| Predicted mutation | |||||||
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| MC JC | NZ_CP034943 | 3,191,671 | (ATTATAATT)2→1 | 100% | intergenic (+3/‑66) | EO946_RS16520 → / → mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NZ_CP034943 | 3191671 | 3191679 | 9 | 254 [0] | [0] 252 | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_CP034943 | = 3191670 | 0 (0.000) | 215 (0.510) | 63/232 | NT | 100% | intergenic (+2/‑75) | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA |
| ? | NZ_CP034943 | 3191680 = | 0 (0.000) | intergenic (+12/‑65) | EO946_RS16520/mrgA | oxidoreductase/metalloregulation DNA‑binding stress protein MgrA | |||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
AAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTATTATAATTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTC > NZ_CP034943/3191546‑3191819 | cagcacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTAt < 1:5569534‑M2/6‑1 (MQ=255) agcacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcttgggaatctatcctgaacaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTAtt > 2:2921092‑M2/134‑140 (MQ=255) agcacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTattatt > 2:3982287‑M2/134‑140 (MQ=255) agcacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTAtt > 2:5689516‑M2/134‑140 (MQ=255) cacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATtgt > 1:3443955‑M2/132‑139 (MQ=255) cacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGa > 2:3357972‑M2/132‑140 (MQ=255) cacgtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgagcgctttttacttggtctgcgtgggaatctatcctgtagaaacaactattcagttcatctaaagtataatgTAGTATAGa > 1:5484069‑M2/132‑140 (MQ=255) gtaaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGAttt < 1:1991585‑M2/12‑1 (MQ=255) aaagaaattgcgatacccgatcggaacaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgcttgttccttggtctgcgtgggactctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctcaattataattTAGTATTGAttttt > 1:2664016‑M2/127‑140 (MQ=255) aaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTTGTATTGAttttt > 1:1384956‑M2/127‑140 (MQ=255) aaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGAttttt < 2:2084167‑M2/14‑1 (MQ=255) aaagaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGAttttt < 2:2495423‑M2/14‑1 (MQ=255) gaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTttaat < 2:752377‑M2/17‑1 (MQ=255) gaaattgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTttaat > 2:3721568‑M2/124‑140 (MQ=255) tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa < 2:491130‑M2/22‑1 (MQ=255) tgcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATa > 1:5951232‑M2/119‑140 (MQ=255) tcgatacccgagcggaacaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATAc < 2:4319973‑M2/23‑1 (MQ=255) gcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATAc < 2:3579671‑M2/23‑1 (MQ=255) gcgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATAc < 2:7326671‑M2/23‑1 (MQ=255) cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg < 2:6091504‑M2/24‑1 (MQ=255) cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg < 1:700169‑M2/24‑1 (MQ=255) cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg < 1:6121989‑M2/24‑1 (MQ=255) cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttagtccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg < 1:4119335‑M2/24‑1 (MQ=255) cgatacccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttagtccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACg < 2:2126874‑M2/24‑1 (MQ=255) tacccgagcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTgg < 2:2642185‑M2/27‑1 (MQ=255) acccgatcggaaaaggcatcaagcttaccttgttattccgatcgctttttccttggtctgcgtgggaatctatcctgaagaaaaaactattcagttcatctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGt < 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2:2993006‑M2/14‑140 (MQ=255) ctaaattataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAAtt > 1:6749891‑M2/14‑140 (MQ=255) tataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCaaa < 1:7684753‑M2/133‑1 (MQ=255) tataattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCaaa < 1:2744905‑M2/133‑1 (MQ=255) taattTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACt > 2:6264750‑M2/6‑140 (MQ=255) ttTAGTATTGATTTTTAATTAATACTTGTTATAATTAAATTAACAGATCAAAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATTCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGt < 2:5387517‑M2/138‑1 (MQ=255) 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2:649117‑M2/138‑1 (MQ=255) tAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTc < 1:5390855/140‑1 (MQ=255) | AAGAAATTGCGATACCCGATCGGAAAAGGCATCAAGCTTACCTTGTTATTCCGATCGCTTTTTCCTTGGTCTGCGTGGGAATCTATCCTGAAGAAAAAACTATTCAGTTCATCTAAATTATAATTATTATAATTTAGTATTGATTTTTAATTAATACGTGGTATAATTAAATTAACAGATCACAAGGAGGACGTAACTTATGAAAACTGAAAATGCAAAAACAAATCAAACATTAGTTGAGAATTCAATGAACACACAATTATCAAACTGGTTC > NZ_CP034943/3191546‑3191819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |