGGTTTCTCCTGTTGGTCCTGt                                                                                                                           >  2:3846035/1‑140 (MQ=14)

              cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCGCCTGTTGATCCCGTTGCTCCGGTGGATCCAGTTGCTCCTGTTGATCCGGTTCCTCCTGTGGCTCCTGt                                                                                                                           >  2:1725770/1‑140 (MQ=11)

              cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTGGCTCCCGTTCCACCCCTTGATCCCGGTGCTGCTGTTGATCCGGTTTCTCCCGTCGCACCAGTGGGTCCTGTTGCTCCCGTTGGGGGTGTGGGTCCGGt                                                                                                                           >  2:3168847/1‑140 (MQ=17)

                cgttactcccggtGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAg                                                                                                                         <  1:2535709/140‑1 (MQ=255)

                 gttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCGGTTGATCCCGTTGCTCCCGTGGCTCCGGTGGCTCCTGTTGTTCCCGGTGGACCGGTTGGTCCGGtgga                                                                                                                        >  2:2202118/1‑137 (MQ=18)

                  ttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCCGTGGCTCCTGTTGCTCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCt                                                                                                                       >  2:2794022/1‑140 (MQ=255)

                  ttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGGTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCt                                                                                                                       <  1:4798901/140‑1 (MQ=255)

                  ttactcccggtGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGGTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCt                                                                                                                       <  1:5080060/140‑1 (MQ=255)

                      tcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTGGCTCCGGTTGCTCCCGTTGCTCCCGTTGGTCCTGTGGGTCCGGTAGCTCCAg                                                                                                                   >  2:3683504/1‑140 (MQ=17)

                         cgttGCTCCAGTTTCCCCCGTTGCTCCAGTTGATCCCGTTGCTCCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTg                                                                                                                <  2:864630/140‑1 (MQ=255)

                                    tttCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAccagtggct                                                                                                     <  2:374532/140‑1 (MQ=255)

                                             ttgcaccagttgatcccgttgcaccagttgatcccgTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAccagtggctccagtggct                                                                                            <  1:2555465/140‑1 (MQ=255)

                                             gtgcaccagttgatcccgttgcacgagttgatcccgtTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAccagtggctccagtggct                                                                                            <  1:4048857/139‑1 (MQ=255)

                                              tgcaccagttgatcccgttgcaccagttgatcccgtTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACcagtggctccagtggctc                                                                                           >  1:1319389/1‑140 (MQ=255)

                                              tacgccagttgctccggttgcaccagttgttcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAcca                                                                                                           <  1:3733478/120‑1 (MQ=17)

                                              tacgccagttgctccggttgcaccagttgttcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAcca                                                                                                           >  2:3733478/5‑124 (MQ=17)

                                                caccagttgatcccgttgcaccagttgatcccgttgCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAgtggctccagtggctcca                                                                                         >  1:4291811/1‑140 (MQ=255)

                                                  ccagttgatcccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTggctccagtggctccagt                                                                                       <  1:1013143/140‑1 (MQ=255)

                                                     gttgatcccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTAc                                                                                    >  2:1610406/1‑140 (MQ=255)

                                                      ttgatcccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACt                                                                                   >  1:2754495/1‑140 (MQ=255)

                                                      ttgatcccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACt                                                                                   <  1:2346847/140‑1 (MQ=255)

                                                       tgatcccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTc                                                                                  >  2:3037031/1‑140 (MQ=255)

                                                          tcccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTAGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCAGTTGGACCTGTTTCTCCTGTAGCTCCAGTAGCTCCAGTGGCTCCAGTTGCTCCAGTTACTccag                                                                               >  2:2546219/1‑138 (MQ=18)

                                                           cccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAccagtggctccagtggct                                                                                            >  2:4748188/1‑126 (MQ=255)

                                                           cccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAccagtggctccag                                                                                                 <  2:837828/121‑1 (MQ=255)

                                                           cccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCAccagtggctccag                                                                                                 >  1:837828/1‑121 (MQ=255)

                                                           cccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGt                                                                              >  2:1119258/1‑140 (MQ=255)

                                                           cccgttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGt                                                                              >  2:1276756/1‑140 (MQ=255)

                                                               ttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTGGCACCAGTGGCGCCTGTTGATCCCGTTGGTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCCGTGGCTCCCGTGGCTCCAGTTGCTCCCGTTgcg                                                                          >  2:1640953/1‑140 (MQ=18)

                                                               ttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCCGTTACTCCCGATgcg                                                                          >  2:2978692/1‑140 (MQ=255)

                                                               ttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTGCCGTTgcg                                                                          >  2:3176554/1‑140 (MQ=255)

                                                               ttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTgcg                                                                          >  1:1605576/1‑140 (MQ=255)

                                                               ttgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCACTGGCTCCTGTTGATCCAGTGGCTCCTGTAGCTCCTGTAGCTCCAGTTGAACCAGTGGCTCCAGGGGCTCCCGTCACTCCCGTTgcg                                                                          >  2:3077175/1‑140 (MQ=21)

                                                                tgcaccagttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGGTCCAGTTACTCCCGTTgcgc                                                                         >  2:4087340/1‑140 (MQ=255)

                                                                       gttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGa                                                                                                                                         <  2:2564769/69‑1 (MQ=255)

                                                                       gttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTggctccagtggctccagt                                                                                       <  1:1427258/119‑1 (MQ=255)

                                                                       gttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTggctccagtggctccagt                                                                                       >  2:1427258/1‑119 (MQ=255)

                                                                       gttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTc                                                                  >  1:3371858/1‑140 (MQ=255)

                                                                        ttgatcccgttgctcctgttgatcccgttgctcctgTCGCACCTGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTTGCTCCAGTTGCTCCAGTGGCTCCAGTTGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTcc                                                                 <  1:2810837/140‑1 (MQ=18)

                                                                        ttgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTcc                                                                 >  1:4257762/1‑140 (MQ=255)

                                                                         tgatcccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTccc                                                                >  1:2465168/1‑140 (MQ=255)

                                                                             cccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGt                                                            <  1:1935642/140‑1 (MQ=255)

                                                                             cccgttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGt                                                            <  2:1948032/140‑1 (MQ=255)

                                                                                 ttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTTGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCa                                                        <  2:3315543/140‑1 (MQ=255)

                                                                                 ttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCa                                                        <  1:2101804/140‑1 (MQ=255)

                                                                                 ttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCa                                                        <  2:692085/140‑1 (MQ=255)

                                                                                 ttgcTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCa                                                        <  1:3805235/140‑1 (MQ=255)

                                                                                  cgcTCCTCATGATCCCGCCGCACCCCGCGCTCCACCGGCTCCTGTTGCTCACGGAGTACCTGTTGCTACAGGAGCTCCAGTTCCACCCGTGTCTCCAGTGTCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCAc                                                       <  1:2227775/139‑1 (MQ=9)

                                                                                      ccTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTCCTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCCgt                                                   >  2:4372674/1‑140 (MQ=255)

                                                                                       cTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCa                                                                       <  2:821045/119‑1 (MQ=255)

                                                                                         gTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttga                                                >  1:539640/1‑140 (MQ=255)

                                                                                          ttGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCGTGTTGAACCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGATGCACCCGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCCGTTTCGCCGGTTGCAGCAgttgag                                               >  2:2231500/1‑139 (MQ=25)

                                                                                          ttGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTCCTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgat                                               >  2:1658980/1‑140 (MQ=255)

                                                                                               cccGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTTGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgt                                          >  2:2373997/1‑140 (MQ=255)

                                                                                               cccGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgt                                          >  2:696713/1‑140 (MQ=255)

                                                                                               cccGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCGGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCCGTGGCTCCAGTGGCGCCCGTTGCTCCCGTTGCGCCCGTTTCCCCGGGTGCACCGgttgggcgcgt                                          >  2:4697871/1‑133 (MQ=21)

                                                                                                  gTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCCGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgc                                       >  1:150867/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                   ttGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgct                                      >  1:2956415/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                    tGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctc                                     <  2:4257762/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                     gCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctcc                                    <  1:3546066/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                           gTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctcctgttga                              <  2:2754495/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   cgTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGCTCCTGTCGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctcctgttgatcccggtg                      <  1:4950481/139‑1 (MQ=255)

                                                                                                                    gatgatCCTGTTCATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTTGCTCCAGTGGCTCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctcctgttgatcccgttgc                     <  1:2551764/135‑1 (MQ=18)

                                                                                                                    gTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctcctgttgatcccgttgc                     >  1:3911635/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                     tGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctcctgttgatcccgttgct                    <  2:1598543/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                     tGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGATGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcgcgttgctcctgttgatcccgttgct                    >  1:3423546/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                       gCTCCTGTTGATCCCGGTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTGTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccgttgctcctgttgatcccgttgctcc                  >  2:4302887/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                         tCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGttgatcccgttgctcctgttgatcccgttgctcctg                >  1:706888/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                          ccTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTTGCTCCAGTTGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgaaccagttgctccagttgatcccgatgagccggt               >  2:3993504/1‑133 (MQ=18)

                                                                                                                          ccTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTTGCGCCAGTTGATCCAGTTACTCCAGTTGCGCCAGTTTCACCCGTTGCACCCgttgatccagttggtccacttgatccagttgaacattt               >  2:3993539/1‑133 (MQ=17)

                                                                                                                          ccTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCCGTTGCACCCGTtgatcccgttgctcctggtgatcccgttgctcctgt               >  2:3247571/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                            tGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAgttgatcccg                                           <  2:3491089/110‑1 (MQ=255)

                                                                                                                            tGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGatcccgttgctcctgttgatcccgttgctcctgttg             >  1:5055282/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                            tGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGatcccgttgctcctgtagatcccgttgctcctgttg             >  2:4775792/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                              gtGAGCCCGTTGGTCCTGTTGCACCTGTCGCTCCAGTTCCACCAGTGTCTCCAGTTGGTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGCTcccgttgctcctgttgatcccgttgctcctgttgat           <  1:3805280/139‑1 (MQ=14)

                                                                                                                                   cccGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTtgctcctgttgatcccgttgctcctgttgatcccgt      >  1:2667400/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                      gTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTCGc   >  2:3571991/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                      gTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTCGc   >  2:5090516/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                       ttGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTGGct  >  2:2122203/1‑139 (MQ=255)

                                                                                                                                       ttGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTCGCa  >  1:4871571/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                       ttGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTGGCTCCGGTTGATCCCGTCGCa  >  2:1799767/1‑140 (MQ=255)

TTACTCCCGTTACTCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCCGTCGCACCAGTGGCTCCTGTTGATCCCGTTGGACCTGTTGGTCCTGTAGCTCCAGTTGCACCAGTGGCTCCAGTGGCTCCAGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGATCCCGTCGCA  >  NZ_CP034943/2073221‑2073495

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 11 ≤` `ATCG/ATCG` `< 25 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`