| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 1,112,969 | C→T | 10.2% | L1022F (CTT→TTT) | addB → | helicase‑exonuclease AddAB subunit AddB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 1,112,969 | 0 | C | T | 10.2% | 871.3 / 65.6 | 297 | L1022F (CTT→TTT) | addB | helicase‑exonuclease AddAB subunit AddB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (158/104); new base T (16/14); total (178/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
TACGGACTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGTCAAATATCATCAATGCGGGCTTG > NZ_CP034943/1112831‑1113106 | cGGACTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTg < 2:772790/140‑1 (MQ=255) cGGACTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTg > 1:1314100/1‑140 (MQ=255) cGGACTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTg > 1:2132613/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGACTGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGc > 1:100944/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGc > 2:2345741/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGc > 2:653902/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGc > 1:2110326/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATGTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGc > 1:1540323/1‑140 (MQ=255) tGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCtt > 2:1185077/1‑140 (MQ=255) tGGCGCTGCAAATGCAGACGTACCTTGATTAATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATCAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATATCCAAATACATGACCCGATCATTCAATCTAAACTCACCCATGGGCta > 2:4162906/1‑139 (MQ=255) gcgcTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGa > 1:2997675/1‑140 (MQ=255) gCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGATTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACgaga < 1:590980/140‑1 (MQ=255) gCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACgaga < 2:4196769/140‑1 (MQ=255) tGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGaa > 1:4217369/1‑140 (MQ=255) gCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATATCACGCTAGGGCTTGACGAGATTGAAc > 2:1099054/1‑140 (MQ=255) gACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAgg < 1:2345741/140‑1 (MQ=255) cGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGgag > 1:3890718/1‑140 (MQ=255) cGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGgag > 2:1252554/1‑140 (MQ=255) ttcaTTTATAGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATTACGCCGACGCCGGCAGGAGTGATGTATATACATATACATCACCCGAAGATTCAAACTAATCTACCGCTTCCTATTTAAGAGATTAAACAGGAGAtaata > 2:3385701/4‑136 (MQ=255) aTTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAg > 1:2478971/1‑140 (MQ=255) ttATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGaa > 2:2777852/1‑140 (MQ=255) ttATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAAAAGGAGATCTTTAAGaa > 2:1796770/1‑140 (MQ=255) ttATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGAGCTGTATATCCATATACAAGACCCGAACATTCAATCTAATCTCCCGCTTGCGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTATAAGaa > 2:1062417/1‑140 (MQ=255) aTCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAAt > 1:787857/1‑140 (MQ=255) tCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAAtt > 1:449780/1‑140 (MQ=255) ttACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTaaa > 1:1937255/1‑140 (MQ=255) tACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTaaaa > 1:3069309/1‑140 (MQ=255) tCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGa < 2:3900209/140‑1 (MQ=255) tCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGa < 2:465248/140‑1 (MQ=255) tCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGa < 2:2997675/140‑1 (MQ=255) tCATTCAGCCGACTGGCTCGGAAGGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTCTTTCCATATAGATGACGCGATGATTCAATCTAATCTCCGGCTGGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGa < 1:3276689/140‑1 (MQ=255) aTTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTACAATGAAg > 1:81722/1‑140 (MQ=255) cAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGc < 1:2922629/140‑1 (MQ=255) gACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGct > 1:2818940/1‑140 (MQ=255) gACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAAACTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGct > 2:3365443/1‑140 (MQ=255) ggCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGctcctc > 1:2598457/1‑140 (MQ=255) ggCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGctcctc > 1:3435058/1‑140 (MQ=255) cTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCgg < 1:653902/140‑1 (MQ=255) cTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCgg < 2:2145176/140‑1 (MQ=255) cTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCgg < 1:3334270/140‑1 (MQ=255) tCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCGTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGc < 2:1001228/140‑1 (MQ=255) aaTGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATc > 1:3680358/1‑140 (MQ=255) gAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAgg < 2:514612/140‑1 (MQ=255) aGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAATGGCTTGCTCATCGGCGATCAgca > 2:3506097/1‑138 (MQ=255) aGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGa < 1:1162116/140‑1 (MQ=255) aGGGCCACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATTACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGACATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCATCGGCGATCAGGa > 2:370790/1‑140 (MQ=255) aCGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGt > 1:2203752/1‑140 (MQ=255) aCGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGt > 1:1586679/1‑140 (MQ=255) aCGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTAAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGTACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGt > 2:3547647/1‑140 (MQ=255) cAGTAGTGCTGTCTTTCCATATACATGACCCGATGATTCTATCTAATCTCCCGATTGGGCTTGACGAGATTGAACATGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCtt < 2:3134837/140‑1 (MQ=255) cAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCtt < 1:2777852/140‑1 (MQ=255) cAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAACGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCtt < 1:3923207/140‑1 (MQ=255) ggAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTAt < 2:3730151/140‑1 (MQ=255) ggAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTAt < 2:2079975/140‑1 (MQ=255) tGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGAt > 2:737434/1‑140 (MQ=255) tGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAAATTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCTATCAGGAAGAGGTTCGCCTTATCGaa > 2:2949677/1‑139 (MQ=255) cTGTATTTCCATATACATGACCCTATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGAAGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATAc < 1:3236526/140‑1 (MQ=255) cTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATAc < 2:702234/140‑1 (MQ=255) cTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATAc < 1:501932/140‑1 (MQ=255) cTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATAc > 2:2113711/1‑140 (MQ=255) tGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACg > 2:1479564/1‑140 (MQ=255) gTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGa < 1:3738201/140‑1 (MQ=255) gTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGa < 2:1754039/140‑1 (MQ=255) gTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGa < 2:3635214/140‑1 (MQ=255) gTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGa < 1:1692625/140‑1 (MQ=255) gTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGa < 2:3246915/140‑1 (MQ=255) gTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGa < 2:810376/140‑1 (MQ=255) tttCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATGCGAccc > 1:3573725/1‑140 (MQ=255) tttCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGAccc > 1:2859014/1‑140 (MQ=255) ccATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAATCGGTTCGCATTATGGATACGACCCTTc > 2:3280626/1‑140 (MQ=255) ccATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTc > 2:3865484/1‑140 (MQ=255) tataCATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCTGTTAGAATTATGGATAAGACCCTTCAag > 2:1954430/1‑140 (MQ=255) tataCATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATTAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGATCGCATTATCGATACGACCCTACAag > 2:964141/1‑140 (MQ=255) tataCATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAag > 1:87481/1‑140 (MQ=255) tataCATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAag > 2:1646777/1‑140 (MQ=255) tataCATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCACGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATATAAAATGAAGCCCTACCACCTCGGCCATCAGGAAGCGCTTCTCATAATGTATACGACCCTTCAag > 2:2442885/1‑140 (MQ=255) cATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATAc > 1:4155504/1‑125 (MQ=255) aTGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGa < 2:3066763/140‑1 (MQ=255) aTGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGa < 2:2506513/140‑1 (MQ=255) aTGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGa < 2:3522841/140‑1 (MQ=255) aTGACCCGATGATTCAATCTAATCTACCGCTTTGGCTTGACTAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAACGGCTTGCTCCTCGGCGATAAGGAAGCGGTTAGACATATTGATACTAAAATTCAAgagaga > 2:2306670/1‑140 (MQ=255) tGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGAc < 2:1391176/140‑1 (MQ=255) gACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACg > 1:108208/1‑140 (MQ=255) gACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACg > 1:2680197/1‑140 (MQ=255) gACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACg > 1:1792271/1‑140 (MQ=255) gACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACg > 1:1742019/1‑140 (MQ=255) gACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACg > 1:1183027/1‑140 (MQ=255) cccGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGt > 2:1675390/1‑140 (MQ=255) cccGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGATCCTCGGCGAACAGGAAGAGGTTCGCCTTATGGATACGACCATACAAGAGGGACgga > 2:2574769/1‑139 (MQ=255) ccGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATCAAGGGCTTGCACCTCGGCGATCAGGAAGCGGTACTCCTTATGGATAAGAACCTTCAAGAGTGACGGTc > 2:3962432/1‑140 (MQ=255) gatgatTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATTGATAAGACAATTAAAGAGGGACGGTCaa > 2:2874131/1‑140 (MQ=255) gatgatTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGACTTATGGATACGACCATTCAAGATGGACGGACaa > 2:1703960/1‑140 (MQ=255) atgatTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGaa < 1:143072/96‑1 (MQ=255) atgatTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGt < 1:982184/136‑1 (MQ=255) tgatTCAATCTAATCTCCCGTTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGTCAAat > 1:83648/1‑140 (MQ=255) cAATATAATCTCCCGCTTGGTCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGTCAAATatcat < 1:76744/140‑1 (MQ=255) ctcCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGTCAAATATCATCAATGCggg < 2:2598457/140‑1 (MQ=255) cGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGTCAAATATCATCAATGCGGGCTTg > 1:1229542/1‑140 (MQ=255) cGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGTCAAATATCATCAAAGCGGGCTTg > 2:4100349/1‑140 (MQ=255) cGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTACAAGAGGGACGGTCAAATATCATCAATGCGGGCTTg > 2:4266669/1‑140 (MQ=255) | TACGGACTGGCGCTGCAAATGCTGACGTACCTTGATTTATCGATTACTCATTCAGCCGACTGGCTCGGAATGAGGGCGACGCCGGCAGGAGTGCTGTATTTCCATATACATGACCCGATGATTCAATCTAATCTCCCGCTTGGGCTTGACGAGATTGAACAGGAGATCTTTAAGAAATTTAAAATGAAGGGCTTGCTCCTCGGCGATCAGGAAGCGGTTCGCCTTATGGATACGACCCTTCAAGAGGGACGGTCAAATATCATCAATGCGGGCTTG > NZ_CP034943/1112831‑1113106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |