| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP034943 | 3,496,440 | G→T | 6.1% | Q330K (CAA→AAA) | EO946_RS17995 ← | glucosaminidase domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP034943 | 3,496,440 | 0 | G | T | 6.1% | 1451.8 / 22.9 | 503 | Q330K (CAA→AAA) | EO946_RS17995 | glucosaminidase domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (103/356); new base T (42/2); total (145/358) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.35e-23 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 503 total aligned reads displayed.
AGGCTGCGGCTTTGTTTGCTTGCTGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCTTTGAAATA > NZ_CP034943/3496302‑3496578 | agGCTGCGGCTTTGTTTGCTTGCTGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGc < 2:853373/140‑1 (MQ=255) tGCGGCTTTGTTTGCTTGCTGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGGCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGGTGGGTGACGTGTAATGCCATTTTTTGTTTTTAAAGAAATTGGCTATGTTTTGCGgct > 1:5554162/1‑140 (MQ=255) tttgtttgCTTGCTGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGtt < 1:6753908/140‑1 (MQ=255) ttggtgtgcttgctGCTCGCCTAAAATCGGCGCCGTCGTTATTGGAGAGGCTGTAGCCATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGtt < 2:6709782/134‑1 (MQ=255) gcttgctGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACTTGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTaa < 1:2282003/140‑1 (MQ=255) gcttgctGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTaa < 2:5585797/140‑1 (MQ=255) gcttgctGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTaa < 2:205330/140‑1 (MQ=255) gcttgctGCTCGCATAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTaa < 1:4566336/140‑1 (MQ=255) ttgctGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGt > 2:5804917/1‑130 (MQ=255) ttgctGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAAcc < 2:2552494/140‑1 (MQ=255) ttgctGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAAcc < 2:6002623/140‑1 (MQ=255) gctgctCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTTTAGACATGGTCGATTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAAcccc < 2:4231479/140‑1 (MQ=255) tgctCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCtt < 2:6205643/140‑1 (MQ=255) gctCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTGTTTTTGATGCAGGCTGACATGTAATGCCATTTTTTAATTTTAAAAAAATTTTGGATATTTTGAAACAGCTGTTTAGTTAAcaccata > 2:3201001/1‑137 (MQ=255) cGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCata < 2:7202471/140‑1 (MQ=255) cGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCata < 2:7326369/140‑1 (MQ=255) ccTAAAATCTGCGGCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATAtt < 1:5653030/140‑1 (MQ=255) ccTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATAtt < 1:2862924/140‑1 (MQ=255) ccTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATAtt < 1:1991805/140‑1 (MQ=255) acTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATAtt < 2:4350513/139‑1 (MQ=255) cTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTCGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTc < 1:3475731/140‑1 (MQ=255) cTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTc < 1:7337553/140‑1 (MQ=255) cTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTc < 1:2009622/140‑1 (MQ=255) tAATATGTGCGGCTTCGTTATTGTATAGGGGGTTGTCATTGTCTTTTTTTTGATGCTGGATTACGTGTAATGAAATATTTTCTTGTTAATTAAAGTGTATATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCTTTAACCCATTCATATTCa < 2:5399565/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGCTAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 2:6454426/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 1:3384686/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 2:3100776/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 1:1050633/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 2:7065558/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 1:5248913/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 1:1674735/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGGTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 1:6221217/140‑1 (MQ=255) tAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGACATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCa < 1:5086198/140‑1 (MQ=255) aacaTCTGCGCCCTCCTTATGGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTGTTTGCTCCTGGATGACGTGTAACGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGGGTCTATCTTTTGCAGCTGCAGGATCGTTAACCCCTACATATTCAc < 2:82513/137‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGTATAGGCTGTAGAGATGGTCGTTTTTTTGATGCCGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 2:1523852/140‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTTGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 1:2759946/140‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 2:468878/140‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 1:4981397/140‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 1:1447000/140‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 1:2456606/140‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTATATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 2:1904062/140‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCGCCGTCGTTATTGGAGAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTCAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCTGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCAc < 2:6579515/140‑1 (MQ=255) tGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATTCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAATAAATTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAAACCCTTCATAATCAAAGtata > 2:3706928/1‑140 (MQ=255) cgcCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATatg < 1:5785995/140‑1 (MQ=255) cgcCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATatg < 1:5919746/140‑1 (MQ=255) cgcCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATatg < 1:3039492/140‑1 (MQ=255) cgcCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATatg < 2:2718132/140‑1 (MQ=255) ccGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCCCTGTATatgat < 2:1702053/140‑1 (MQ=255) ccGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATatgat < 2:6907937/140‑1 (MQ=255) ccGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATatgat < 2:238292/140‑1 (MQ=255) gATAGGCTGGAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCa < 1:2609969/140‑1 (MQ=255) tAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTTATGCTGGATTAAGTGTAATGCCAATTTTTGTTTTTAAAAAAATTTTGGAAGATTTTCAGCTGCTGTTTCGTTAAACCCATAAAATTAAATTTATATGATGTGGATTTTTCAAc > 2:7490888/1‑140 (MQ=255) tAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAAc < 1:3949836/140‑1 (MQ=255) tAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAAc < 1:1900433/140‑1 (MQ=255) aGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATTCTGGGTGTCGTGGAATGCCATTTTTTATTTTTAAAGAACGTGTCTTTCTTTTGCAGCTGCTGTTTGGTTAAACCCATAATATTGACAGTATATGATGTGGTTTTTTCaaac > 2:2178841/1‑138 (MQ=255) tGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGGGGGATTACGTGTAATTCCATTTTTTGTTTTTAAAGAAAGTGGGTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCGTCATATTCACAGTAAATTATTTTGTTTTGTAAACCttgt > 2:1818862/1‑137 (MQ=255) aGACATGGTCGTTTTTTTGTTGCTGGATGACGTGTAATGCCCTTTTTTCTTTTTAAAGAAACTGTCGATCTTTTGGAGCTGCTGTTTGGTTAAACCCATAATATTAACTGTATATGATGTTGTTTTTTAAAACTGTTGAt > 2:1983559/1‑140 (MQ=255) aGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGTCGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTTCATCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTGACTGTATATGATTTTCTTTTTTCAACCTGTTGAt > 2:4847174/1‑140 (MQ=255) aGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGAt < 2:1372430/140‑1 (MQ=255) aGACATGGTCGTTTTTTTGATGCGGGATGACGTGTAATGGCATTTTTTGTTTTTAAATAAAGTGTCTATCGTTTGCAGCTGCTGTTTGGTTAACCCCTTCATATTGACTGTATATGATCTGGTTTTTTAAACCTGTTGAt > 2:4045982/1‑140 (MQ=255) aTGGTAGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACt < 1:3201001/140‑1 (MQ=255) ggTCGTTTTTTTTTTGCTGGATGACGTGTAATTCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTGTATCTTTTTGAGCTGCTGTTTGGTTAAACCCTTAATATTGAATGTATATGATTTGGTTTTTTAAAACTGTTGATAACTGc > 2:699969/1‑140 (MQ=255) ggTCGTTTTTTTGTTGGAGGCTGACGTGTAATTCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTGTATGGTTTTCAGGGTGAGTTTCGTTTAGCCCGTAATATTCACTGTATATTCTGTGCGTTTTTAAACCGGGTGAttaaggc > 2:5525497/1‑134 (MQ=255) ggTCGTTTTTTTGATGGTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTGTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTTCAGCGGCTGTTTGGTTAACACCTACATATTCACTCTATATTATTTGCTTTTTTCAACCTTTTGATAACTGc > 2:2908695/1‑140 (MQ=255) ggTCGTGTTTTTTTTGCTGGATGACGTGTAATGCCCATTTTTGTTTTTAAAGAAATTGTGTAAGTTTTTCAGCTTCTGTTTCGTTAACCCCATAATATTAACGGTAAATTATTTGGTTTTTTAAACCTGGTGTTAACAGc > 2:3941338/1‑140 (MQ=255) gTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGcc < 1:1834545/140‑1 (MQ=255) tttGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGc < 1:5177468/140‑1 (MQ=255) tGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTg < 2:1252270/140‑1 (MQ=255) cGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGa > 2:1126509/1‑140 (MQ=255) tgtAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGc < 2:3530333/129‑1 (MQ=255) ccATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGa > 2:520203/1‑140 (MQ=255) ccATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGa < 1:1536883/140‑1 (MQ=255) cATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGAt > 2:5614083/1‑140 (MQ=255) aTTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATg < 1:882417/140‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATg < 2:2984527/140‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATg < 2:500319/140‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATg < 2:7717349/140‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATAGTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATg < 1:469910/140‑1 (MQ=255) ttttttCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATgg > 2:2830506/1‑140 (MQ=255) cTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCt < 1:1183710/140‑1 (MQ=255) cTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCt < 1:6639384/140‑1 (MQ=255) tttAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCa < 1:4847174/140‑1 (MQ=255) tttAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCa < 1:7490888/140‑1 (MQ=255) tttAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCa < 1:4128063/140‑1 (MQ=255) tttAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCa < 1:5377704/140‑1 (MQ=255) tAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACt < 2:1595223/140‑1 (MQ=255) tAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACt < 1:7098610/140‑1 (MQ=255) tAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACt < 1:2158805/140‑1 (MQ=255) gtgtCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAg < 2:6123340/140‑1 (MQ=255) tgtCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGc > 2:585868/1‑140 (MQ=255) gtCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGcc > 1:3599012/1‑140 (MQ=255) gtCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGcc > 1:6940813/1‑140 (MQ=255) cTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCt < 2:3864085/140‑1 (MQ=255) cTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACATGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCt < 2:275887/140‑1 (MQ=255) tataTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAAAAAAAAAATAAAAAATTTATATGATTTGATTTTGTCAACCTGTTGATAAATGCCTGATACTCCGGTGCTTTTCTTGATTTTTCTGATTTCGTACTTCACTGTATTAAgacatt > 2:6374598/1‑135 (MQ=255) aTCTTTTGCAGCGGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCttt > 2:7664672/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATTTGCTTTTGTCAACATGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCTTTGAAAt > 1:6521598/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCTTTGAAAt > 1:4419360/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTGGATTTGGCTGATTGCGTCCTTCACTGTATTCAGCGCTTTGAAAt > 1:7720222/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTACATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGTTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCTTTGaaaa > 2:3396149/1‑139 (MQ=255) | AGGCTGCGGCTTTGTTTGCTTGCTGCTCGCCTAAAATCTGCGCCGTCGTTATTGGATAGGCTGTAGACATGGTCGTTTTTTTGATGCTGGATGACGTGTAATGCCATTTTTTCTTTTTAAAGAAAGTGTCTATCTTTTGCAGCTGCTGTTTCGTTAACCCCTTCATATTCACTGTATATGATGTGCTTTTGTCAACCTGTTGATAACTGCCTGATACGCCGGTGCTTTTCTTGATTTGGCTGATGGCGTCCTTCACTGTATTCAGCCCTTTGAAATA > NZ_CP034943/3496302‑3496578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |