| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 2,649,964 | C→A | 6.0% | intergenic (‑199/‑75) | EO946_RS13710 ← / → EO946_RS13715 | hypothetical protein/alanine:cation symporter family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 2,649,964 | 0 | C | A | 6.0% | 618.9 / 2.5 | 225 | intergenic (‑199/‑75) | EO946_RS13710/EO946_RS13715 | hypothetical protein/alanine:cation symporter family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (89/111); new base A (22/2); total (112/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.21e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TTTAAGGAAATGTAAAGATAGTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTACCCCCGTCATTTATATTTTA > NZ_CP034943/2649828‑2650101 | tttAAGGAAATGTAAAGATAGTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGAt < 2:1294990/140‑1 (MQ=255) aTGTAAAGATAGTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAAt > 2:554836/1‑140 (MQ=255) aTAGTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTGTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAAGCGATTGGAGACATAGGTCGAt > 2:2188674/1‑140 (MQ=255) tAGTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGAtt < 1:3004404/140‑1 (MQ=255) gTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTACTTCCTGTTGTTATTTTTAATTAACGGTCATATAATTTTACAAATAGATTTTAGAAATAGTTAGAtttt > 1:631452/1‑138 (MQ=255) gTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTGTTTTCTTTTTTCCTTGGGCTTCTTGTTTATAATTAACGGTCATATAATTTGACAAATAGAGTGTTGAAATATTTGGATTat > 1:3212025/1‑139 (MQ=255) gTATAAACCTCATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTATTTTTTACATCCTCTTCGTTTTGATAATTAACCGTCATATAATTTGAAAAATAGATTGTAGAAATAGTTCGATTAg > 1:4248584/1‑140 (MQ=255) tataAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGTTAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGc > 2:612120/1‑140 (MQ=255) tataAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGAAAATTACCGGTCATATAATGTGAGAAATCGATTGTATAAAAAGTTCGATTAGc > 2:3025496/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTCCGTGCTCTTCTGAGTGTTAATTACCGGTCATATTATGTGTCAAATCGGTTGGAGAAATAGTGCGGTTAGCCCAAAATCCt > 1:2021559/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTACTTCCTCTTCTTATTGATAATTAACGGTCATATAATGTGACAAATAGATTTTAGAAATAGTTCGATTATCCCAAAATACt > 1:1649953/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTACTTCCTCTTCTTATTGATAATTAACGGTCATATAATGTGACAAAAAGATTGTAGAAATATTTCGATTATCCCaaaaaact > 1:4104618/1‑136 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTACTTCCTCTTCTTATTGATAAATACCGGTCATATAATGTGACAAAACGATTTTAGAAATAGTTCGATTATCCCAAAATCCt > 1:3947571/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTGTTATTGATAAATAACGGTCATATAATGTGAAAAATACATTTTATAAATAGTTAGATTAGCCCaaaaaaca > 1:1893775/1‑136 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCCTATAATGTGACAAAACGAGTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATccg > 1:1540594/1‑139 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCt > 2:2461236/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCt > 2:1650198/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCt > 2:4067619/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCt > 2:720188/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCt > 2:739146/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCt > 2:2135687/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAAGGTTACAAATCCATTGTAGAAATATTTCGATTATCCCAAAATGCt > 1:4043579/1‑140 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTACTTCCTCTTGTTATTGATAATTAACGGTCATATAAATTGACAAATAGATTGTAGAAATAGTTCGATTATCCCAAAATccg > 1:1850389/1‑139 (MQ=255) atatGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTACTTCCTCTTCGTATTGATAAATAACGGTAATATAATGTTACAAATAGATTGTAGAAATATTTAGTTTATCCCAAAATCCt > 1:2504645/1‑140 (MQ=255) aggtggtgAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCttt < 1:1602288/138‑1 (MQ=255) tggtgAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTta > 2:2278817/1‑140 (MQ=255) gtgAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTGCTTACTGTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTTACAAAAAGATTTTAGAAATATTTCGATTAGCCCAAAATACTTTTtata > 1:3889866/1‑140 (MQ=255) gtgAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTCCTTCCGCTTCTTATTTTTAATTAACGGTCAGATAATGTGACAAATCGATTGTATAAATATTTCGATTAGCCCAAAATACTTTTtata > 1:3550635/1‑140 (MQ=255) gtgAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTGTTTTTTACTTGCGCTTGTTATTGTTAATTAACGGTCATATAATTTGACAAATAGATTTTAGAAATAGTTCGATTATCCCAAAATGCTTTTtata > 1:3606585/1‑140 (MQ=255) gtgAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTACTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATAAAATGTGACAAATCGATTGTATAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATACTTTTtata > 2:1146369/1‑140 (MQ=255) tAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTACGCTTCTTATTGGTAATTTCCGGTCATATAATGTGTCAAATCGATTGTTGTAATAGTTCGATTTGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTAtt > 1:2062840/1‑140 (MQ=255) caacGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCGGGTATTATGGGTAAATAACGGTGCTATAATTTGTCAAAAACATTGTTTAAATAGTTCGATTAGCCCCAAAACCTATTTATACATGTATTCGaaa > 1:2744007/1‑140 (MQ=255) aacGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAAt < 2:26910/140‑1 (MQ=255) aacGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAAt < 2:145429/140‑1 (MQ=255) cGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTGTTTTGTTTTTTGCTTGCGCGTCTTATTGTTAATTACCGGTGATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTGGATTATCCCAAAATCCTTTTTTTACATGTATTGGAAATGa > 1:709015/1‑140 (MQ=255) aGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGt < 1:952915/140‑1 (MQ=255) cGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTATTTTTTGCTTCCGGTTGGTTTTGATGAATACCGGGCATATAATGTGACAAAAAGATTGTATAAATAGTTCGCTTATCCCAAAATAGATTTTATACAGGTGTTCGACATGCAGTgt > 1:3194221/1‑139 (MQ=255) aTCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTTACAAAACGAGTGTAGAAATAGGGCGATTATCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTAGAAATGAAGTgaggcg > 1:963838/1‑138 (MQ=255) tCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATGGATTGTAGTAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCGTTTTTATAGCTGTATTGGAAAGGAAGTGaggcgg > 2:2810306/1‑140 (MQ=255) cAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAggagga < 2:2306267/140‑1 (MQ=255) cAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAggagga < 2:483052/140‑1 (MQ=255) aCGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTGTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCt > 2:152773/1‑140 (MQ=255) aCGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGAAAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCt > 2:1706501/1‑140 (MQ=255) aCGCGGCGTTTTTTCTTTTTTACTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAAAAGATTGTAGAAAAAGTTAGATTATACCAAAATCCTTTTTATACAAGTATTAGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCt > 2:1792540/1‑140 (MQ=255) aCGCGGCGTGTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATAAATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCt > 2:3720673/1‑140 (MQ=255) ttccttccTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGc < 1:557788/140‑1 (MQ=255) cttcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTaaa < 1:385263/140‑1 (MQ=255) tcttATTTATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 2:659855/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 2:1987275/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 2:1893775/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 2:2842221/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 2:1761563/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 2:219665/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:739146/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:1105384/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:1134895/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:1572531/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:1710806/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:2135687/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:2185320/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:2419054/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:2461236/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:2816529/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:3530456/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:4067619/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:934439/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTAGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:519946/140‑1 (MQ=255) tcttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGAGTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:276481/140‑1 (MQ=255) tctgaatGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGAGTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCGTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:3466720/134‑1 (MQ=255) tctgATTGATAATTACCGGTCAGATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:731229/140‑1 (MQ=255) tcgtATTGATAATGACCGGCCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg < 1:2259929/137‑1 (MQ=255) tattATTGATAATTACCGGTCATATAATTTGACAAATAGATTGTAGAAATAGTTCGATTATCCCTAAATCCTTTTTTTACATGTATTATAAATGTAGTTAGGAGGAAGGTTTATTTTAGATTTTGTTGATAGttttatag < 2:882185/138‑6 (MQ=255) cttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgc < 1:3346436/140‑1 (MQ=255) cttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgc < 1:3477889/140‑1 (MQ=255) cttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgc < 1:818198/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 1:4121605/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 2:4248584/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 2:4104618/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 1:2876622/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 2:2504645/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATGGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 2:1864171/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTCAGATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 1:2222791/140‑1 (MQ=255) ttATTGATAATTACCGGTAATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 2:2903695/140‑1 (MQ=255) ctATTGATAATTACCGGTCATCTAATGTGACAACTCGATGGGAGAAATAGTTCGATTAGCCCACAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcgcg < 1:3576126/139‑1 (MQ=255) aTTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGt > 1:1007194/1‑140 (MQ=255) aTTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCGAGTTTACACGCGGt > 2:3113887/1‑140 (MQ=255) aTTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATAAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCTAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGt > 2:3908029/1‑140 (MQ=255) gATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAACTAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCtt > 2:3152250/1‑140 (MQ=255) aTAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGc > 2:2172265/1‑121 (MQ=255) aTAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGc < 1:2172265/121‑1 (MQ=255) gTCATATAATGTGACAACTCGATTGTAGAAATAGTTCGATTATCCCAAAATCCTATTTATACATGTATTCGAAAGGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACCCGGTCTAATGTCGTAccc > 1:3770850/1‑140 (MQ=255) gTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTAccc > 2:3685964/1‑140 (MQ=255) gTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTAccc > 2:3551372/1‑140 (MQ=255) cATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTAccccc > 1:2335817/1‑140 (MQ=255) ataATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTACCCCCGTc > 2:441124/1‑140 (MQ=255) tgACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAAcg > 1:1767858/1‑111 (MQ=255) tgACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTACCCCCGTCATTtat > 2:422092/1‑140 (MQ=255) tgACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTACCCCCGTCATTtat > 2:601469/1‑140 (MQ=255) tgACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTACCCCCGTCATTtat > 2:3417105/1‑140 (MQ=255) tgACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTACCCCCGTCATTtat > 1:140228/1‑140 (MQ=255) | TTTAAGGAAATGTAAAGATAGTATAAACCTGATATGTGGTGAAATTTAGAACAACGCAGCGTAATCAATACGCGGCGTTTTTTCTTTTTTCCTTCCTCTTCTTATTGATAATTACCGGTCATATAATGTGACAAATCGATTGTAGAAATAGTTCGATTAGCCCAAAATCCTTTTTATACATGTATTCGAAATGAAGTGAGGAGGAAGCTTGATGGCAGATTTTGTTGCTAGTTTAAACGCGGTCTTATGGAGTACCCCCGTCATTTATATTTTA > NZ_CP034943/2649828‑2650101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |