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1:6458284/1‑140 (MQ=21) cgccgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCAt > 1:417282/1‑129 (MQ=255) cgccgcTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGa > 1:1643338/1‑140 (MQ=255) cTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTc > 1:5245080/1‑140 (MQ=255) cTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGACGCCGCCGAAGACAGGCACAGCGCCGCCCCCAATGCCAGACCATGGGTAACCAGCTGGATAACGatatac > 1:806215/1‑138 (MQ=21) tACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCg < 2:5245080/140‑1 (MQ=255) tACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCg < 2:6106899/140‑1 (MQ=255) ccccAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCg < 1:199662/138‑1 (MQ=255) aTGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTc < 2:500856/140‑1 (MQ=255) tGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCa > 2:6804656/1‑140 (MQ=255) gccaggGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAg > 2:7679540‑M1/7‑140 (MQ=255) ggCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGcgccgccgc > 1:6779189/1‑87 (MQ=255) ggCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCa > 1:2677982/1‑140 (MQ=255) ggCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCa > 2:5433733/1‑140 (MQ=255) gcccccgccgcctAAGCCCGGCACACCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGACCCGCCGCCGAAGCCAGCCACAGCGACCCCGCCAATCACACACCATCCCTAACCAACACCAAAACGATATTAGTATTCAAAAGCATGcc > 2:4595063/1‑140 (MQ=255) GCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCCCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATAGTCGTATTCAAAAGCAGGcc < 2:5553749‑M1/140‑1 (MQ=255) | GGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATACCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGAAGCCAG‑GCACAGCGCCGCTACCAATGCCAGGGCCGCCGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGGGCCGGAGCCGCCGCCGAAGCCAGGCACAGCGCCGCCGCCAATGCCAGACCATGGGTAACCATCTGGATAACGATATTCGTATTCAAAAGCAGGCC > NZ_CP034943/767638‑767915 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |