Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP034943 | 485,075 | C→A | 7.4% | H453N (CAC→AAC) | kimA → | potassium transporter KimA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP034943 | 485,075 | 0 | C | A | 7.4% | 670.5 / 3.7 | 267 | H453N (CAC→AAC) | kimA | potassium transporter KimA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (94/139); new base A (31/2); total (125/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.53e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
ATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCAAAAATCGATTCAATACGCAAAATCA > NZ_CP034943/484940‑485206 | aTGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTa < 2:2634115/140‑1 (MQ=255) tGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTac > 2:2964629/1‑140 (MQ=255) tGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTac > 2:478288/1‑140 (MQ=255) tGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTac < 1:3616834/140‑1 (MQ=255) tGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTGATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTac < 2:2413863/140‑1 (MQ=255) gCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTaca < 2:1709901/140‑1 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc < 1:2548446/140‑1 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc < 1:2460865/140‑1 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc < 2:388536/140‑1 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc < 1:1936155/140‑1 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc > 2:332948/1‑140 (MQ=255) aTCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc > 2:2345350/1‑140 (MQ=255) aTCAACTACTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGc < 1:4137321/140‑1 (MQ=255) aaCTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGt < 2:1379996/140‑1 (MQ=255) cTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCg < 2:568233/140‑1 (MQ=255) cTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCg < 2:2673910/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTg > 2:4095754/1‑140 (MQ=255) gcggcgCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGaa < 1:928442/140‑1 (MQ=255) gcggcgCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGaa < 1:589649/140‑1 (MQ=255) gcggcgCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGaa < 2:2053957/140‑1 (MQ=255) gcggcgCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGaa < 2:3049472/140‑1 (MQ=255) gcggcgCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGaa < 1:1634487/140‑1 (MQ=255) gcggcgCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAAGGTTGTATGGCCGGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTTGTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACTAAACAGCTGTCGGTGaa > 1:209934/1‑140 (MQ=255) gcgcTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTAGGTGAACAg > 2:861122/1‑140 (MQ=255) gcgcTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATAACTACACAGCAGTCGGTGAACAg > 2:4053293/1‑140 (MQ=255) gcgcTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTGAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACACCTGTCGGGGAACAg > 2:2202957/1‑140 (MQ=255) cTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTTTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATAGTCGTGTTTCTTTTTTTTGCGATTTAAAATAACTAAAAACCTGTCGGTGAACATCtt > 1:3176618/1‑140 (MQ=255) tttGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTc < 2:905926/140‑1 (MQ=255) tttGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTc < 1:1094572/140‑1 (MQ=255) tCGTTTATGGTTCTGTCGAGCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGt < 2:2880280/140‑1 (MQ=255) cGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTa < 1:572580/140‑1 (MQ=255) cTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGcc > 2:3790169/1‑140 (MQ=255) cTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATAGTAGACAAAGAGcc > 1:4108487/1‑140 (MQ=255) tGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCa > 1:1027498/1‑140 (MQ=255) gTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCag < 1:843795/140‑1 (MQ=255) gATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCagaag < 1:1761415/140‑1 (MQ=255) ccTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTTGTGTTTTTTGGGATTAAAAATCACAAAACAACTGTCGGTGAACAGCTTCGCCTGGTAGAAAAAGAGCCcgacggaa > 1:3245049/1‑135 (MQ=255) ccTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTATACAAAGAGCCAGAAGaaa > 1:6439/1‑140 (MQ=255) ccTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAATATCCAGAAGaaa > 1:3128260/1‑140 (MQ=255) ccTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGaaa > 2:1927036/1‑140 (MQ=255) gtgACGAAGTTTTATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATTCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAgg < 1:2255125/140‑1 (MQ=255) gtgACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAgg < 1:2089987/140‑1 (MQ=255) gtgACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTAGCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAgg < 1:2942490/140‑1 (MQ=255) tgACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAGGGc < 1:1894853/140‑1 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tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAAAAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTTATTTTGCCt > 1:3062417/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACAACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTAGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAATGCACGGTTGTGATTGTGCCt > 1:1533617/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATAACTACACAGCTGTCGGTGAAAAGCTTCGCATCGTAGAAAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTTCCt > 1:3864635/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATAAAAGGCACGGTTGTTATTGTGCCt > 1:3377662/1‑140 (MQ=255) tATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTGTTTCTGTTTTTTGCGATTAAAAATAACTACACATCTGTAGGTGAAAAGCTTCGCATAGTAGACAAAAAGACAGAAGAAATAAAAGGAACGGTTTTGATTGTGCCt > 1:242834/1‑140 (MQ=255) tGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATAACTAAACAGCTGTCGGTGAAAAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTTTGATtctgtgtct > 2:41731/1‑135 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tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGgt < 1:1724835/140‑1 (MQ=255) tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGgt < 1:3762545/140‑1 (MQ=255) tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGgt < 2:3947954/140‑1 (MQ=255) tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGgt < 1:2944862/140‑1 (MQ=255) tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCCGTGAACAGCTTCGCATAGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCGGTAGCCGgt > 1:50979/1‑140 (MQ=255) tgtTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATAACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGgt > 1:4219700/1‑140 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tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTTAAAATAACTACACAGCTGTCGGGGAACAGCTTCGCATCGTAGACCAAGTGCCAGAAGAAATCAAACGCCCGGTTGTGATTGTTCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 1:1207244/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 1:2852403/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATAACAAAACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAAACAAACGCACCGTTGTGATTTTGCCTGTAGCCGGTGTTACTAAcg > 1:1395063/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCAGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 2:1138338/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTAAACAGCTGTCGGTGAACAGCGTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACcg > 1:2983404/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATAAATACACAGCTGTAGGTGAAAACCTTATCATCGTAGACAAATACCCAGAAGAAATAAAAGGCACGGATGTGAATGTGCCAGTAGCCGGTGTTAATACcg > 2:958892/1‑140 (MQ=255) tATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGAGATTAAAAAAAACAACACAGCGGGAGGTGAAAATATTCGCATCCGAGAAAAACAGCCAGAACAAATAAAAAGCAACGTTTTTATTGTGGCTGTAACCGGTGTTACTACcg > 1:2285729/1‑140 (MQ=255) aTCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCa < 1:4193908/140‑1 (MQ=255) aTCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCa < 1:4206528/140‑1 (MQ=255) aTCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTAACGTCGTGCa > 1:2879282/1‑140 (MQ=255) aTCGTCGTGTTGCTGTTTTTTTCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCCGTTAACAACATCGCATCGTAGACAAAGAGCCACAAGAAATCAAAAGCACCGTTGTGATTTTTCCAGTAGCCCGTGTTAAAACCCTCGTGCa > 1:1788500/1‑140 (MQ=255) tcgtcgTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAGGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCaa > 2:1049222/1‑140 (MQ=255) ttttCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTAAACCGCTGTCGGTGAAAAGCTTCGCATCGTAGACAAATAGGCAGAAGAAATAAAAGGCACCGTTTTGATTTTGCCTGTAGCCGGTGTTAATAACGTCGTGCAAAAATCGa > 1:770672/1‑140 (MQ=255) cGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCAAAAATCGATTCAATACGCaaaa > 2:3137019/1‑140 (MQ=255) aTTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCAAAAATCGATTCAATACGCAAAATc < 1:3410328/140‑1 (MQ=255) | ATGCTGATCAACTCCTGCGGCGCTTTGATTTCGTTTATGGTTCTGTCGATCCTGTTTGTGACGAAGTTTAATGTTGTATGGCCTGTGTTAATCTTTATGCCTATCGTCGTTTTGCTGTTTTTTGCGATTAAAAATCACTACACAGCTGTCGGTGAACAGCTTCGCATCGTAGACAAAGAGCCAGAAGAAATCAAAGGCACGGTTGTGATTGTGCCTGTAGCCGGTGTTACTACCGTCGTGCAAAAATCGATTCAATACGCAAAATCA > NZ_CP034943/484940‑485206 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |